Caenorhabditis est un genre de nématodes vivant dans des environnements riches en bactéries. Il contient l’organisme modèle Caenorhabditis elegans, ainsi que de nombreuses autres espèces dont le génome a été séquencé.
Le nom est formé des deux racines grecques caeno- (καινός (caenos), récent), et rhabditis (ῥάβδος (rhabdos), tige, bâton).
Liste d'espèces Selon , le genre appartient à la sous-famille des Peloderinae avec les genres Pellioditis et Pelodera, et comprend les espèces suivantes : Caenorhabditis afra Caenorhabditis angaria Caenorhabditis astrocarya Caenorhabditis becei Caenorhabditis brenneri Caenorhabditis briggsae Caenorhabditis briggsae AF16 Caenorhabditis briggsae x Caenorhabditis nigoni Caenorhabditis castelli Caenorhabditis dolens Caenorhabditis doughertyi Caenorhabditis drosophilae Caenorhabditis elegans Caenorhabditis guadeloupensis Caenorhabditis imperialis Caenorhabditis inopinata Caenorhabditis japonica Caenorhabditis kamaaina Caenorhabditis latens Caenorhabditis macrosperma Caenorhabditis maupasi Caenorhabditis monodelphis Caenorhabditis nigoni Caenorhabditis nouraguensis Caenorhabditis nouraguensis x Caenorhabditis becei Caenorhabditis panamensis Caenorhabditis parvicauda Caenorhabditis plicata Caenorhabditis portoensis Caenorhabditis quiockensis Caenorhabditis remanei Caenorhabditis sinica Caenorhabditis sonorae Caenorhabditis sulstoni Caenorhabditis tribulationis Caenorhabditis tropicalis Caenorhabditis uteleia Caenorhabditis virilis Caenorhabditis vivipara Caenorhabditis waitukubuli Caenorhabditis wallacei Caenorhabditis yunquensis Caenorhabditis zanzibari autres espèces de Caenorhabditis non nommées : Caenorhabditis sp. 1 TAC-2019 Caenorhabditis sp. 1 TWN1898 Caenorhabditis sp. 10 JR-2014 Caenorhabditis sp. 10 TWN510 Caenorhabditis sp. 11 RJ-2013 Caenorhabditis sp. 16 NG-2017 Caenorhabditis sp. 2 KK-2011 Caenorhabditis sp. 2 TWN2542 Caenorhabditis sp. 21 LS-2015 Caenorhabditis sp. 23 AD-2012 Caenorhabditis sp. 26 LS-2015 Caenorhabditis sp. 3 TWN2594 Caenorhabditis sp. 31 LS-2015 Caenorhabditis sp. 32 LS-2015 Caenorhabditis sp. 38 MB-2015 Caenorhabditis sp. 39 LS-2015 Caenorhabditis sp. 4 TWN1772 Caenorhabditis sp. 40 LS-2015 Caenorhabditis sp. 43 LS-2015 Caenorhabditis sp. 5 GVDU-2019 Caenorhabditis sp. 6 TWN1824 Caenorhabditis sp. 7 GVDU-2019 Caenorhabditis sp. 8 KK-2011 Caenorhabditis sp. 8 TWN1907 Caenorhabditis sp. 9 AC-2009 Caenorhabditis sp. 9 TWN2033 Caenorhabditis sp. DF5070 Caenorhabditis sp. JLR-2009 Caenorhabditis sp. JU727 Caenorhabditis sp. SB341
Selon : Caenorhabditis briggsae Caenorhabditis dolichura Caenorhabditis elegans Caenorhabditis rara
Génétique Liste des espèces séquencées Caenorhabditis brenneri - génome séquencé Caenorhabditis briggsae - génome séquencé en 2003 Caenorhabditis elegans - génome séquencé en 1998 Caenorhabditis japonica - génome séquencé Caenorhabditis remanei - génome séquencé
Études phylogénétiques
Une étude phylogénétique réalisée en 2014 révèle la présence de deux super-groupes, 'Elegans' et 'Drosophilae et de deux groupes ('Elegans' et 'Japonica') au sein du super-groupe 'Elegans'. Cette étude révèle aussi que C. nigoni est l'espèce-sœur de C. briggsae tandis que C. elegans est seul, basal dans le groupe 'Elegans' Félix, Marie-Anne; Braendle, Christian; Cutter, Asher D. (April 11, 2014). "A Streamlined System for Species Diagnosis in Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) with Name Designations for 15 Distinct Biological Species". PLOS ONE. 9: e94723. .
Une autre étude de 2019 ajoute C. inopinata comme espèce la plus proche de C. elegans. Elle révèle aussi que C. monodelphis'' est l'espèce la plus basale dans l'arbre phylogénétique Comparative genomics of 10 new Caenorhabditis species. Lewis Stevens, Marie‐Anne Félix, Toni Beltran, Christian Braendle, Carlos Caurcel, Sarah Fausett, David Fitch, Lise Frézal, Charlie Gosse and Taniya Kaur, Evolution Letters, Volume3, Issue2, April 2019, Pages 217-236, ..
Notes et références
Liens externes
Catégorie:Rhabditidae Catégorie:Genre de nématodes (nom scientifique)