A 2016–2017-es Európa-liga csoportkörének mérkőzéseit 2016. szeptember 15. és december 8. között játszották le.
Fordulók és időpontok Forduló Sorsolás Játéknapok1. mérkőzésnap2016. augusztus 26.(Monaco)2016. szeptember 15.2. mérkőzésnap2016. szeptember 29.3. mérkőzésnap2016. október 20.4. mérkőzésnap2016. november 3.5. mérkőzésnap2016. november 24.6. mérkőzésnap2016. december 8.
Sorsolás A csoportkörben 12 darab, egyaránt négycsapatos csoportot képeztek. A csoportokban a csapatok körmérkőzéses, oda-visszavágós rendszerben mérkőztek meg egymással. A csoportok első két helyen záró csapat az egyenes kieséses szakaszba jutott, a harmadik és negyedik helyezettek kiestek.
A csoportkörbe a rangsor szerinti első 12 ország kupagyőztese, a 4. helyen rangsorolt bajnokság 4. helyezettje, az 1–3. helyen rangsorolt bajnokság 5. helyezettjei, valamint az UEFA-bajnokok ligája rájátszásának 10 vesztes csapat, és az Európa-liga selejtező rájátszásának 22 továbbjutója került.
Csapat Együttható Kalap Schalke 0496,0351 Zenyit93,216 Manchester United82,256 Sahtar Doneck81,976 Athletic Bilbao75,142 Olimbiakósz70,940 Villarreal CF (BL)60,142 Ajax (BL)58,112 Internazionale58,087 Fiorentina57,087 Anderlecht54,000 Viktoria Plzeň (BL)44,585 AZ43,6122 Sporting de Braga43,116 Red Bull Salzburg (BL)42,520 AS Roma (BL)41,587 Fenerbahçe SK40,920 Sparta Praha40,585 PAÓK37,440 Steaua București (BL)36,576 KRC Genk36,000 APÓEL (BL)35,935 Standard de Liège27,500 AS Saint-Étienne26,049 Csapat Együttható Kalap Young Boys (BL)24,7553 KAA Gent25,000 FK Krasznodar24,216 Rapid Wien23,520 Slovan Liberec22,085 Celta Vigo21,142 Makkabi Tel-Aviv20,225 Feyenoord19,112 Austria Wien19,020 Mainz 0518,035 FC Zürich17,755 Southampton FC16,756 Panathinaikósz14,9404 Sassuolo14,087 Qarabağ13,475 Asztana FK12,575 OGC Nice12,049 Zorja Luhanszk11,976 Astra Giurgiu11,076 Hapóél Beér-Seva (BL)10,575 Konyaspor6,920 Osmanlıspor6,920 Qəbələ PFK5,225 Dundalk FC (BL)2,590 Jegyzet BL – Az UEFA-bajnokok ligája rájátszásának vesztes csapataként került át.
Csoportok Sorrend meghatározása Az UEFA versenyszabályzata alapján, ha két vagy több csapat a csoportmérkőzések után azonos pontszámmal állt, az alábbiak alapján kellett meghatározni a sorrendet: az azonosan álló csapatok mérkőzésein szerzett több pont az azonosan álló csapatok mérkőzésein elért jobb gólkülönbség az azonosan álló csapatok mérkőzésein idegenben szerzett több gól az összes mérkőzésen elért jobb gólkülönbség az összes mérkőzésen szerzett több gól az azonosan álló csapatok és nemzeti szövetségük jobb UEFA-együtthatója az elmúlt öt évben
Minden időpont közép-európai idő/közép-európai nyári idő szerint van feltüntetve. A csoport
B csoport
C csoport
D csoport
E csoport
F csoport
A mérkőzést eredetileg 2016. december 8-án, 19 órától játszották volna, de az erős köd miatt másnapra halasztották.
G csoport
H csoport
I csoport
J csoport
K csoport
L csoport
Jegyzetek
csoportkör