Treća hrvatska nogometna liga je u sezoni 1999./2000. igrana u pet skupina – Istok, Jug, Sjever, Središte i Zapad.
Istok
PoredakKlubUtakmicaPobjedaNeodlučenoPorazaPostigli golovaPrimili golovaGol-razlikaBodovaSljedeća sezona1. Papuk Velika 30 24 6 0 88 19 +69 78 2. HNL 2000./01.2. Grafičar Vodovod Osijek 30 20 8 2 94 28 +66 683. HNL – Istok 2000./01.3. Metalac Koteks Osijek 30 20 2 8 76 35 +41 624. Valpovka – Satnica Valpovo 30 16 6 8 63 37 +26 545. Sloga Nova Gradiška 30 14 7 9 38 28 +10 496. Dilj Vinkovci 30 13 4 13 39 41 -2 437. Bedem Ivankovo 30 12 6 12 34 43 -9 428. Slavonac Stari Perkovci 30 9 8 13 54 63 -9 359. Vitez '92 Antunovac 30 9 6 15 51 45 +6 3310. NAŠK Našicecement Našice 30 9 6 15 32 54 -22 33 11. Slobodnica 30 10 3 17 40 74 -34 3312. Olimpija Osijek 30 7 11 12 42 51 -9 3213. Lokomotiva Vinkovci 30 9 5 16 39 55 -16 3214. Graničar Županja 30 8 5 17 38 72 -34 291. ŽNL 2000./01.15. Amater Slavonski Brod 30 8 3 19 37 80 -43 271. ŽNL 2000./01.16. Croatia Đakovo 30 6 6 18 32 72 -40 241. ŽNL 2000./01.
Jug
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- bod1. Hrvatski vitez Posedarje 29 19 6 4 49 22 632. Imotska Krajina Proložac 29 17 8 4 4 15 593. GOŠK 1919 Dubrovnik 29 16 8 5 44 20 564. Neretva Metković 29 14 6 9 46 39 485. Primorac Stobreč 29 13 4 12 41 53 436. Junak Sinj 29 13 1 15 35 33 407. Val Kaštel Stari 29 11 7 11 29 34 408. Primorac Biograd na Moru 29 12 3 14 37 45 399. Velebit Benkovac 29 11 3 15 33 35 3610. Jadran Ploče 29 10 5 14 34 44 3511. Poljičanin Srinjine 29 9 7 13 38 42 3412. Omiš 29 9 7 13 33 40 3413. Orkan Dugi Rat 29 9 6 14 39 40 3314. Dinara Knin 29 9 4 16 24 37 3115. Imotski 29 8 5 16 27 38 2916. Raštane (Gornje Raštane) 15 4 2 9 15 36 14Raštane odustale tokom zimske pauze
Sjever
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- bod1. Koprivnica 28 23 3 2 102 21 722. Sloboda Varaždin 28 20 5 3 107 16 653. Podravac Virje 28 19 5 4 78 33 624. Tišljar Ivančica Ivanec 28 15 5 78 70 34 49 (-1)5. Trnje Trnovac 28 11 6 11 51 41 396. Omladinac Sloga Herešin 28 10 6 12 41 50 367. Graničar Kotoriba 28 11 3 14 39 48 368. Pitomača 28 9 7 12 46 59 349. Sloga Čakovec 28 11 1 16 49 85 3410. Garić Garešnica 28 10 4 14 42 99 3411. Omladinac Novo Selo Rok 28 9 6 13 52 46 3312. Mladost Ždralovi 28 9 6 13 41 58 3313. Križevci 28 5 10 13 32 51 2514. Podravska Slatina 28 5 5 18 27 79 2015. Budućnost Hodošan 28 3 6 19 38 95 15 Mladost-Nada Hrastovac odustala tijekom prvog dijela sezone''
Središte
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- bod1. TŠK Topolovac 28 22 2 4 72 24 682. Karlovac 28 17 7 4 50 17 583. Trnje Zagreb 28 17 4 7 59 32 554. Dugo Selo 28 14 6 8 46 29 485. Radnik Velika Gorica 28 11 5 12 39 46 386. INKER Zaprešić 28 11 4 13 50 47 377. Lokomotiva Zagreb 28 10 5 13 38 36 358. Hrašće Promil (Hrašće Turopoljsko) 28 9 8 11 32 43 359. Moslavna Kutina 28 10 5 13 38 53 3510. Samobor 28 8 9 11 41 52 3311. Špansko Zagreb 28 9 5 14 32 46 3212. Stupnik (Donji Stupnik) 28 7 10 11 32 43 3113. Oštrc Zlatar 28 7 8 13 30 37 2914. Duga Resa 28 5 9 14 25 55 2415. Ponikve Zagreb 28 4 11 13 32 56 23 Posavina Zagreb odustali u prvom dijelu prvenstva
Zapad
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- bod1. Žminj 30 18 5 7 55 31 592. Nehaj Senj 30 18 4 8 49 28 583. Uljanik Pula 30 17 6 7 56 30 574. Višnjan 30 16 6 8 61 34 545. Rovinj 30 15 6 9 59 34 516. Gospić 30 13 9 8 44 40 487. Grobničan Čavle 30 12 5 13 41 41 418. Rudar Labin 30 11 6 13 60 43 399. Buje 30 10 9 11 41 58 38 (-1)10. Opatija 30 9 10 11 33 35 3711. Pazinka Pazin 30 8 11 11 44 44 3512. Istra Tar 30 9 6 15 42 57 3313. Draga (Mošćenička Draga) 30 9 6 15 36 72 3314. Halubjan Viškovo 30 8 7 15 24 38 3115. Borac (Bakar – Hreljin) 30 6 11 13 33 50 2916. Perušić 30 5 5 20 22 65 19 (-1)
Poveznice 1. HNL 1999./2000. 2. HNL 1999./2000. 4. rang HNL-a 1999./2000. 5. rang HNL-a 1999./2000. 6. rang HNL-a 1999./2000. 7. rang HNL-a 1999./2000. Hrvatski nogometni kup 1999./2000.
Izvori RSSSF, Hrvatska 1999./2000. Darko Barišić i dr.: Osamdeset godina nogometa u Pitomači 1921. – 2001. godine, Pitomača, 2002. Stjepan Balog: HNŠK "Moslavina", Kutina : 85 godina, Kutina, 2004., str. 88-89,
1999./00. 3