Liste d'espèces eubactériennes dont le génome est séquencé

Cette liste d'espèces eubactériennes dont le génome est séquencé (qui peut ne pas être à jour) présente une liste d'espèces d'Eubacteria dont le génome a été séquencé. La plupart de ces séquences ont été publiées dans des bases de données biologiques de séquences, et se trouvent en général dans la base de données publique INSDB (pour , en anglais), laquelle peut-être consultée sur Internet Search for details on specific genomes by organism name and strain.. Les génomes ci-dessous annotés comme "non publiés" n'ont pas été publiés dans une publication scientifique à comité de lecture (mais sont généralement disponibles dans une base de données).

Chlorobacteria

+ Espèces eubactériens dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceDehalococcoides etheno195Chloroflexi Dehalococcoidetes1,469,7201,580Dehalococcoides speciesCBDB1Chloroflexi Dehalococcoidetes1,395,5021,458

Hadobacteria

+ Espèces eubactériens dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceDeinococcus geothermalisDSM11300Deinococcus-Thermus Deinococci2,467,2052,335Non publiéDeinococcus radioduransR1Deinococcus-Thermus Deinococci2,648,6382,579Non spécifiéNon spécifiéDeinococcus-Thermus Deinococci412,348357Thermus thermophilusHB27Deinococcus-Thermus Deinococci1,894,8771,982Thermus thermophilusHB8Deinococcus-Thermus Deinococci1,849,7421,973Non publié

Cyanobacteria

+ Espèces eubactériens dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceAnabaena nostocPCC7120Cyanobacteria Nostocales6,413,7715,368DNA Res. 2001 Oct 31;8(5):205-13, 8(5):205-13; 227-53Anabaena variabilisATCC29413Cyanobacteria Nostocales6,365,7275,039Non publiéCyanobacteria bacteriumYellowstoneACyanobacteria Chroococcales2,932,7662,760Cyanobacteria bacteriumYellowstoneBCyanobacteria Chroococcales3,046,6822,862Gloeobacter violaceusPCC7421Cyanobacteria Gloeobacteria4,659,0194,430Prochlorococcus marinusMED4Cyanobacteria Prochlorales1,657,9901,716Prochlorococcus marinusMIT9312Cyanobacteria Prochlorales1,709,2041,809Non publiéProchlorococcus marinusMIT9313Cyanobacteria Prochlorales2,410,8732,273Prochlorococcus marinusNATL2ACyanobacteria Prochlorales1,842,8991,890Non publiéProchlorococcus marinusSS120Cyanobacteria Prochlorales1,751,0801,882Synechococcus elongatusPCC6301Cyanobacteria Chroococcales2,696,2552,525Non publiéSynechococcus elongatusPCC7942Cyanobacteria Chroococcales2,695,9032,611Non publiéSynechococcus spWH8102Cyanobacteria Chroococcales2,434,4282,526Synechococcus speciesCC9605Cyanobacteria Chroococcales2,510,6592,638Non publiéSynechococcus speciesCC9902Cyanobacteria Chroococcales2,234,8282,304Non publiéSynechocystis speciesPCC6803Cyanobacteria Chroococcales3,573,4703,167Thermosynechococcus elongatusbp1Cyanobacteria Chroococcales2,593,8572,475Non publié

Gracilicutes

Spirochaetes

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceBorrelia burgdorferiB31Spirochaetes910,724850Borrelia gariniiPBiSpirochaetes904,246832Leptospira interrogans56601Spirochaetes4,332,2414,358Non spécifiéNon spécifiéSpirochaetes358,943367Leptospira interrogansFiocruzL1130Spirochaetes4,277,1853,394Non spécifiéNon spécifiéSpirochaetes350,181264Treponema denticolaATCC35405Spirochaetes2,843,2012,767Treponema pallidumNicholsSpirochaetes1,138,0111,031

Sphingobacteria

Bacteroidetes

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceBacteroides fragilisNCTC9343Bacteroidetes/Chlorobi Bacteroidetes5,205,1404,260Bacteroides fragilisYCH46Bacteroidetes/Chlorobi Bacteroidetes5,277,2744,578Non publiéBacteroides thetaiotaomicronVPI5482Bacteroidetes/Chlorobi Bacteroidetes6,260,3614,778Chlorobium chlorochromatiiCaD3Bacteroidetes/Chlorobi Chlorobi2,572,0792,002Non publiéChlorobium tepidumTLSBacteroidetes/Chlorobi Chlorobi2,154,9462,255Cytophaga hutchinsoniiATCC33406Bacteroidetes/Chlorobi Chlorobi4,433,218Non publiéPelodictyon luteolumDSM273Bacteroidetes/Chlorobi Chlorobi2,364,8422,083Non publiéPorphyromonas gingivalisW83Bacteroidetes/Chlorobi Bacteroidetes2,343,4761,909Salinibacter ruberDSM13855Bacteroidetes/Chlorobi Bacteroidetes3,551,8232,801

Exoflagellata

Planctomycetales

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceRhodopirellula balticastrain1Planctomycetes Planctomycetacia7,145,5767,325Non publié

Chlamydiae

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceChlamydia muridarumNiggChlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,072,950904Chlamydia trachomatisAHAR13Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,044,459911Chlamydia trachomatisDUWChlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,042,519894Chlamydophila abortusS26-3Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,144,377961Chlamydophila caviaeGPICChlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,173,390998Chlamydophila felisFeC56Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,166,2391,005Non publiéChlamydophila pneumoniaeAR39Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,229,8531,110Chlamydophila pneumoniaeCWL029Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,230,2301,052Chlamydophila pneumoniaeJ138Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,226,5651,069J Infect Dis. 2000 Jun, 181 Suppl 3:S524-7Chlamydophila pneumoniaeTW183Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae1,225,9351,113Non publiéParachlamy diaspeciesUWE25Chlamydiae/Verrucomicrobia Chlamydiae2,414,4652,031

Acidobacteria

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceAcidobacteria bacteriumEllin345Acidobacteria5,650,3684,777Non publiéBifidobacterium longumNCC2705Acidobacteria2,256,6401,727Corynebacterium diphtheriaeNCTC13129Acidobacteria2,488,6352,320Corynebacterium diphtheriaeNCTC13129Acidobacteria2,488,6352,320Corynebacterium efficiensYS314Acidobacteria3,147,0902,942Corynebacterium glutamicumATCC13032Acidobacteria3,309,4013,099Non publiéNon spécifiéNon spécifiéAcidobacteria3,282,7083,058Corynebacterium jeikeiumK411Acidobacteria2,462,4992,104Frankia speciesCcI3Acidobacteria5,433,6284,499Non publiéLeifsonia xyliCTCB07Acidobacteria2,584,1582,030Non publiéMycobacterium aviumk10Acidobacteria4,829,7814,350Mycobacterium bovisAF212297Acidobacteria4,345,4923,953Mycobacterium lepraeTNAcidobacteria3,268,2032,720Mycobacterium tuberculosisCDC1551Acidobacteria4,403,8374,189Non publiéMycobacterium tuberculosisH37RvAcidobacteria4,411,5323,999Nocardia farcinicaIFM10152Acidobacteria6,021,2255,683Propionibacterium acnesKPA171202Acidobacteria2,560,2652,297Non publiéRubrobacter xylanophilusDSM9941Acidobacteria3,225,7483,140Non publiéStreptomyces avermitilisMA4680Acidobacteria9,025,6087,577Streptomyces coelicolorA3Acidobacteria8,667,5077,825Symbiobacterium thermophilumStrainAcidobacteria3,566,1353,337Thermobifida fuscaYXAcidobacteria3,642,2493,110Non publiéTropheryma whippeliiTW0827Acidobacteria925,938784Non publiéTropheryma whippeliiTwistAcidobacteria927,303808

Aquificales

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceAquifex aeolicusVF5Aquificae Aquificae1,551,3351,522

Proteobacteria

Thermotogales

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceThermotoga maritimaMSB8Thermotogae1,860,7251,846

Fusobacteriales

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceFusobacterium nucleatumATCC25586Fusobacteria Fusobacteria2,174,5002,067

Posibacteria

Endobacteria

Mollicutes

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceMesoplasma florumL1Firmicutes Mollicutes793,224683Non publiéMycoplasma capricolumATCC27343Firmicutes Mollicutes1,010,023812Non publiéMycoplasma gallisepticumRFirmicutes Mollicutes996,422726Mycoplasma genitaliumG37Firmicutes Mollicutes580,076476Mycoplasma hyopneumoniae232Firmicutes Mollicutes892,758691Mycoplasma hyopneumoniae7448Firmicutes Mollicutes920,079663Mycoplasma hyopneumoniaeJFirmicutes Mollicutes897,405665Mycoplasma mobile163KFirmicutes Mollicutes777,079635Mycoplasma mycoidesSCFirmicutes Mollicutes1,211,7031,016Mycoplasma penetransHF2Firmicutes Mollicutes1,358,6331,037Mycoplasma pneumoniaeM129Firmicutes Mollicutes816,394688Mycoplasma pulmonisUABFirmicutes Mollicutes963,879782Mycoplasma synoviae53Firmicutes Mollicutes799,476672Phytoplas maasterisAYWBFirmicutes Mollicutes706,569671Non publiéPhytoplas maasterisOYFirmicutes Mollicutes860,631754Ureaplasma urealyticumserovar3Firmicutes Mollicutes751,719611

Clostridia

+ Espèces eubactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceCarboxydothermus hydrogenoformansZ2901Firmicutes Clostridia2,401,5202,620Non publiéClostridium acetobutylicumATCC824Firmicutes Clostridia3,940,8803,672Clostridium difficileQCD-32g58Firmicutes Clostridia3,840,681Non publiéClostridium perfringens13Firmicutes Clostridia3,031,4302,660Clostridium tetaniE88Firmicutes Clostridia2,799,2512,373Desulfitobacterium hafnienseY51Firmicutes Clostridia5,727,5345,060Moorella thermoaceticaATCC39073Firmicutes Clostridia2,628,7842,465Non publiéThermoanaerobacter tengcongensisMB4TFirmicutes Clostridia2,689,4452,588Non publié

Bacilli