bélyegkép|120px|Az Entrez logója Az Entrez (IPA: ) Global Query Cross-Database Search System összetett keresést lehetővé tevő keresőmotor vagy portál, mely lehetővé teszi több különböző orvostudományi adatbázis keresését a Biotechnológiai Információk Nemzeti Központja (NCBI) oldalán. Az NCBI a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) része, mely a Nemzeti Egészségügyi Intézet része, mely az Egyesült Államok Egészségügyi Minisztériumának része. Az „Entrez” név (mely franciául azt jelenti: „Lépjen be”) a nyilvánosság számára NLM által elérhetővé tett tartalmak keresésének lehetőségére utal.
Az Entrez globális lekérdezése integrált kereső és gyűjtőrendszer, mely lehetővé teszi minden adatbázis elérését egy lekérdezéssel és felhasználói felülettel. Hasonló szekvenciákat, szerkezeteket és hivatkozásokat is ki tud gyűjteni. Az Entrez gén- és fehérjeszekvenciák, valamint kromoszómatérképek nézeteit is be tudja mutatni. Egyes kézikönyvek elérhetők az Entrez rendszeren keresztül.
Funkciók Az Entrez kezdőlapja alapértelmezés szerint a globális lekérdezéshez nyújt hozzáférést. Minden, az Entrez által indexelt adatbázis kereshető lekérdezéssel. A rendszer támogatja a Boole-operátorokat és a keresőcímkéket a keresés adott részeinek bizonyos területekre való korlátozásához. Egységes eredménylistát ad vissza, mely minden adatbázisban megmutatja a találatszámot, melyek összefüggnek az adott adatbázis tényleges eredményeivel.
Az Entrez hasonló felületet biztosít mindegyik adatbázis keresésére és a keresési eredmények pontosítására. A Limits funkció lehetővé teszi a keresés szűkítését. A History funkció a frissen elvégzett lekérdezések számozott listáját adja. Az előző lekérdezések eredményei számmal hivatkozhatók és Boole-operátorokkal is használhatók. A keresési eredmények elmenthetők átmenetileg a vágólapra. A MyNCBI-fiókkal rendelkező felhasználók véglegesen elmenthetik kereséseiket, és kérhetik a frissítésükről szóló értesítéseket az új eredmények e-mailben való elküldésével. Gyakran használják forrásként hallgatók és tudósok egyaránt.
Adatbázisok Az Entrez az alábbi adatbázisokban keres: PubMed: orvostudományi hivatkozások és ismertetők, beleértve a Medline-t – főleg orvosi folyóiratokból származó cikkekkel, gyakran ismertetőkkel. Az 1989 utáni cikkekben PubMed Central- és más teljes szöveges hivatkozások is elérhetők PubMed Central: szabadon elérhető teljes cikkek Site Search: NCBI-web- és FTP-oldalak Books: online könyvek Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) Nucleotide: GenBank-szekvenciaadatbázis Protein: GenPept-szekvenciaadatbázis Genome: teljes genomszekvenciák és leképezés Structure: 3 dimenziós makromolekuláris szerkezetek Taxonomy: a GenBank Taxonomy élőlényei dbSNP: egypontos nukleotid-polimorfizmusok Gene: génközpontú információ HomoloGene: eukarióta homológiacsoportok PubChem Compound: kismolekula-szerkezetek PubChem Substance: anyagrekordok Genome Project: genomprojekt-információ UniGene: génorientált transzkriptumszekvencia-csoportok CDD: állandó fehérjedomének PopSet: populációtanulmányozási adathalmazok (epidemiológia) GEO Profiles: expressziós és molekulagyakorisági profilok GEO DataSets: kísérleti GEO-adathalmazok Sequence read archive: nagy átvitelű szekvenciaadatok Cancer Chromosomes: citogenetikai adatbázisok PubChem BioAssay: anyagok bioaktivitási adatai Probe: szekvenciaspecifikus reagensek NLM Catalog: több mint 1,2 millió folyóirat, könyv, audiovizuális anyag, szoftver, elektronikai forrás és más anyag NLM-adatai a LocatorPlusban (minden hétköznap frissül).
Elérés Az Entrez-ban való adatlekérdezésekhez használható keresőformák mellett az NCBI biztosítja az Entrez Programming Utilitiest (eUtils) a lekérdezési eredmények közvetlenebb eléréséhez. Ez speciális URL-ek NCBI-szerverhez való küldésével és az XML-válasz értelmezésével érhető el. 2015 júliusáig volt elérhető az eUtils SOAP-felület. Történet 1991-ben jelent meg az Entrez CD-formátumban. 1993-ban a szoftver kliens-szerver változata is megjelent, melyhez internetelérés kellett. 1994-ben az NCBI weblapot hozott létre, az Entrez e kezdeti kiadás része volt. 2001-ben megjelent az Entrez könyvespolc, 2003-ban az Entrez-génadatbázis.
Jegyzetek
Fordítás
További információk Entrez search engine form Entrez Help
Kategória:Biológiai adatbázisok Kategória:Orvostudomány