Ve vesmíru Warhammeru 40,000 jsou Imperiální jednotky jedinou naději lidstva na přežití v pochmurné a nemilosrdné budoucnosti 41. tisíciletí. Impérium je obklopeno cizími druhy a je také pod neustálým útokem sil Chaosu, takže jeho přežití závisí na jeho ozbrojených složkách.

Obranné síly Impéria se skládají z: Imperial Guard – Imperiální garda Imperial Navy – Imperiální námořnictvo Adeptus Astartes – Vesmírní mariňáci Inquisition – Inkvizice Adeptus Arbites – Policie Impéria Adeptus Custodes – Císařovi osobní ochránci a strážci Imperiálního paláce Adeptus Mechanicus – organizace monopolně ovládající veškeré technologie Impéria Collegia Titanica – část Adepta Mechanica ovládající masivní bipedální válečné stroje Adepta Sororitas – bojovnice patřící pod Adeptus Ministorum Officio Assassinorum – imperiální zabijáci Různé další specializované organizace

Kromě toho je každý obydlený svět v Impériu povinen udržovat své vlastní vojenské síly pro obranu planety. Jednotlivé planetární obranné síly se od sebe velmi liší, ještě více než pluky Imperiální gardy, protože se drží mnohem více své kultury a svých tradic. Některé jsou nízké kvality, zatímco jiné jsou lépe trénované a vybavené než většina regimentů Gardy (například Cadijské Planetární obranné síly). Impérium má mnohem více organizací, než je zde uvedeno, ale ty jsou vysoce specializované. Tyto skupiny jsou zřídka k vidění, ovšem pokud jsou uvedeny, musí se s jejich silou počítat.

Imperial Guard Imperiální garda je největší a nejvíce různorodá vojenská organizace, která kdy ve W40K existovala. Některé z planet Impéria cvičí vlastní regimenty, které se liší počtem, designem uniforem, výstrojí i výzbrojí. Čím vyspělejší planeta, tím technicky vyspělejší Imperiální garda. Jejím posláním je ochrana již dobytého území, obrana světů proti nenadálým útokům a dobývání cizích planet. Oproti Prostorovým námořníkům jde o slabší jednotky, kde jde více o početní převahu než o kvalitu. Každý regiment se skládá z 500 až 10,000 tisíc vojáků, které jsou řízeny Departmentem Munitoria. Ten se stará o jejich zásobování, trénink a vybavení. O velení se podle velikosti regimentu stará důstojník s hodností od plukovníka po generála. Další osobou skoro stejně důležitou je Komisař. Tento důstojník zajišťuje morálku vojáků a náboženské vedení jednotky. V některých případech, například u Tanithských prvních a jediných se může jednat o jednu osobu, zde komisaře-plukovníka Ibrama Gaunta. Protože gardisté bývají jen lehce obrněni a nemají potřebné fyzické nebo psychické schopnosti, využívají ve velkém množství vojenskou techniku. Mezi ni patří tanky, lehkým Siegfriedem počínaje a těžkým Banebladem konče, transportní vozidla, průzkumná vozidla, dělostřelectvo a další. Stejně jako členové Gardy jsou i vozidla přizpůsobená dané planetě, takže existuje například mnoho variant tanku typu Leman Russ. Pochopitelně stejně široký je i seznam osobních zbraní: boltery, granáty, plamenomety, laserové a plazmové zbraně, tavomety i klasické palné zbraně a mnoho dalších. Některé známější regimenty: Vostroyanští Prvorození – díky chladnému klimatu planety Vostroyi jsou Prvorození zběhlí v boji za těchto podmínek. Jejich výcvik boje zblízka i ostré střelby je natolik náročný a nebezpečný, že ho mnoho branců nepřežije. Ti, kteří však tvrdý výcvik přežijí, jsou právem hrdi na to, že jsou považováni za jedny z nejlepších válečníků Impéria. Odvaha a tvrdost, jež Prvorození předvádí v bitvách, je zřídka viděná jinde, než v řadách Adeptus Astartes. Vostroyanští často pohrdají ostatními regimenty Gardy, které neprojevují tolik obětavosti jako oni samy a tak špatně spolupracují s řadou spojenců. Pro toho, kdo získá jejich sympatie, jsou však těmi nejlepšími druhy ve zbrani, jaké si lze vůbec přát. Tallarnští Pouštní nájezdníci - Tallarn je drsná planeta s nekonečnými sirnými pouštěmi a zuřícími písečnými bouřemi. Je to místo největší tankové bitvy Horova Kacířství, hrob tisíců zrádců a domov jedněch z nejodolnějších bojovníků Gardy, Tallarnských Pouštních jezdců. Tallarn byl kdysi úrodná planeta, ale zrádcovská legie Železných válečníků planetu napadla virovými bombami a změnila ji v neúrodnou pustinu. Tallarňané jsou skvělí geriloví bojovníci, známí mistrovským zvládnutím taktiky "udeř a uteč", a také jednotkami pouštních Sentinelů. Jejich oblíbenými zbraněmi jsou zakřivené nože. Catachanští Pralesní válečníci – Catachan je planeta tak ohrožující život, že každý den na ní je bojem o přežití. Odolní lidé na Catachanu jsou potomci vůbec prvních osadníků, kteří kolonizovali planety před dávnými generacemi. Jsou experti v přežití uprostřed džungle, která se hemží nenasytnými dravci, obrovskými masožravými rostlinami, jedovatým hmyzem a virovými onemocněními. Jejich pýchou jsou regimenty Pralesních válečníků. Byli odesláni do válečných zón po celé galaxii, kde uplatňují své dovednosti vedení války v džungli. Výměnou za jejich loajalitu obdrží jejich rodiny a osady technologie a léky, které by za normálních okolností nemohly získat. Cadijská Úderná pěchota – Cadia má zvláštní a ctěné místo v dějinách lidstva. Leží totiž na okraji Oka Hrůzy, v úzkém koridoru nazývaném Cadijské brány. To je průchod mezi Chaosem nakažených démonických světů Oka hrůzy a Terrou. Cadia je proto strategicky nejdůležitější planetou v galaxii. Při několika příležitostech se síly Chaosu vrhly proti Cadii a v jejím okolí byly svedeny zuřivé bitvy. Tyto obrovské srážky jsou vzácné, ale menší loupeživé nájezdy zrůd Chaosu nejsou ničím neobvyklým. Armageddonská Ocelová legie – planeta Armageddon je hustě zalidněnou úlovou planetou, takže regimenty Gardy mohou být snadno zvýšeny prostřednictvím odvodů. Při obraně je většina vojáků poslána, aby bránila úly, ve kterých sama vyrůstala a byla trénována, což nejenže dává vojákům výhodu výborné znalosti bojiště, ale také zvyšuje jejich obětavost a rozhodnost. Armageddon byl jednou napaden ohromnou armádou démonů,vedenou samotným kacířským primarchou legie kacířských mariňáků Světažroutů Angronem a dvakrát invazní armádou Orků a, a proto jsou Oceloví legionáři považováni za experty v boji proti Orkům. Mrtvé jednotky Kriegu – planeta Krieg byla zničena loajálními jednotkami Kriegu po vzpouře tamních vladnoucích. Po mnoha století obsazování planety zákop po zákopu obsadili celou planetu loajální jednotky. Po Kriegu byl vyžadován jeden regiment, bylo však dodáno 20 plně vybavených regimentů. jsou nasazováni převážně na mrtvých světech či proti těžce opevněným cílům, neboť excelují v obléhacím bojí.

Imperial Navy Zatímco Imperiální garda zahrnuje pozemní jednotky, Imperiální námořnictvo flotily a vesmírné lodě. Úkolem Námořnictva je obrana imperiálních planet, ochrana a doprovod obchodních lodí, transport pěchoty, ničení nepřátelských lodí a planet. Lodě námořnictva nejsou technologicky tak pokročilé jako plavidla Eldar nebo Necronů, ale nedostatky nahrazují počtem a dobrou organizací. Námořnictvo bylo vytvořeno v době Velké křížové výpravy a spolu s Imperiální gardou tvořili jedinou organizaci, Imperiální armádu. Původně byl každému regimentu Gardy přidělen jeden imperiální křižník a dohromady jim velel velící důstojník. Po Horově Kacířství rozdělil Codex Astarta Armádu na Gardu a Námořnictvo ze stejných důvodů, jako změnil velikost kapitul Prostorových námořníků. Flotily Námořnictva jsou složeny z mnoha různorodých lodí, které lze rozdělit do čtyř kategorií: bitevní lodě a velké křižníky, křižníky a lehké křižníky, eskortní plavidla a stíhači. Velikost plavidel ve W40K je předmětem dohadů, nicméně všeobecná shoda stanovuje délku eskortních plavidel na 750 metrů až 2 kilometry, lehkých křižníků a křižníků na 2500 až 3500 metrů, velkých křižníků na 3000 až 4500 metrů a bitevních lodí na 4500 až 6000 metrů. Existují pochopitelně výjimky, vlajková loď vojevůdce Horuse měla měřit téměř 15 kilometrů. Bitevní lodě – velké hvězdné lodě vybavené mnoha štíty a zbraněmi slouží především jako vlajkové lodě admirálům flotily. Jsou velmi silně vyzbrojené, ale slabě ovladatelné. Tři hlavní typy jsou Emperor (může převážet ohromný počet menších plavidel, aniž by ztratil cokoliv ze své drtivé palebné síly), Victory a Retribution (známá silnou boční palbou a vysokým počtem odpalovačů torpéd). Méně známé jsou staré typy Apocalypse a Oberon. Tyto monstra mají posádku čítající 25 tisíc až tři miliony lidí a jsou konstruována ve vesmírných loděnicích Adeptem Mechanicem. Velké křižníky – jsou většinou starého designu bez lodní přídě a svou konstrukcí se příliš nehodí k moderní flotile. Vzhledem k tomu jich bylo mnoho přeřazeno k rezervním flotilám. Některé lodě byly přestavěny podle nových požadavků, ale ve výsledku jsou mnohem větší než předchůdci a jsou proto řazeni mezi bitevní lodě. Křižníky – tvoří páteř každé flotily. Nejsou tak silné jako větší lodě, ale jsou mnohem rychlejší. Existuje mnoho druhů křižníků, ale většina je vyrobena na stejném základě a jen má různě kombinované boční střílny a hangáry. Posádku tvoří 10 tisíc až 1 milion lidí. Podobné jsou bitevní křižníky, jen jsou větší a mají silnější pancéřování. Lehké křižníky – kombinují rychlost a obratnost se slušnou výdrží a palebnou silou. Slouží jako doprovodné lodě větším plavidlům, transportní lodě nebo protipirátská obrana. Eskortní lodě – široká škála plavidel od starých fregat přes křižníky po nákladní lodě. Plní stejnou roli jako lehké křižníky, některá plavidla se specializují např. na torpédový útok nebo výsadek vojáků na cizí loď. Stíhači – planetární i vesmírní. Ti druzí nejsou příliš často používaní, slouží pouze k ochraně před jinými stíhači a bombardéry. Planetární letouny jsou rozšířenější: typy Lightning a Thunderbolt slouží k vybojování vzdušné nadvlády, případně jako stíhací a eskortní letouny, Maraudery jsou bombardéry.

Space Marines Vesmíriní mariňáci (nebo také Adeptus Astartes) vychází z Legií Vesmírných mariňáků (Legiones Astartes), které vytvořil Císař během Velké křížové výpravy. Legií bylo dohromady dvacet a jejich veliteli byli uměle vytvoření synové Císaře, nadlidští válečníci Primarchové. Během Horova Kacířství některé legie zradily Císaře a Impérium; ty, které mu zůstaly věrné, se přeměnily na Vesmíriné mariňáky.

Vesmíriné mariňáky tvoří armáda elitních, geneticky modifikovaných mužů, kteří jsou vybíráni na základě svých válečnických schopností. Každá kapitula má své tradice a historii plnou slavných činů a jmen dávných hrdinů. Jednotlivé kapituly se od sebe liší jednak znakem a barevným schématem (může se lišit před a po Horově kacířství), tak výkladem Codexu Astartes (doktrína Vesmírných mariňáků) a tedy způsobem boje s nepřítelem. Kapituly používají specifické jednotky a techniku, které žádná jiná kapitula neužívá (Ravenwing Temných andělů, Leman Russ Exterminator Hvězdných Vlků, apod.). Jednotlivé kapituly tvoří zcela samostatné armády, které nepodléhají žádnému velení a jsou schopny se vypořádat téměř s jakoukoliv hrozbou. Více kapitul se v jedné válečné zóně vyskytuje pouze zřídka – většinou v konfliktech, které mají klíčový význam pro přežití Impéria (bitva o Armageddon, boje proti Temným křížovým výpravám Chaosu nebo obrana před tyranidími roji). V důsledku toho jsou vztahy mezi jednotlivými kapitulami na různé úrovni od spojenectví až po otevřené nepřátelství (například nepřátelství Hvězdných vlků a Temných andělů přetrvává více než 10,000 let). Elitou Adeptus Astartes jsou Terminátoři, což jsou veteráni kapitul oblečení do speciálních brnění s vysokou odolností a drtivou palebnou silou, ale nízkou pohyblivostí.