De nouvelles espèces vivantes sont régulièrement définies chaque année.

L'apparition d'une nouvelle espèce dans la nomenclature peut se faire de trois manières principales : découverte dans la nature d'une espèce totalement différente de ce qui est connu jusqu'alors, nouvelle interprétation d'une espèce connue qui s'avère en réalité être composée de plusieurs espèces proches mais cependant bien distinctes. Ce mode d'apparition d'espèce est en augmentation depuis qu'il est possible d'analyser très finement le génome par des méthodes d'étude et de comparaison des ADN, ces méthodes aboutissant par ailleurs à des remaniements de la classification par une meilleure compréhension de la parenté des taxons (phylogénie). Pour ce type de création de nouvelles espèces, deux circonstances sont possibles : soit une sous-espèce déjà définie est élevée au statut d'espèce, auquel cas le nom, l'auteur et la date sont conservés, soit il est nécessaire de donner un nouveau nom à une partie de la population de l'ancienne espèce, découverte d'une nouvelle espèce par l'étude plus approfondie des spécimens conservés dans les musées et les collections.

Ces trois circonstances ont en commun d'être soumises au problème du nombre de spécialistes mondiaux compétents capables de reconnaître le caractère nouveau d'un spécimen. C'est une des raisons pour lesquelles le nombre d'espèces nouvelles chaque année, dans une catégorie taxinomique donnée, est à peu près constant.

Pour bien préciser le nom complet d'une espèce, le (ou les) auteur(s) de la description doivent être indiqués à la suite du nom scientifique, ainsi que l'année de parution dans la publication scientifique. Le nom donné dans la description initiale d'une espèce est appelé le basionyme. Ce nom peut être amené à changer par la suite pour différentes raisons.

Dans la mesure du possible, ce sont les noms actuellement valides qui sont indiqués, ainsi que les découvreurs, les pays d'origine et les publications dans lesquelles les descriptions ont été faites.

2006 Espèces vivantes décrites en 2006 Etmopterus burgessi Silva et Ebert, 2006 Requin dalatiidé. Orectolobus hutchinsi Last, Chidlow et Compagno, 2006 Requin orectolobidé découvert en Australie. Haploblepharus kistnasamyi Human et Compagno, 2006 Requin scyliorhinidé. Holohalaelurus favus Human, 2006 Requin scyliorhinidé. Holohalaelurus grennian Human, 2006 Requin scyliorhinidé. Mustelus ravidus White et Last, 2006 Requin triakidé. Mustelus widodoi White et Last, 2006 Requin triakidé. Rhinobatos jimbaranensis Last, White et Fahmi, 2006 Rhinobatidé découvert en Indonésie. Rhinobatos penggali Last, White et Fahmi, 2006 Rhinobatidé découvert en Indonésie. Notoraja hirticauda Last et McEachran, 2006 Rajidé. Antigonia socotrae Parin et Borodulina, 2006 Caproïdé découvert au Yémen. Otocinclus batmani Lehmann, 2006 Silure loricariidé découvert en Colombie et au Pérou. Son épithète spécifique fait allusion au personnage de BatmanOtocinclus batmani, a new species of hypoptopomatine catfish (Siluriformes: Loricariidae) from Colombia and Peru, Neotropical Ichthyology 4 (4) : 379-383 (2006).. Labeo fulakariensis Tshibwabwa, Stiassny et Schelly, 2006 Cyprinidé découvert en République du CongoZootaxa 1224 : 33-44.. Rutilus panosi Bogutskaya et Iliadou, 2006 Gardon découvert dans le bassin de l'Acheloos en GrèceN.G. Bogutskaya & K. Iliadou, Rutilus panosi, a new roach from Western Greece (Teleostei: Cyprinidae), Zoosystematica Rossica 14 (2) : 293-298).. Metriaclima flavifemina Konings et Stauffer, 2006 Cichlidé découvert dans le lac Malawi. Symphysodon tarzoo Espèce de discus (Cichlidés) découvert en Amazonie brésilienneReady, Ferreira et Kullander, Journal of Fish Biology 69 (Supplément B) : 200-211 (2006).. Nanochromis wickleri Schliewen et Stiassny, 2006 Cichlidé découvert en République démocratique du CongoZootaxa 1169 : 33-46.. Pseudolaguvia ferula Ng, 2006 Téléostéen éréthistidé découvert en IndeZootaxa 1229 : 59-68 (12 juin 2006). Sternarchorhynchus gnomus Taphorn et de Santana, 2006 Apteronotidé découvert dans le bas Caroni au VenezuelaIchthyological Exploration of Freshwaters, vol. 17, n°1 : 1-8 (mars 2006) Akysis longifilis Ng, 2006 Silure akysidé découvert au MyanmarZootaxa 1150 : 19-30 (14 mars 2006) Delturus brevis Reis, Pereira et Armbruster, 2006 Loricariidé Reis, Pereira et Armbruster, 2006, Zoological Journal of the Linnean Society, 147 (2) : 277-299 Ericandersonia sagamia Shinohara et Sakurai, 2006 Zoarcidé abyssal découvert au JaponShinohara et Sakurai, Ichthyological Research, 53 (2) : 172-178 Icelus sekii Tsuruoka, Munehara et Yabe, 2006 Cottidé découvert à Hokkaido au Japon. Aphanius saourensis Blanco, Hrbek et Doadrio, 2006 Cyprinodontidé Zootaxa 1158 : 39-53. Aphanius isfahanensis Hrbek, Keivany et Coad, 2006 Cyprinodontidé Aphanius opavensis Gaudant, 2006 Cyprinodontidé Schistura nagodiensis Streekantha, Gurujata, Remadevi, Indra et Ramachandra, 2006 Balitoridé découvert en IndeZoo's Print Journal 21 (4) : 2211-2216. Schistura sharavathiensis Streekantha, Gurujata, Remadevi, Indra et Ramachandra, 2006 Balitoridé découvert en Inde. Anostomoides passionis Santos et Zuanon, 2006 Anostomidé découvert au BrésilZootaxa, 1168 : 59-68 (6 avril 2006). Betta antoni Tan et Ng, 2006 Osphronémidé découvert à BornéoTan & Ng, Six new species of fighting fish (Teleostei: Osphronemidae: Betta) from Borneo, Ichthyological exploration of freshwaters, 17 (2) : 97-114.. Betta compuncta Tan et Ng, 2006 Osphronémidé découvert à Bornéo. Betta ideii Tan et Ng, 2006 Osphronémidé découvert à Bornéo. Betta krataios Tan et Ng, 2006 Osphronémidé découvert à Bornéo. Betta mandor Tan et Ng, 2006 Osphronémidé découvert à Bornéo. Betta uberis Tan et Ng, 2006 Osphronémidé découvert à Bornéo. Astyanax henseli Melo et Buckup, 2006 Characidé. Moenkhausia pankilopteryx Bertaco et Lucinda, 2006 Characidé. Rivulus gaucheri Keith, Nandrin et Le Bail, 2006 Rivulidé découvert en Guyane françaiseCybium 30 (2) : 133-137. Cryothenia amphitreta Cziko et Cheng, 2006 Notothéniidé découvert dans l'Antarctique. Espèces fossiles (2006) Tiktaalik roseae Daeschler, Shubin et Jenkins, 2006 Sarcoptérygien découvert dans le Dévonien du Canada. Acrosqualiolus mirus Adnet, 2006 Dalatiidé découvert dans l'Éocène des Landes (France) Nouvelles faunes de Sélaciens (Elasmobranchii, Neoselachii) de l'Éocène moyen des Landes (Sud-Ouest, France), Palaeo Ichthyologia, vol. 10. Eosqualiolus aturensis Adnet, 2006 Dalatiidé . Scymnodalatias cigalafulgosii Adnet, 2006 Dalatiidé . Coupatezia miretrainensis Adnet, 2006 Dasyatidé. ). L'épithète spécifique rappelle la carrière de Miretrain à Angoumé (Landes) . Orthechinorhinus pfeili Adnet, 2006 Échinorhinidé . Etmopterus cahuzaci Adnet, 2006 Etmoptéridé . Paraetmopterus nolfi Adnet, 2006 Etmoptéridé . Hemiscyllium tailledisensis Adnet, 2006 Hémiscyllidé . Hexatrygon senegasi Adnet, 2006 Hexatrygonidé . Aturobatis aquensis Adnet, 2006 Myliobatiforme . Woellsteinia kozlovi Adnet, 2006 Odontaspididé . Orectoloboides reyndersi Adnet, 2006 Orectolobidé . Pristiophorus lacipidinensis Adnet, 2006 Pristiophoridé . Raja marandati Adnet, 2006 Rajidé . Raja michauxi Adnet, 2006 Rajidé . ?Rhinobatos auribatensis Adnet, 2006. Apristurus sereti Adnet, 2006 Scyliorhinidé . Foumtizia poudenxae Adnet, 2006 Scyliorhinidé . Pararhincodon germaini Adnet, 2006 Scyliorhinidé . Platyrhizoscyllium jaegeri Adnet, 2006 Scyliorhinidé . Scyliorhinus trifolius Adnet, 2006 Scyliorhinidé . Deania angoumeensis Adnet, 2006 Squalidé . Squaliolus gasconensis Adnet, 2006 Squalidé . Torpedo acarinata Adnet, 2006 Torpédinidé . Torpedo pessanti Adnet, 2006 Torpedinidé . Triakis chalossensis Adnet, 2006 Triakidé . Xystrogaleus cappettai Adnet, 2006 Triakidé .

2007 Espèces vivantes décrites en 2007 Atelomycterus marnkalha Jacobsen et Bennett, 2007 Scyliorhinidé découvert en AustralieZootaxa 1520 : 19-36.. Cirrhigaleus australis White, Last et Stevens, 2007 Squalidé découvert dans le sud-ouest du PacifiqueZootaxa 1560 : 19-30.. Squalus chloroculus Last, White et Motomura, 2007 Squalidé découvert en Australie. Squalus crassispinus Last, Edmunds et Yearsley, 2007 Squalidé. Squalus nasutus Last, Marshall et White, 2007 Electrolux addisoni Compagno et Heemstra, 2007 Raie électrique (Narkidés) découverte en Afrique du sud en 1984 (photographies). L'épithète spécifique est dédiée à Marc Addison, qui a collecté l'holotype A new genus and species of electric ray from the east coast of South Africa (Rajiformes: Torpedinoidei: Narkidae), with a review of torpedinoid taxonomy, Smithian Bulletin 7 : 15-49.. Zearaja maugeana Last et Gledhill, 2007 Rajidé découvert en Tasmanie (Australie) Zootaxa 1494 : 45-65.. Apogon seminigracaudus Greenfield, 2007 Apogonidé. Apteronotus galvisi Ng, 2007 Aptéronotidé découvert en Colombie. L'épithète spécifique est dédiée à l'ichthyologiste colombien German Galvis. Grammonus yunokawai Nielsen,2007 Bythitidé découvert dans les îles Ryukyu (Japon). Pseudoscopelus bothrorrhinos Melo, Walker & Klepadlo, 2007 Chiasmodontidé Pseudoscopelus lavenbergi Melo, Walker & Klepadlo, 2007 Chiasmodontidé Pangio elongata Britz et Maclaine, 2007 Cobitidé. Pangio lumbriciformis Britz et Maclaine, 2007 Cobitidé. Pangio signicauda Britz et Maclaine, 2007 Cobitidé. Alburnus demiri Ozulug & Freyhof, 2007 Cyprinidé découvert en Turquie. Alburnus leobergi Freyhof et Kottelat, 2007 Cyprinidé découvert dans le bassin de la mer d'Azov. L'épithète spécifique honore l'ichthyologue russe Leo S. BergReview of the Alburnus mento species group with description of two new species (Teleostei: Cyprinidae), Ichthyological Exploration of Freshwaters, 18 (3) : 213-225.. Alburnus sarmaticus Freyhof et Kottelat, 2007 Cyprinidé découvert dans le Danube Alburnus vistonicus Freyhof et Kottelat, 2007 Cyprinidé découvert dans l'est de la GrèceAlburnus vistonicus, a new species of shemaya from eastern Greece, with remarks on Chalcalburnus chalcoides macedonicus from Lake Volvi (Teleostei: Cyprinidae), Ichthyological Exploration of Freshwaters, 18 (3) : 205-212.. Balantiocheilos ambusticauda Ng et Kottelat, 2007 Cyprinidé découvert dans la péninsule indochinoiseZootaxa 1463 : 13-20.. Celestichthys margaritatus Roberts, 2007 Cyprinidé. Chondrostoma olisiponensis Gante, Santos et Alves, 2007 Découvert dans le bassin du Tage au PortugalZootaxa 1616 : 23-35.. Cyclocheilichthys schoppeae Cervancia et Kottelat, 2007 Cyprinidé découvert dans les îles PalawanThe Raffles Bulletin of Zoology 55 (1) : 141-145.. Labeo meroensis Moritz, 2007 Cyprinidé découvert dans le NilDescription of a new cyprinid species, Labeo meroensis n. sp (Teleostei: Cyprinidae), from the River Nile, Zootaxa, 1612: 55-62 (10 Oct. 2007).. Phoxinus bigerri Kottelat, 2007 Cyprinidé décrit de France (bassin de l'Adour) et d'Espagne Phoxinus septimaniae Kottelat, 2007 Cyprinidé décrit du Languedoc (France) Phoxinus strymonicus Kottelat, 2007 Cyprinidé décrit du bassin du Strymon (Grèce) Pseudophoxinus alii Küçük, 2007 Cyprinidé découvert dans les rivières Aksu, Ilica et Kômürcüler, en TurquiePseudophoxinus alii (Teleostei: Cyprinidae), a new fish species from the Antalya Region, Turkey, Turkish Journal of Zoology 31 : 99-106 (2007).. Puntius ater Linthoingambi et Vishwanath, 2007 Cyprinidé découvert en IndeZootaxa 1450 : 45-56.. Puntius khugae Linthoingambi et Vishwanath, 2007 Cyprinidé découvert en Inde. Squalius castellanus Doadrio, Perea et Alonso, 2007 Cyprinidé découvert en EspagneA new species of the genus Squalius Bonaparte, 1837 (Actinopterygii, Cyprinidae) from the Tagus river bassin (Central Spain), Graellsia 63 (1) : 89-100.. Squalius laietanus Doadrio, Kottelat et de Sostoa, 2007