Az 1998–1999-es magyar női labdarúgókupa a sorozat hatodik kiírása volt. A kupa elnyeréséért tizenhat csapat küzdött. A győzelmet a László Kórház SC szerezte meg a Renova ellen. A címvédő a László Kórház csapata volt.
Selejtező A selejtezőt négy csoportban bonyolították le. A csoportokból az első két helyezett csapat jutott tovább.
játéknapok: 1998. szeptember 19., október 10., november 7. A csoport
B csoport
C csoport
D csoport
Negyeddöntő
|colspan="5" align="center" style="background:#fcc;"|1998. november 21., 28., december 5., 1999. március 20.
Elődöntő
|colspan="5" align="center" style="background:#fcc;"|1999. április 10., 24.
Döntő
Források
Magyar kupa Magyar kupa Kategória:Magyar női labdarúgókupa