La saison 2008-2009 de l'Olympique de Marseille (OM) est marquée par une course au titre de champion de France de Ligue 1, se terminant par une place de dauphin des Girondins de Bordeaux, comme dix ans auparavant. En Coupe d'Europe, le club est éliminé en quarts de finale de la Coupe UEFA par le Chakhtior Donetsk, futur vainqueur de l'épreuve, après avoir été éliminé en phase de poule de la Ligue des champions. Du côté des coupes nationales, l'aventure est courte avec une élimination en seizièmes de finale que ce soit en Coupe de France ou en Coupe de la Ligue.
La saison est aussi mouvementée sur le plan extra-sportif avec la non-reconduction du contrat d'Eric Gerets en fin de saison et le départ du président Pape Diouf.
Préparation d'avant-saison right|thumb|Supporters au Stade Armandie lors du match amical OM-Bordeaux Avant même le début du championnat, l'Olympique de Marseille se démarque médiatiquement des autres équipes. En effet, tous les matches de préparation de l'OM sont diffusés sur Sport+, W9 ou Canal+ Sport en direct. Le groupe olympien pour le stage à Evian est le suivant : Gardiens : Mandanda, Riou, Munoz, Nepogodov Défenseurs : Bonnart, Taiwo, Zubar, Civelli, Hilton, Erbate, Givet, Rodriguez Milieux : Cana, Cheyrou, Kaboré, M'Bami, Ben Arfa, Zenden, Ziani, Krstic, Valbuena Attaquants : Niang, Cissé, Grandin
L'équipe commence difficilement sa préparation avec deux défaites et un match nul en trois matches. Lors de leur unique stage à Évian, l'OM s'impose face aux Suisses de Neuchâtel Xamax et dès lors retrouve le goût de la victoire face au vice-champion bordelais, à l'AS Monaco et l'AC Ajaccio. Ce match du contre l'AC Ajaccio est organisé dans le cadre d'un hommage à Michel Moretti, ancien président de l'ACA, la victoire de l'Olympique de Marseille leur permet d'être les premiers vainqueurs du Challenge Michel Moretti.
Le , le club boucle sa campagne d'abonnement : abonnés ont été recensés, ce qui montre l'engouement pour cette nouvelle saison : un sondage CSA/Le Parisien place l'OM comme principal concurrent de l'Olympique lyonnais pour la course au titre.
Faits marquants de la saison Début de saison en fanfare C'est avec un statut de favori que l'Olympique de Marseille se déplace à Rennes pour la première journée du Championnat de France de football L1 2008-2009. Après cinq minutes de jeu l'OM est mené 1-0 sur un but de Olivier Thomert qui marque le premier but de la saison 2008-2009. Ce but réveille les Marseillais qui marquent par trois fois avant la mi-temps: Bakari Koné (), Hatem Ben Arfa () et Mamadou Niang () (1-3). Mais les Bretons reviennent à hauteur grâce à un doublé de Thomert (), qui réalise le premier doublé de la saison, puis un but malchanceux de Steve Mandanda contre son camp (). Alors qu'on file tout droit vers un match nul, Elliot Grandin, rentré un quart d'heure plus tôt, marque (90+). L'Olympique de Marseille croit alors avoir fait le plus dur mais juste après le coup d'envoi, Bruno Cheyrou parvient à égaliser à la dernière seconde. L'arbitre siffle et le match se finit sur le score de 4-4.
La pression commence à monter sur les Marseillais. Alors que le jeu offensif régale les supporters, la défense fait peur. L'OM se déplace en Norvège pour jouer le SK Brann en tour préliminaire de Ligue des champions. Ronald Zubar remplace Elamin Erbate et la défense est convaincante. L'OM prend une bonne option sur la qualification en gagnant 1-0 sur un but de Benoit Cheyrou.
L'Olympique de Marseille enchaîne alors sur une large victoire à domicile contre l'AJ Auxerre devant plus de (4-0).
Avec huit buts en deux matchs, l'OM est la meilleure attaque après la deuxième journée. Le samedi , un bus de supporters de l'Olympique de Marseille, plus précisément de l'association MTP (Marseille Trop Puissant), est impliqué dans un accident sur l'A6 faisant deux morts et 28 blessés dont quatre gravement. Pape Diouf demande d'abord le report du match. Mais après réflexion, il déclare sur le site du club qu'après avoir discuté avec les différents partis impliqués, l'OM jouera contre Le Havre AC pour ces supporters. L'OM s'impose dans la douleur 1-0 grâce à un coup franc de Boudewijn Zenden.
Encore sous le choc de l'accident du bus de supporters, l'OM reçoit SK Brann pour une qualification en phase de poule de la Ligue des champions, importante sportivement et économiquement. Bien que largement donné favori, c'est au terme d'un match serré que l'OM vient à bout du SK Brann 2 buts à 1, grâce à un doublé du buteur Mamadou Niang. L'ouverture du score arrive après la mi-temps. Niang profite d'une incompréhension entre un défenseur et le gardien du club norvégien. Brann Bergen revient à la marque d'un but de la tête avant de lâcher prise sur une nouvelle erreur défensive qui permet à Niang, opportuniste, de réaliser un doublé et d'offrir à l'Olympique de Marseille une deuxième qualification consécutive pour les phases de poule de la Ligue des champions de l'UEFA 2008-2009, ce qui est une première dans l'histoire du club (avant 1993, la C1 ne comportait pas de phases de poules).
Le lendemain, le 28 août 2008, à 18 heures, a lieu le tirage au sort de la Ligue des champions de l'UEFA 2008-2009. Marseille a été tiré dans le groupe D avec le Liverpool FC, le PSV Eindhoven et l'Atlético de Madrid.
Le samedi , l'OM reçoit le FC Sochaux, en étant invaincu. Ben Arfa est forfait pour ce match en raison d'une pubalgie. À la , Elamin Erbate se blesse et cède sa place à Lorik Cana au poste de défenseur central. Karim Ziani marque après une action individuelle (). Sur un centre de Niang, Bakari Koné marque le deuxième. Alors que l'OM file vers une victoire facile, Sochaux réduit l'écart grâce à un but de Mevlüt Erding (2-1). Steve Mandanda sauve plusieurs fois l'OM grâce à des arrêts décisifs jusqu'au coup de sifflet final. Marseille, avec 10 points, reste en tête du classement.
Mauvais mois de septembre Après la trêve internationale de deux semaines, l'Olympique de Marseille se rend chez les Girondins de Bordeaux quelques jours avant que les deux clubs ne commencent les phases de poule de la Ligue des champions. Dès la deuxième minute, Bakari Koné ouvre le score sur un centre de Mamadou Niang (1-0). Le match est alors lancé sur de bonnes bases et on va d'un but à l'autre. À la , Yoann Gourcuff trouve Marouane Chamakh qui, après avoir fait un une-deux avec Yoan Gouffran, bat Mandanda (1-1). La seconde période sera marquée par de nombreuses actions qui échoueront de peu et par la rentrée en jeu de Mathieu Valbuena après sa longue blessure (). Après ce match nul à l'extérieur, l'OM descend à la à deux longueurs de l'Olympique lyonnais.
Encore invaincu en match officiel cette année, l'OM entame son parcours européen en recevant un des plus grands clubs d'Europe : Liverpool FC. L'OM commence bien le match en ouvrant le score grâce à Lorik Cana à la (1-0). Mais alors que l'OM domine, Steven Gerrard, sur une passe de Dirk Kuyt, enroule une frappe du pied gauche qui termine dans le but de Steve Mandanda, seulement 3 minutes après l'ouverture du score. Gerrard réussira même un doublé sur penalty quelques minutes plus tard, après une faute de Ronald Zubar sur Ryan Babel (1-2). L'OM subit sa première défaite de la saison en match officiel.
Face à une équipe de Monaco regroupée en défense, Marseille n'arrive pas à marquer et se fait peur à plusieurs reprises. Après ce match nul, Marseille est à 4 points de l'Olympique lyonnais.
C'est dans un climat de doute que l'OM se déplace à Sochaux en de finale de la Coupe de la Ligue. Grâce à un but de Mevlüt Erding, Sochaux élimine Marseille 1-0.
Marseille se doit de gagner pour rester au contact, et cela passe par une victoire au stade Léon-Bollée au Mans. L'OM ouvre le score grâce à Hatem Ben Arfa à la . Le Mans revient rapidement au score (). Mamadou Samassa met une tête qui finit sur la ligne ou dans le but… l'arbitre estime qu'il n'y a pas but et on en reste à 1-1. Marseille n'a pas gagné un match depuis le . Malgré cette mauvaise série, Marseille reste troisième, derrière Toulouse et l'Olympique lyonnais.
Octobre : déjà un tournant
Deux matchs de Ligue des champions et le derby contre le Paris Saint-Germain, c'est ce qui attend l'OM en octobre avec une obligation de résultats pour ne pas se mettre en mauvaise position dans la phase de poule de la Ligue des champions et ne pas laisser Lyon filer au titre pour une .
Le mois d'octobre commence par le match de coupe d'Europe contre l'Atlético de Madrid. Diego Forlán absent, il est remplacé par le Français Florent Sinama-Pongolle à la tête de l'attaque madrilène. Sergio Agüero est bien présent et ne met que deux minutes à montrer son talent ; un contrôle parfait et une frappe du pied droit à ras de terre permet à l'Atlético de mener après deux minutes de jeu (1-0). Marseille réagit un quart d'heure plus tard, sur un centre au deuxième poteau de Laurent Bonnart : Mamadou Niang, seul, met une tête au fond des filets (1-1). Quelques minutes plus tard, Taye Taiwo fait une faute à une vingtaine de mètres de ses buts et reçoit un carton jaune. Et sur le coup franc, l'Atlético reprend l'avantage (2-1). Marseille n'arrivera plus à marquer malgré de nombreuses occasions, et s'incline pour la deuxième fois en deux matchs en Ligue des champions.
Après le 6-1 de la saison précédente, les supporters marseillais attendent la victoire de leur équipe pour la venue du Stade Malherbe de Caen. En effet, Marseille n'a pas connu la victoire lors de ses 6 derniers matchs (N-D-N-D-N-D). Hatem Ben Arfa libère d'abord le Vélodrome à la deuxième minute d'une belle frappe du gauche (1-0). Mais les Caennais se reprennent, et sur une erreur défensive, Steve Savidan égalise à 1-1 (). Niang délivre les supporters d'une tête après une frappe de Ben Arfa sur la transversale (, 2-1). Le match se termine sur le score de 2-1, ce qui permet à Marseille de se relancer ( à 3 points du leader lyonnais) et d'être la seule équipe encore invaincue en championnat.
Marseille se déplace à Valenciennes le dimanche en l'occasion de la de Ligue 1. Dès la , l'Olympique de Marseille ouvre le score par l'intermédiaire de Bakari Koné, opportuniste après une frappe de Mathieu Valbuena sur la barre. À la , à la suite d'un bon travail de Koné plein axe, Niang trouve Ben Arfa dans la profondeur qui déborde d'un crochet le gardien valenciennois et pousse la balle au fond des filets (2-0). Pujol réduit l'écart à la pour VA. Kaboré scelle la victoire olympienne dans les arrêts de jeu (+3).
Seulement trois jours plus tard, Marseille se déplace au PSV Eindhoven pour la des phases de poule de la Ligue des champions avec déjà six points de retard sur Liverpool FC et l'Atletico Madrid. Tout comme l'OM, le PSV a perdu ces deux premières rencontres. Danny Koevermans réalise un doublé et permet à Eindhoven de remporter le match 2-0.
Marseille reçoit Paris pour le derby. Diffusé en direct sur Canal+, il se déroule le dimanche à 21h. Guillaume Hoarau ouvre le score de la tête à la sur un corner de Jérôme Rothen (0-1). Mamadou Niang égalise à la (1-1) avant que Mathieu Valbuena ne donne l'avantage à l'OM juste avant la mi-temps (, 2-1). La deuxième mi-temps est à sens unique. Peguy Luyindula puis Jérôme Rothen permettent au Paris Saint-Germain de prendre l'avantage avant que Guillaume Hoarau ne scelle la victoire parisienne, s'offrant un doublé (2-4). Au terme d'un match ouvert, c'est le Paris Saint-Germain qui s'impose sur le score de 4-2. C'est la première défaite de la saison 2008-2009 de l'Olympique de Marseille en championnat. Plus aucune équipe n'est invaincue en Ligue 1 après la défaite de l'Olympique de Marseille.