A biológiai rendszertanban a fajkomplexum (latinul: species complex) kategóriát azokra a fajokra használják, amelyek külső vizsgálat alapján nem különböztethetők meg egymástól, azonban nem képesek szaporodni egymással, és a genetikai összehasonlításuk szerint külön fajoknak tekintendők.
A fajkomplexum értelemszerűen a nem (genus) és a faj (species) között helyezkedik el: genus (species supercomplex) species complex (species subcomplex) species
A fajkomplexumra jó példa az Apistogramma nembe tartozó halfajok kapcsolata.
Kapcsolódó szócikkek Állatrendszertan Növényrendszertan
Kategória:Rendszertan Kategória:Evolúció