Ypäjän seurakunta oli seurakunta Kanta-Hämeessä, Ypäjän kunnassa. Seurakunta kuului Tampereen hiippakunnassa Tammelan rovastikuntaan. Seurakunnan vt. kirkkoherrana toimi Miikka Anttila. Vuonna 2017 seurakunnassa oli 1 946 jäsentä.
Ypäjän seurakunta perustettiin Tammelan seurakuntaan kuuluneeksi kappeliseurakunnaksi 1500-luvulla. Vuoteen 1892 sen nimenä oli Perttula. Itsenäiseksi seurakunnaksi se tuli vuonna 1903.
Ypäjän, Humppilan ja Jokioisten seurakuntien kirkkovaltuustot hyväksyivät 18. kesäkuuta 2024 seurakuntaliitoksen, jossa mainitut seurakunnat liittyvät yhdeksi seurakunnaksi, jonka nimeksi tulee Jokiläänin seurakunta. Liitos toteutui 1. tammikuuta 2026. Seurakuntaliitos oli vireillä vuodesta 2023 alkaen.
Lähteet
Luokka:Ypäjä Luokka:Suomen entiset evankelis-luterilaiset seurakunnat