náhled|kostel Obětování Panny Marie Jako významné královské město, sídlo většího počtu klášterů a později centrum českobudějovické diecéze a krajské město měly České Budějovice rozsáhlé možnosti k vybudování celé řady kostelů a modliteben, z nichž většina přetrvala do dnešních dob a stále slouží svému původnímu účelu.

Charakteristika Většina náleží katolíkům (České Budějovice zůstaly nepokořenou baštou katolicismu i za husitských válek), z pozdějších dob pocházejí kostely a modlitebny československé církve husitské a dalších protestantských církví a denominací. Dva nejstarší kostely (katedrála svatého Mikuláše a klášterní kostel Obětování Panny Marie) náleží k nejvýznamnějším historickým a kulturním památkám České republiky.

Seznam obsahuje síňové a domácí kaple, tedy takové, které uzavírají prostor chápaný jako modlitebnu. Kaple výklenkové a jim podobná zděná boží muka obsahuje samostatný seznam drobných sakrálních památek v Českých Budějovicích.

Stále funkční

Název Obrázek Církev Umístění Založení GaleriePopis Betlémský sbor čsl. husitská Lidická 218 Rožnov, Lidická 1120/218, bohoslužby pravidelně v neděli od 8 hodin. Husův dům 120px|Husův sbor čsl. husitská U Výstaviště 10 Čtyři Dvory, U Výstaviště 509/10, poblíž autobusové zastávky U Parku, bohoslužby pravidelně v neděli od 11 hodin. Husův sbor 120px|Husův sbor čsl. husitská Palackého náměstí 1 1924 Palackého náměstí, bohoslužby pravidelně v neděli od 9 hodin. kaple Nanebevzetí Panny Marie 120px|Kaple Nanebevzetí Panny Marie pravoslavná náměstí Švabinského 1883 Mladé, novogotická návesní kaple. Večerní bohoslužby v sobotu a Božská liturgie v neděli a svátky od 9 hodin. kaple Nejsvětějšího Srdce Ježíšova 120px|budova Biskupského gymnázia římskokatolická Jirsíkova 5 1991 Školní kaple Biskupského gymnázia, zřízení povolil brněnský biskup 1. 9. 1991. kaple Panny Marie 120px|budova biskupství římskokatolická Biskupská 4 18. století Domácí kaple v biskupské rezidenci zasvěcená Panně Marii, kde je uložen originál obrazu Panny Marie Budějovické. kaple Smrtelných úzkostí Páně 120px|kaple Smrtelných úzkostí Páně římskokatolická (vlastník), řeckokatolická (užívání) Kněžská 1727–1731 *Ve čtvrtek a v přikázané svátky v 19:00 řeckokatolické bohoslužby. Křižovatka ulic Kanovnická a Kněžská. kaple svaté Karoliny 120px|kaple svaté Karolíny římskokatolická hřbitov Mladé 1891 Mladé, novogotická hřbitovní kaple. Původně hrobka rodu Kleinů a Marionů. kaple svaté Otýlie 120px|Kaple svaté Otýlie římskokatolická hřbitov svaté Otýlie 1891 Novorománská hřbitovní kaple. Bohoslužby v neděli od 9:30. kaple svatého Gorazda římskokatolická Puchmajerova 2 2004 Suché Vrbné, zřízena v kněžském domově v roce 2004. kaple svatého Jana Nepomuckého římskokatolická Třebotovice 1862–1863 Novorománská kaple se zvoničkou byla vysvěcena 16. května 1863. kaple svatého Josefa 120px|Kaple svatého Josefa římskokatolická Na Sadech 19 1871 Bývalé Vídeňské předměstí, kaple kláštera kongregace Školských sester de Notre Dame v domě U Svatého Josefa. Bohoslužby denně v 6:30. kaple Jana Nepomuka Neumanna 120px|Kaple Teologické fakulty římskokatolická Kněžská 8 Ve druhém patře budovy Teologické fakulty. Veřejnosti běžně nepřístupná. kaple v Kališti 120px|kaple v Kališti římskokatolická Kaliště 1874 Výstavba novorománské kaple se zvoničkou byla povolena 7. května 1872. kaple Všech svatých země české 120px|Všech svatých země české pravoslavná Husova třída 1869 Čtyři Dvory, křižovatka ulic Husova a Sukova. Barokní, původně římskokatolickou kapli svatého Vojtěcha v majetku města užívá od roku 1993 pravoslavná církev. Bohoslužby každou druhou neděli v měsíci od 8:30. katedrála svatého Mikuláše 128x128pixelů římskokatolická U Černé věže <1297 V centru u severovýchodního roku náměstí Přemysla Otakara II. V letech 2011-2013 byla katedrála opravena. Rozpis bohoslužeb zde. klášterní kostel Obětování Panny Marie 120px|Kostel Obětování Panny Marie římskokatolická Piaristické náměstí 1265 Historické jádro, bývalý dominikánský konvent. Rozpis bohoslužeb v samostatném článku. kostel Božského srdce Páně 120px|kostel Božského srdce Páně římskokatolická Rudolfovská třída 1903–1904 Na křižovatce ulic Lipenská a Rudolfovská (č. p. 1980). Součást kláštera kongregace sester Nejsvětější Svátosti. Bohoslužby v 7:00 (úterý, pátek), v 8:00 (neděle) a v 18:00 (pondělí, středa, čtvrtek, sobota). kostel Českobratrské církve evangelické 120px|Kostel Českobratrské církve evangelické evangelická tř. 28. října 26 1899 Kostel vystavěný německými luterány sloužil do roku 1934 německému evangelickému sboru i pro sbor Českobratrské církve evangelické. kostel Nejsvětější Trojice 120px|Kostel Nejsvětější Trojice římskokatolická U Trojice 1515 Součást bývalého morového špitálu na křižovatce Pražská – U Trojice, pozdně gotická stavba. Využíván do roku 1971, v roce 1982 upraven pro Památkový ústav. V roce 2023 provoz kostela obnoven. kostel Panny Marie Královny Andělů 120px|kostel Panny Marie Královny Andělů římskokatolická Novohradská 1938–1940 Nové Hodějovice, křižovatka Novohradské a Ke Studánce. Bohoslužby každou neděli od 10:30. kostel Panny Marie Růžencové 120px|kostel Panny Marie Růžencové římskokatolická, řeckokatolická Žižkova třída 4 1899–1900 Součást kláštera Kongregace bratří Nejsvětější Svátosti (petrínů). Bohoslužby v 9:00 krom pondělí (v 17:00) a čtvrtka (v 16:00); v neděli v 11:00 se koná řeckokatolická liturgie. kostel svatého Cyrila a Metoděje 120px|kostel svatého Cyrila a Metoděje římskokatolická Puchmajerova 2 1935 Suché Vrbné, součást původního kláštera kongregace bratří těšitelů z Gethseman (fungoval do roku 1950). Bohoslužby v pátek v 17:00 a v neděli v 8:30. kostel svatého Jana Nepomuckého 120px|Kostel svatého Jana Nepomuckého římskokatolická Boženy Němcové 1914–1915 Mezi ulicemi Boženy Němcové, Generála Svobody a Jánská. Zajímavostí stavby je teplovzdušné podlahové vytápění. Bohoslužby v 7:30 (středa, pátek), v 9:00 (neděle) a v 18:00 zimního (resp. standardního) času nebo 19:00 letního času (čtvrtek, sobota). kostel svatého Jana Křtitele a svatého Prokopa 120px|kostel svatého Jana Křtitele a svatého Prokopa římskokatolická Staroměstská 13. století Křižovatka ulic Staroměstská a Puklicova, nejstarší kostel na současném území Českých Budějovic, který exist:oval již před založením města. Bohoslužby v pátek (16:30 zimního, resp. standardního času nebo 17:30 letního času) a v neděli (8:30). kostel svaté Rodiny 120px|kostel Svaté rodiny římskokatolická Karla IV. 1886–1888 Senovážné náměstí, křižovatka ulic Karla IV. a Jirsíkova. kostel svatého Václava 120px|kostel svatého Václava římskokatolická Kostelní 1868–1870 Jižní část kostelní ulice, pod bývalým hotelem Gomel. Od října do června první úterý v měsíci od 18:00 bohoslužba slova, pravidelné boholsužby v neděli od 11:00. kostel svatého Vojtěcha 120px|kostel svatého Vojtěcha římskokatolická Emy Destinové 1938–1939 Součást farnosti svatého Vojtěcha spravované salesiány. Rozpis bohoslužeb v samostatném článku. modlitebna Adventistů sedmého dne 120px|modlitebna Adventistů sedmého dne adventisté Fráni Šrámka 34 Budova využívána od roku 1933, po revoluci vybudována nová s kapacitou 200 osob. Průčelí sálu zdobí malba na skle výtvarníka Zenkla z roku 1992. modlitebna Apoštolské církve apoštolskáRiegrova 17 První patro činžovního domu v Riegrově ulici. modlitebna Bratrské jednoty baptistů 120px|modlitebna Bratrské jednoty baptistů baptisté U Hvízdala 9a U centra Arpida, postavena někdy mezi lety 2003 a 2006. modlitebna Církve bratrské bratrská J. Š. Baara 64 Dům s pozemkem daroval sboru v roce 1906 bratr Zícha. Nová (prostornější) modlitebna otevřena roku 2000. nemocnice 120px|nemocnice, historická budova římskokatolická areál nemocnice Bohoslužby ve čtvrtek od 14 hodin (pokud je zájem).Nemocnice České Budějovice - Duchovní služba nemcb.cz; od počátku roku 2018 slouží v nemocnici kaplan Sbor Ježíše, knížete míru čsl. husitská Vítězslava Nezvala 43 1953 Suché Vrbné, bohoslužby pravidelně v neděli v 9:15.

Často se mezi budějovické kostely uvádí i katolický poutní kostel Panny Marie Bolestné v Dobré Vodě. Dobrá Voda byla ve druhé polovině 20. století součástí Českých Budějovic. Dnes je však samostatnou obcí, takže toto zařazení je sporné.

Již nevyužívané k náboženským účelům

Název Obrázek Církev Umístění Založení GaleriePopis kaple Hardtmuthovy hrobky 120px|Hardtmuthova hrobka římskokatolická Hřbitov v Mladém 1893 Zmínka o krádeži oltáře naznačuje, že byla hrobka (podobně jako jiná mauzolea, například hrobka Albina Dlouhého na hřbitově svaté Otýlie) vybavena kaplí. kaple hrobky dra A. Dlouhýho 120px|Rodinná hrobka dra A. Dlouhýho římskokatolická Hřbitov svaté Otýlie 1932 Hrobku nechal postavit starost Albin Dlouhý k příležitosti úmrtí jeho jediné dcery ve věku 18 let. Nadzemní část byla vybavena jako kaple, v současnosti zařízení chybí. kaple Krauskopfovy hrobky římskokatolická Hřbitov v Mladém 1896 Tzv. Malá kaple. V rohu hřbitova. kaple svaté Máří Magdaleny 120px|kaple svaté Máří Magdaleny, portál římskokatolická Čermákův dům 1494 Domácí kaple v soukromém domě, nevyužívaná. Datum odpovídá vysvěcení. kaple svatého Felixe a Adaukta 120px|Bílá věž, okno kaple svatého Felixe a Adaukta římskokatolická Piaristické náměstí 1489 Přízemí Bílé věže bylo upraveno a využíváno jako kaple, současný stav není známý. kostel svaté Anny 120px|kostel svaté Anny římskokatolická Kněžská 6 1615–1621 Dnes využíván Jihočeskou filharmonií jako koncertní síň Otakara Jeremiáše. Žižkův dům evangelická Lannova 27 26. dubna 1934 Českobratrský evangelický sbor r. 1934 otevřel ve druhém patře modlitebnu (kapli) poté, co musel v dubnu 1931 opustit školní kapli v Nové ul.

Neznámý stav Název Obrázek Církev Umístění Založení GaleriePopis kaple na děkanství 120px|děkanství u svatého Mikuláše římskokatolická U Černé věže 4 Kaple zmíněná jako dočasné (konec 60. až konec 80. let 20. století) umístění relikviáře svatého Auraciána, stávající stav neuveden.

Zaniklé