Nextstrain és una col·laboració entre investigadors de Seattle, EUAHow coronavirus mutations can track its spread—and disprove conspiracies Sarah Elizabeth Richards, 26 March 2020 www.nationalgeographic.com, accessed 25 December 2020 i Basilea, Suïssa,Spread of a novel SARS-CoV-2 variant across Europe in summer 2020 29 October 2020 www.unibas.ch, accessed 25 December 2020 que proporciona una col·lecció d'eines de codi obert per visualitzar la genètica que hi ha darrere de la propagació de brots epidèmics.nextstrain RNA, DNA, and COVID-19 Nosheen Reza 6 April 2020 earlycareervoice.professional.heart.org, accessed 25 December 2020
El seu objectiu és donar suport a les mesures de salut pública i la vigilància facilitant la comprensió de la propagació i l'evolució dels patògens. El codi desenvolupat per Nextstrain es posa a disposició del públic a través de, per exemple, github.com i les seves dades estan disponibles i es poden visualitzar de forma accessible a través de les pàgines del lloc web.Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution Bioinformatics, Volume 34, Issue 23, 01 December 2018, Pages 4121–4123, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty407 22 May 2018 academic.oup.com/bioinformatics, accessed 25 December 2020
Segons el seu lloc web, l'equip de Nextstrain manté una anàlisi genòmica actualitzada de cadascun dels patògens següents:Nextstrain Real-time tracking of pathogen evolution section 'Explore pathogens' nextstrain.org, accessed 26 December 2020 SARS-CoV-2 Grip estacional Virus del Nil occidental Parotiditis Zika Ebola de l'Àfrica Occidental 2013-16 Dengue Grip aviària Xarampió Enterovirus D68 Tuberculosi
El maig de 2020, Nextstrain i Trevor Bedford (professor associat, Fred Hutchinson Cancer Research Center)40 Under 40 Healthcare fortune.com, accessed 29 December 2020 van rebre un premi Webby Special Achievement Award per a l'eina web.Webby Special Achievement winners.webbyawards.com, accessed 29 December 2020
Nextstrain i els seus resultats han estat àmpliament citats durant la pandèmia COVID-19.The Science Behind London’s Christmas Coronavirus Lockdown John Drake 19 Dec 2020 www.forbes.com, accessed 25 December 2020
Referències
Categoria:Organitzacions mèdiques i de salut internacionals Categoria:Bases de dades biològiques