La Segona Ronda de la classificació de la Copa del Món de futbol 2006 de la CAF començà el 5 de juny de 2004 i finalitzà el 8 d'octubre de 2005. El primer equip de cada grup es classificà per la Copa del Món de futbol de 2006. A més, els tres primers es classificaren per la Copa d'Àfrica de Nacions 2006.
Grup 1 Classificació
Partits
El gol en l'últim minut de Togo, que va eliminar Mali de la competició, va enfadar la multitud, que va provocar un avalot als carrers de Bamako.MALI SOCCER FANS RIOT AFTER LOSSViolence mars World Cup games
Per motius de seguretat relacionades amb les eleccions al país, el partit es disputà a porta tancada.
Grup 2 Classificació
Partits
Grup 3 Classificació
Partits
Grup 4 Classificació
Partits
Grup 5 Classificació
Partits
A causa del comportament rebel i de l'estampida que va matar una persona en el partit contra el Marroc, aquest partit es va jugar a porta tancada.
Referències
Categoria:Fases de classificació de la Copa del Món de futbol de 2006 2006