La segona temporada de la Unió després de la refundació del club i després del primer ascens de categoria també va ser un èxit: al grup 15 de la Segona Regional (actualment Tercera Catalana) l'equip quedà campió de la categoria, amb un total de 26 victòries, 6 empats i 2 derrotes, i amb un balanç de 116 gols a favor i 29 en contra, i encadenà el segon ascens consecutiu, en aquest cas a la Primera Regional (actualment Segona Catalana).
Fets destacats 2008
14 de setembre: el Figueres comença la lliga al Municipal de Vilatenim en una victòria treballada per 3 a 1 davant de l'AE Vilabertran.
2009
9 de maig: el Figueres aconsegueix l'ascens matemàtic a Primera Regional a 3 jornades pel final de lliga, després de guanyar a Vilatenim el CF Empuriabrava Castelló per 2 a 0.
Plantilla
Baixes Destinació Javier Morillo Xavier Camós Ion Etxegoyen Juan José Valverde Abraham Huguet Adán Lloveras Pere Montserrat
Resultats 18px|Copa Catalunya Segona Regional-Grup 15
Classificació Pos.EquipJGEPGFGCDGpts.1r20px|UE Figueres UE Figueres34266211629+87842n20px|Torroella UE UE Torroella3421769343+50703r20px|CF Esplais CF Esplais34171166433+31624t20px|UE La Jonquera UE La Jonquera34159107242+30545è20px|UE Cabanes UE Cabanes34166126853+15546è20px|CD Agullana CE Agullana34131385246+6527è20px|CF Verges CF Verges34157126862+6528è20px|CF Sant Miquel de Fluvià CF Sant Miquel de Fluvià34148127657+19509è20px|Portbou CE CE Portbou34148124456-125010è20px|Viladamat CF Viladamat CF34136157059+114511è20px|Aro CE Aro CE341110136057+34312è20px|CE Maçanet de Cabrenys CE Maçanet de Cabrenys341110134255-134313è20px|AE Roses B AE Roses34118155549+64114è20px|AE Vilabertran AE Vilabertran34115185666-103815è20px|CE Llançà CE Llançà34108164864-163816è20px|FC Borrassà FC Borrassà34105195686-303517è20px|CF Empuriabrava Castelló CF Empuriabrava Castelló3486203655-192718è20px|CF Vilajuïga CF Vilajuïga34213126190-1647 <small>En verd, els equips que ascendiren a Primera Regional, en groc, els que disputaren la fase de promoció a Primera Regional, i en vermell, els que descendiren a Tercera Regional.
Referències
Categoria:Temporades de la UE Figueres Figueres Figueres