Hrvatski nogometni kup 2003./04. bio je trinaesti Hrvatski nogometni kup. Naslov je branio Hajduk Split, a kup je osvojio Dinamo Zagreb.
Pretkolo, 3. rujan {| class="wikitable" style="text-align: center" |- !Br. !Domaći sastav !Rezultat !Gostujući sastav |- |1 |Nehaj |1:0 |Vinogradar |- |2 |Crikvenica |1:1 (pr) (0:2 p) |Koprivnica |- |3 |Primorac Biograd |2:1 |Karlovac |- |4 |Neretva |2:1 (pr) |Moslavina Kutina |- |5 |Mladost Prelog |1:3 |Zagorec Krapina |- |6 |Željezničar Slavonski Brod |1:3 |Virovitica |- |7 |Udarnik Kurilovec |1:3 |Vukovar '91 |- |8 |Pula 1856 |1:0 |Slavonija Požega|- |9 |Sloga Nova Gradiška|2:1 (pr) |Graničar Županja |- |10 |Zdenka Veliki Zdenci |1:5 |Croatia Sesvete|- |11 |Sloboda Varaždin|4:1 |Čakovec |- |12 |Vodica |0:0 (pr) (2:3 p) |Valpovka|- |13 |Mosor|3:2 (pr) |Podravina |- |14 |Metalac Osijek|1:0 (pr) |Naftaš Ivanić-Grad |- |15 |Jedinstvo Omladinac |1:3 |Bjelovar|- |16 |Viktorija Vojakovac |1:1 (pr) (5:6 p) |Lučko'|}
Šesnaestina završnice, 17. rujan Br.Domaći sastavRezultatGostujući sastav1Primorac Biograd0:2Hajduk Split2Lučko0:3Dinamo Zagreb3Virovitica1:2Osijek4Valpovka0:2Varteks5Metalac Osijek1:2Cibalia6Sloga Nova Gradiška0:2NK Zagreb7Sloboda Varaždin2:6Pula 18568Vukovar '910:1Slaven Belupo9Koprivnica0:2Kamen Ingrad10Croatia Sesvete3:0Pomorac Kostrena11Nehaj1:7Rijeka12Neretva2:1 (pr)Hrvatski dragovoljac13Zagorec Krapina1:0 Šibenik14Mosor1:0Inker Zaprešić15Bjelovar3:1Belišće16Segesta1:4 Zadar
Osmina završnice, 29. listopad Br.Domaći sastavRezultatGostujući sastav1Hajduk Split3:1Zadar2Bjelovar1:4Dinamo Zagreb3Osijek3:2Mosor4Zagorec Krapina0:3Varteks5Cibalia4:3 (pr)Neretva6Rijeka3:0NK Zagreb7Croatia Sesvete2:4Pula 18568Kamen Ingrad2:0Slaven Belupo
Četvrtzavršnica, 17. ožujak (24. ožujak)
Poluzavršnica, 7. travanj (14. travanj)
Završnica Prva utakmica
Druga utakmicaDinamo Zagreb je pobijedio prema pravilu gola u gostima.''
Poveznice 1. HNL 2003./04. 2. HNL 2003./04. 3. HNL 2003./04. 4. rang HNL-a 2003./04. 5. rang HNL-a 2003./04. 6. rang HNL-a 2003./04. 7. rang HNL-a 2003./04.
Izvori https://web.archive.org/web/20131016044322/http://prva-hnl.hr/blog/hr-nogometni-kup/arhiva-rezultata/?sid=13 http://www.rsssf.com/tablesk/kroa04.html
2003.-04. kup