El Govern de les Illes Balears de la cinquena legislatura (1999-2003) fou un govern resultant del Pacte de Progrés, un acord postelectoral entre el PSIB-PSOE, Unió Mallorquina, el Partit Socialista de Mallorca, Esquerra Unida, Els Verds i la Coordinadora d'Organitzacions Progressistes de Formentera tot aprofitant la pèrdua de la majoria absoluta a les eleccions al Parlament de les Illes Balears de 2003. Estigué en funcions des del juliol de 1999 fins a l'1 de juliol de 2003.
En un principi, i condicionat per una disposició legal, el president Antich només va poder nomenar 10 consellers amb cartera —6 del PSOE, 2 del PSM, 1 d'EU i 1 d'Els Verds—, a banda d'un vicepresident, Pere Sampol, i dos consellers sense cartera —1 del PSOE i 1 d'EU.Ordre del president de les Illes Balears de dia 27 de juliol de 1999, de nomenament dels membres del Govern de les Illes Balears
Dia 16 de març de 2000, i després d'aprovar-se una lleiLlei 2/2000 de 14 de març de modificació de l'article 3, de la Llei 5/1984, de 24 d'octubre, de règim jurídic de l'administració de la comunitat autònoma de les Illes Balears que permetia el president de decidir lliurement el nombre de conselleries que formarien el gabinet autonòmic. Llavors, l'executiu balear va quedar format per 7 consellers del PSOE, 3 del PSM, 2 d'EU i 1 d'Els Verds.
Composició President: Francesc Antich Oliver
Departament Titulars<center> 28 de juliol de 1999<center> 17 de març de 2000<center> 1 de juny de 2000<center> 17 de febrer de 2001<center> 28 de setembre de 2001<center> 23 d'octubre de 2002VicepresidènciaPere Sampol Mas Economia,Comerç i IndústriaJoan Mayol Serra Pere Sampol Mas Agricultura i PescaJoan Mayol Serra Mateu Morro Marcé PresidènciaAntoni Garcias Coll Hisenda i PressupostsJoan Mesquida Ferrando Joan Mesquida Ferrando Innovació i EnergiaMaria Misericòrdia Ramon Juanpere Abans del nomenament ja era membre del Govern com a consellera sense carteraPríam Villalonga Cerdà Treball i FormacióEberhard Grosske Fiol Eberhard Grosske Fiol Miquel Rosselló del Rosal Benestar SocialFernanda Caro Blanco Obres Públiques, Habitatge i TransportsJosep Antoni Ferrer Orfila Francesc Quetglas Rosanes TurismeCelestí Alomar Mateu Educació i CulturaDamià Pons i Pons Salut i ConsumAina Salom Soler Medi AmbientMargalida Rosselló Pons InteriorJosep Maria Costa Serra
Estructura A l'inici de legislatura Al BOIB 520 de 28 de juliol de 1999BOIB Núm. 520 - 28/juliol/1999 Extraordinari se va definir les estructures de cada conselleria a través de diferents decrets. Pel que fa a nomenaments és produí a través de diversos butlletins oficials de diferents dates: 521,BOIB Núm. 521 - 29/juliol/1999 Extraordinari 522,BOIB Núm. 522 - 3/agost/1999 Extraordinari 523,BOIB Núm. 523 - 6/agost/1999 Extraordinari 101,BOIB Núm. 101 - 10/agost/1999 105,BOIB Núm. 105 - 19/agost/1999 524,BOIB Núm. 524 - 9/setembre/1999 Extraordinari 131.BOIB Núm. 131 - 19/octubre/1999 10.BOIB Núm. 010 - 22/gener/2000
Conselleria de Presidència Secretaria General Tècnica: Fernando Pozuelo Mayordomo Direcció General de Presidència: Damià Jaume Cánoves Rotger / Pere Fullana Puigserver (des de desembre de 2000) Direcció General de Relacions Institucionals: Pere Fullana Puigserver / Antoni Reinés Pons (des de desembre de 2000) Direcció General de Relacions amb el Parlament i de Coordinació Normativa: Valentí Valenciano López Direcció General de Patrimoni i Entitats Jurídiques: Antoni Garcías Simó Direcció General de Comunicació: Jordi Bayona Llopis Gabinet Tècnic del President: María Rosselló Martorell Director de l'Institut de Relacions Europees: Damià Pons i Pons (fins a febrer de 2000)BOIB Núm. 019 - 12/febrer/2000 Direcció general de Relacions Europees i per a la Mediterrània: Juan Manuel López Nadal Delegació del Govern de les Illes Balears a Brussel·les: Antoni Costa Costa
Conselleria d’Hisenda, Pressuposts, Energia i Innovació Tecnològica Secretaria General Tècnica: Pablo Rivero Corte Intervenció General: Vicente Ligüerre Gil Tresoreria General: José Luís Gil Martín Direcció General de Pressuposts: Cristòfol Milán Mateu Direcció General d’Hisenda. Direcció General de Programació i Ordenació Econòmica: Tomás Méndez Reyes Direcció General de Tecnologia i Comunicacions: Carles Bona García Direcció General d'Energia: Juan Perchés Escandell Direcció General de Recaptació i de Coordinació amb les Hisendes Territorials: Joaquín Tomás Estrada
Conselleria de Treball i Benestar Social Secretaria General Tècnica: Agustín Aguirrebengoa Esnaola Direcció General de Treball: Fernando Galán Guerrero Direcció General de Formació: Francesc Obrador Moratinos Direcció General de Salut Laboral: Aina Vicens Llodrà Direcció General de Joventut: Joan Caules Ameller Direcció General d'Esports: Joana Maria Petrus Bey Direcció General de Cooperació: Assumpta Gorrías Pons Direcció General de Serveis Socials: Antoni Sancho Cervantes Direcció General de Menors: Aina Rado i Ferrando Directora gerent de l'Institut Balear d'Afers Socials (IBAS): Josefina Santiago Rodríguez Director de l'Oficina de Defensa dels Drets del Menor: Javier Bares Marticorena
Conselleria d'Obres Públiques, Habitatge i Transports Secretaria General Tècnica: Joan Josep Manila Pou Direcció General d'Obres Públiques i Transports: Joaquín Rodríguez Rodríguez Direcció General d'Arquitectura i Habitatge: Jaume Carbonero Malbertí Direcció General d'Ordenació del Territori: Manuel Cabellos Barreiro
Conselleria de Turisme Secretaria General Tècnica: Isabel Oliver Sagreras Direcció General de Coordinació Turística: José Antonio Pérez de Mendiola Roig / Jaume Garau Salas (des de setembre de 2001) Direcció General d'Ordenació del Turisme: Josefina Casals Senent
Conselleria d'Educació i Cultura Secretaria General Tècnica: Jaume Pons Pons Direcció General d'Administració Educativa: Jaume Morey Sureda Direcció General de Planificació i Centres: Jaume Gual Mora Direcció General d'Ordenació i Innovació: Catalina Bover Nicolau Direcció General d’Universitat: Martí Xavier March i Cerdà Direcció General de Personal Docent: Arnau Amer Sastre Direcció General de Formació Professional i d’Inspecció Educativa: Bartomeu Llinás Ferrà Direcció General de Cultura: Pere Muñoz Perugorría Direcció General de Política Lingüística: Joan Melià Garí Secretaria General del Pla Balear de Recerca i Desenvolupament Tecnològic: Enrique Tortosa Martorell Al març 2000 passa a ser Direcció general de Recerca, Desenvolupament Tecnològic i Innovació: Enrique Tortosa Martorell Delegat territorial d'Educació a Menorca: Eduard Riudavets Florit Delegat territorial d'Educació a Eivissa i Formentera: Antoni Marí Marí
Conselleria de Sanitat i Consum Secretaria General Tècnica: Gabriel Payeras Muntaner Direcció General de Sanitat: Josep Manuel Pomar Reynes Direcció General de Consum: Miguel Ángel Cabeza Rodríguez Director gerent del Servei Balear de la Salut: Adolfo Marques Bravo / Joan Domènech Ticó (des de 14 d'abril de 2000) / Julio Fuster Culebras (des de 8 de juny de 2001)
Conselleria de Medi Ambient Secretaria General Tècnica: Joana Coloma Busquets Huguet / Joana Aina Campomar Orell (des de 1 de febrer de 2001) Direcció General de Biodiversitat: Pere Tomas Vives / José Manuel Gómez González (des de 1 de març de 2000)BOCAIB Núm. 026 de 2000 Direcció General de Residus i Energies Renovables: Nicolau Jaume Barceló Montserrat Direcció General de Recursos Hídrics: Antonio Rodríguez Perea Direcció General de Litoral i Territori: Onofre Rullán Salamanca Direcció General de Mobilitat i Educació Ambiental: Salvador Miralles Valero
Conselleria d'Economia, Agricultura, Comerç i Indústria Secretaria General Tècnica: Sebastià Rechach Genovard Direcció General d'Economia: Antoni Monserrat Moll Direcció General d'Agricultura: Margalida Estelrich Font Direcció General d’Infraestructures Agràries: Mateu Ginard Sampol Direcció General de Pesca: Enric Massutí Sureda Direcció General de Comerç: Antònia Allés Pons Direcció General d’Indústria: Francesca Vives Amer Direcció General de Promoció Industrial: Bartomeu Oliver Barceló
Conselleria d’Interior Secretaria General Tècnica: Manuel Quadreny Cortés / María Begoña Morey Aguirre (des de 1 de febrer de 2001) Direcció General d’Interior: Antonio Torres Martorell Direcció General de Funció Pública: Jaume Colom Adrover
Membres del Consell Assessor de Radio-Televisió Espanyola a les Illes Balears: Anselm Barber i Luz. Maria Antònia Carrasco i Martí. Antoni Company i Bonet. Lourdes Costa i Torres. Alejandro Espinós i Bonmatí. Maties Garcies i Salva. Antoni Lluís Juaneda i Cabrisas. Tino Martínez i Cortes. José Ramón Orta i Rotger. Catalina Palau i Costa. Joan Rotger i Seguí. José Javier Teixeira i González. Joan Vives i Gomis
Reorganització de govern de març de 2000 Amb l'ampliació de conselleries, hi hagué canvi d'estructura a algunes d'elles segons es detalla a continuació:BOIB Núm. 507 - 17/març/2000 Extraordinari
Conselleria de Presidència Queda igual com estava
Conselleria d’Hisenda i Pressuposts Secretaria General Tècnica: Pablo Rivero Corte / Lluís Matias Llinás Álvarez Intervenció General Direcció General del Tresor i Política Financera Direcció General de Pressuposts Direcció General de Programació i Ordenació Econòmica Direcció General de Recaptació i de Coordinació amb les Hisendes Territorials
Conselleria de Treball i Formació Secretaria General Tècnica: Pere Mascaró Pons / Isabel Eugenia Nora del Castillo (des de febrer de 2001) Direcció General de Treball Direcció General de Formació: Amparo Rocabruna Beltrán (des de juliol de 2001) Direcció General de Salut Laboral Direcció General de Treball i Salut Laboral: Fernando Galán Guerrero (des de febrer de 2001)
Conselleria d'Economia, Comerç i Indústria Secretaria General Tècnica: Sebastià Reixach Genovard Direcció General d'Economia Direcció General de Comerç Direcció General d’Indústria Direcció General de Promoció Industrial
Conselleria d'Obres Públiques, Habitatge i Transports Queda igual com estava
Conselleria de Turisme Queda igual com estava
Conselleria d'Educació i Cultura Queda igual com estava
Conselleria de Sanitat i Consum Queda igual com estava
Conselleria de Medi Ambient Queda igual com estava
Conselleria d'Agricultura i Pesca Secretaria General Tècnica: Joan Serra Mercadal Direcció General d'Agricultura Direcció General d’Infraestructures Agràries Direcció General de Pesca: Sebastià Covas Adrover
Conselleria d’Interior Conselleria de Benestar Social Secretaria General Tècnica: Agustín Aguirrebengoa Esnaola Direcció General de Joventut Direcció General d'Esports Direcció General de Cooperació: Llorenç Pons Llabrés (des de març de 2001) Direcció General de Serveis Socials Direcció General de Menors Directora de l'Institut Balear de la Dona: Francisca Maria Lourdes Mas Busquets
Conselleria d’Innovació i Energia Secretaria General Tècnica: Ramón Ignacio Morey Aguirre Direcció General de Tecnologia i Comunicacions Direcció General d'Energia Direcció General de Recerca, Desenvolupament Tecnològic i Innovació
Reorganització Conselleria de Salut El traspàs de les funcions i serveis de l'INSALUD a les Illes Balears feren necessària una reorganització de la Conselleria. Per altra banda, es volgué tenir en compte la necessitat de donar una atenció preferent a la prestació farmacèutica. I a més, la Conselleria de Sanitat i Consum passa a denominar-se Conselleria de Salut i Consum, atès que molts organismes supraautonòmics adaptaren la nomenclatura de Salut en lloc de Sanitat.Decrets 9 i 10/2001
Conselleria de Salut i Consum Secretaria General Tècnica Direcció General de Salut Pública i Participació: Margalida Buades Feliu Direcció General de Planificació i Finançament: Pablo Rivero Corte Direcció General d'Avaluació i Acreditació: Vicenç Thomas Mulet Direcció General de Farmàcia: Joan Lluís Serra Devecchi Direcció General de Consum