. Marc Márquez va obtenir el seu tercer títol de MotoGP després de la seva cinquena victòria de la temporada al , la qual li va donar un avantatge decisiu per sobre dels seus rivals Jorge Lorenzo i Valentino Rossi -que va caure a Motegi- a manca de tres curses. El títol de Márquez va marcar el retorn al capdavant del la classificació d'Honda després d'una difícil campanya el . Márquez va guanyar el campionat amb 49 punts d'avantatge sobre el segon, Valentino Rossi.
Pel que fa a Moto2, Johann Zarco va aconseguir-hi aquell any el seu segon títol consecutiu (una fita que no ha aconseguit ningú més en aquesta categoria), en una temporada marcada per la tràgica mort als entrenaments del del mallorquí Lluís Salom. A Moto3, Brad Binder esdevingué el primer sud-africà a guanyar un mundial de motociclisme des del de Jon Ekerold el .
El campionat de MotoGP miniatura|esquerra|Marc Márquez celebrant el títol a Motegi Marc Márquez va guanyar el títol de la categoria reina per tercera vegada després que la seva cinquena victòria de la temporada, al Gran Premi del Japó, li donés un avantatge inexpugnable sobre els seus rivals per al títol Jorge Lorenzo i Valentino Rossi –que van caure tots dos– a tres curses del final. El títol de Márquez va marcar el retorn al primer esglaó del podi per a Honda després d'una difícil campanya per al seu equip de fàbrica el 2015. Márquez va guanyar finalment el campionat del 2016 amb 49 punts d'avantatge sobre el subcampió, Rossi.
El campió vigent, Lorenzo, va guanyar tres de les primeres sis curses i va encapçalar la classificació provisional, però els seus mals resultats en pista mullada a mitjan temporada van minvar les seves opcions al títol, a més de no haver tornat a guanyar tampoc en pista seca fins a la cursa de final de temporada a Xest. Rossi va ser l'aspirant al títol més consistent, tot i que va caure en tres curses abans de la victòria decisiva de Márquez al Japó. L'equip de va passar una llarga etapa sense victòries des del juny i va estar vuit curses sense guanyar abans que Márquez es proclamés campió. L'etapa de sequera va arribar a ser de deu curses abans de la victòria a Xest de Lorenzo, en la que fou la seva última cursa per al fabricant japonès abans del seu traspàs a Ducati el 2017. Rossi va ser subcampió amb 16 punts per davant de Lorenzo. Amb les actuacions d'ambdós, Yamaha va guanyar el campionat d'equips, tot i que Honda va guanyar el de constructors. L'únic debutant d'aquella temporada a MotoGP va ser Tito Rabat, que fou nominat doncs debutant de l'any. El pilot de LCR Honda, Cal Crutchlow, va aconseguir el premi al millor pilot independent; va guanyar curses a Brno i Phillip Island i va acabar en setena posició final amb 141 punts. Ducati i Suzuki van guanyar almenys una cursa durant la temporada (la primera victòria de Ducati va ser la primera en sis anys d'una moto que no era ni Yamaha ni Honda).
miniatura|Rossi tornà a ser subcampió el 2016 Durant la temporada es van registrar nombrosos rècords pel que fa als guanyadors de curses. Cal Crutchlow, Jack Miller, Andrea Iannone i Maverick Viñales van guanyar cadascun les seves primeres curses a la categoria reina, la primera vegada que sorgien quatre nous guanyadors en una temporada de MotoGP. Entre el al maig i el al setembre, vuit pilots –Lorenzo, Rossi, Miller, Márquez, Iannone, Crutchlow, Viñales i Dani Pedrosa– van guanyar en vuit curses consecutives, superant el rècord anterior de set entre el de i el del . Amb una victòria d'Andrea Dovizioso al que va augmentar encara més la xifra, el total de nou guanyadors també va ser un rècord per a una sola temporada de la classe reina, superant el rècord anterior de vuit de la temporada 2000.
Aquesta també va ser la primera temporada des del en què equips no oficials guanyaven una cursa, amb victòries per a l'equip Marc VDS de Miller al Dutch TT i per al LCR de Crutchlow als Grans Premis de la República Txeca i Austràlia.
Canvis de normativa Les antigues classes "Factory" i "Open" de MotoGP es fusionaren: a partir del 2016, totes les motos havien d'adoptar el paquet electrònic unificat (Unitat de control electrònic i programari). Cada pilot podia fer servir fins a set motors durant la temporada, tot i que amb especificacions "congelades", i la capacitat màxima del dipòsit de combustible passà a ser de 22 litres. Els fabricants que no haguessin obtingut cap victòria en pista seca entre el i el 2015 encara podien fer servir 12 motors de desenvolupament lliure, però en cas d'un nombre determinat de podis o victòries aconseguides durant el 2016, el fabricant perdia aquests beneficis per a la temporada següent. De la mateixa manera, qualsevol fabricant que no aconseguís cap podi el 2016 obtindria aquestes concessions el 2017.
Campions del món Pilots
Moto3Moto2MotoGP Brad Binder Johann Zarco Marc Márquez
Constructors Moto3Moto2MotoGP KTM Kalex Honda
Equips MotoGP Movistar Yamaha MotoGP
Grans Premis Sistema de puntuació
Calendari Fonts:
Cursa Data Gran Premi (nom oficial) Circuit 1 20 de març ‡ Commercial Bank Grand Prix of Qatar Losail International Circuit, Lusail 2 3 d'abril Gran Premio Motul de la República Argentina 3 10 d'abril Red Bull Grand Prix of the Americas Circuit of the Americas, Austin 4 24 d'abril Gran Premio Red Bull de España Circuit de Jerez, Jerez de la Frontera 5 8 de maig Monster Energy Grand Prix de France Circuit Bugatti, Le Mans 6 22 de maig Gran Premio d'Italia TIM Circuit de Mugello, Scarperia e San Piero 7 5 de juny Gran Premi Monster Energy de Catalunya Circuit de Barcelona-Catalunya, Montmeló 8 26 de juny Motul TT Assen TT Circuit Assen, Assen 9 17 de juliol GoPro Motorrad Grand Prix Deutschland Sachsenring, Hohenstein-Ernstthal 10 14 d'agost NeroGiardini Motorrad Grand Prix von Österreich Red Bull Ring, Spielberg 11 21 d'agost HJC Helmets Grand Prix Ceské republiky Circuit de Brno, Brno 12 4 de setembre Octo British Grand Prix Circuit de Silverstone, Silverstone 13 11 de setembre Misano World Circuit Marco Simoncelli, Misano Adriatico 14 Gran Premio Movistar de Aragón MotorLand Aragón, Alcanyís 15 16 d'octubre Motul Grand Prix of Japan Twin Ring Motegi, Motegi 16 23 d'octubre Michelin Australian Motorcycle Grand Prix Circuit de Phillip Island, Phillip Island 17 30 d'octubre Shell Malaysia Motorcycle Grand Prix Sepang International Circuit, Sepang 18 13 de novembre Gran Premi Motul de la Comunitat Valenciana Circuit Ricardo Tormo, Xest
‡ = Cursa nocturna
Guanyadors Cursa Gran Premi MotoGP Moto2 Moto3 Resultats1 GP de Qatar Jorge Lorenzo Thomas Lüthi Niccolò AntonelliResultats2 GP de l'Argentina Marc Márquez Johann Zarco Khairul Idham PawiResultats3 GP de les Amèriques Marc Márquez Àlex Rins Romano FenatiResultats4 GP d'Espanya Valentino Rossi Sam Lowes Brad BinderResultats5 GP de França Jorge Lorenzo Àlex Rins Brad BinderResultats6 GP d'Itàlia Jorge Lorenzo Johann Zarco Brad BinderResultats7 GP de Catalunya Valentino Rossi Johann Zarco Jorge NavarroResultats8 Dutch TT Jack Miller Takaaki Nakagami Francesco BagnaiaResultats9 GP d'Alemanya Marc Márquez Johann Zarco Khairul Idham PawiResultats10 GP d'Àustria Andrea Iannone Johann Zarco Joan MirResultats11 GP de la República Txeca Cal Crutchlow Jonas Folger John McPheeResultats12 GP de Gran Bretanya Maverick Viñales Thomas Lüthi Brad BinderResultats13 GP de San Marino Dani Pedrosa Lorenzo Baldassarri Brad BinderResultats14 GP d'Aragó Marc Márquez Sam Lowes Jorge NavarroResultats15 GP del Japó Marc Márquez Thomas Lüthi Enea BastianiniResultats16 GP d'Austràlia Cal Crutchlow Thomas Lüthi Brad BinderResultats17 GP de Malàisia Andrea Dovizioso Johann Zarco Francesco BagnaiaResultats18 GP de la Comunitat Valenciana Jorge Lorenzo Johann Zarco Brad BinderResultats
Accident mortal Lluís Salom es va morir arran d'un accident durant els entrenaments de la cursa de Moto2 del Gran Premi de Catalunya.
Galeria
Debutants de l'any Moto3Moto2MotoGP Joan Mir Xavi Vierge Tito Rabat
Equips i pilots MotoGP EquipConstructorMotoPilotRondes Ducati Team Ducati Ducati Desmosedici GP16 04 Andrea Dovizioso Totes 8 Héctor Barberá 15–16 29 Andrea IannoneAndrea Iannone va competir en les sessions d'entrenaments del divendres a Misano i Aragó, abans de ser reemplaçat per Michele Pirro. A Misano, Pirro va competir inicialment com a wildcard, però va ser designat oficialment com a substitut de Iannone. 1-14, 17-18 51 Michele Pirro 6, 10 51 Michele Pirro 13–14 Aprilia Aprilia RS-GP 6 Stefan Bradl Totes 19 Álvaro Bautista Totes Avintia Racing Ducati Ducati Desmosedici GP14 7 Mike Jones 15–16 8 Héctor Barberá 1–14, 17–18 12 Javier Forés 13 51 Michele Pirro 7–8 76 Loris Baz Repsol Honda Team Honda Honda RC213V 7 Hiroshi Aoyama 17 73 15Va substituir Dani Pedrosa el dissabte i el diumenge a causa de la lesió de clavicula que va patir Pedrosa als entrenaments lliures de divendres. 26 Dani Pedrosa 1–15, 18Dani Pedrosa va competir a les sessions de pràctica de divendres a Motegi, abans d'estavellar-se i fracturar-se una clavícula. Va ser substituït per Hiroshi Aoyama la resta del cap de setmana. 69 Nicky Hayden 16 93 Marc Márquez Totes Octo Pramac Yakhnich Ducati 9 Danilo Petrucci 1, 5–18 45 Scott Redding Totes 51 Michele Pirro 2–4 Yamaha Yamaha YZR-M1 21 Katsuyuki Nakasuga 15 Monster Yamaha Tech 3 Yamaha Yamaha YZR-M1 22 Alex Lowes 12–14 38 Bradley Smith 1–11, 15–18 44 Pol Espargaró Totes Suzuki Suzuki GSX-RR 25 Maverick Viñales Totes 41 Aleix Espargaró Totes LCR Honda Honda Honda RC213V 35 Cal Crutchlow Totes Red Bull KTM Factory Racing KTM KTM RC16 36 Mika Kallio 18 Honda Honda RC213V 43 Jack Miller 1–10, 12–13, 15–18 53 Esteve Rabat Totes 69 Nicky Hayden 14 Movistar Yamaha MotoGP Yamaha Yamaha YZR-M1 46 Totes 99 Jorge Lorenzo Totes Aspar Team MotoGP Pull & Bear Aspar Team Ducati Ducati Desmosedici GP14 50 Eugene Laverty Totes 68 TotesLlegenda Pilot titular Pilot convidat Pilot substitut
Classificació dels pilots Els pilots marcats en blau optaven al premi Debutant de l'any.
MotoGP (Llegenda) (En negreta - Pole; En cursiva - Volta ràpida)