bélyegkép|jobbra|Lipid flippáz MsbA bélyegkép|jobbra|B12-vitamin-transzporterszerű ABC transzporter, BtuCD bélyegkép|jobbra|Nyitott állapotú AB2C2 komplex (egy molibdén transzporter) Az ABC-transzporterek (ATP-binding casette transporters, ATP-kötő kazetta transzporterek) az egyik legnagyobb és legősibb fehérje szupercsalád tagjai. Képviselői megtalálhatók minden létező taxonban a prokariótáktól az emberig.Jones, P. M.; George, A. M.; Cellular and Molecular Life Sciences. 2004, 61, 682-699. Ezek a transzmembrán fehérjék rendkívül sokféle anyag membránon való átjuttatását végezhetik, a sejtmembránon vagy a sejt belső membránjain keresztül. A transzportált anyagok lehetnek például metabolitok, lipidek, szteroidok, gyógyszerek. Az ABC-transzporterek kulcsszerepet játszhatnak a cisztás fibrózis, tumorrezisztencia, multidrog-rezisztencia, számos örökletes betegség és más fontos biológiai folyamatok során. A szupercsalád tagjait az ATP-kötő doménjük (vagy doménjeik) -más néven NBF (nucleotide binding fold)- aminosavsorrendje és elrendeződése alapján soroljuk ide.
Alcsaládok Emberben Emberben jelenleg 50 ABC transzporter ismert, ezeket hét alcsaládba soroljuk. CsaládFunkcióPéldaABCA Többek között koleszterin- és lipidtranszportért felelhetnek. ABCA12ABCB Némelyik vér-agy gátban, mások a májban, mitokondriumokban fordulnak elő. Peptideket és epét transzportálhatnak, például. ABCB5ABCC Ionok, sejtfelszíni receptorok, toxinok transzportját végzik. Közéjük tartozik a CFTR fehérje, melynek hiánya, hibás működése cisztikus fibrózist okoz. ABCC6ABCD Mind a peroxiszómákban működnek. ABCD1ABCE/ABCF Az ide tartozó fehérjék nem transzporterek, hanem csupán az ATP-kötő domént tartalmazzák, transzmembrán domén nélkül. A fehérjeszintézist és génexpressziót szabályozzák. ABCE:RLIABCG Lipidek, epe, koleszterin és más szteroidok transzportjáért felelnek. ABCG1
Emberi transzporterek teljes listája itt található: .
Prokarióta alcsaládok
ImporterekSaier MH Jr.; Microbiol Mol Biol Rev., 2000, 64(2), 354-411 TCDB Carbohydrate Uptake Transporter-1 (CUT1) Carbohydrate Uptake Transporter-2 (CUT2) Polar Amino Acid Uptake Transporter (PAAT) Peptide/Opine/Nickel Uptake Transporter (PepT) Hydrophobic Amino Acid Uptake Transporter (HAAT) Sulfate/Tungstate Uptake Transporter (SulT) Phosphate Uptake Transporter (PhoT) Molybdate Uptake Transporter (MolT) Phosphonate Uptake Transporter (PhnT) Ferric Iron Uptake Transporter (FeT) Polyamine/Opine/Phosphonate Uptake Transporter (POPT) Quaternary Amine Uptake Transporter (QAT) Vitamin B12 Uptake Transporter (B12T) Iron Chelate Uptake Transporter (FeCT) Manganese/Zinc/Iron Chelate Uptake Transporter (MZT) Nitrate/Nitrite/Cyanate Uptake Transporter (NitT) Taurine Uptake Transporter (TauT) Cobalt Uptake Transporter (CoT) Thiamin Uptake Transporter (ThiT) Brachyspira Iron Transporter (BIT) Siderophore-Fe3+ Uptake Transporter (SIUT) Nickel Uptake Transporter (NiT) Nickel/Cobalt Uptake Transporter (NiCoT) Methionine Uptake Transporter (MUT) Lipid Exporter (LipidE)
Exporterek Capsular Polysaccharide Exporter (CPSE) Lipooligosaccharide Exporter (LOSE) Lipopolysaccharide Exporter (LPSE) Teichoic Acid Exporter (TAE) Drug Exporter-1 (DrugE1) Lipid Exporter (LipidE) Putative Heme Exporter (HemeE) β-Glucan Exporter (GlucanE) Protein-1 Exporter (Prot1E) Protein-2 Exporter (Prot2E) Peptide-1 Exporter (Pep1E) Peptide-2 Exporter (Pep2E) Peptide-3 Exporter (Pep3E) Probable Glycolipid Exporter (DevE) Na+ Exporter (NatE) Microcin B17 Exporter (McbE) Drug Exporter-2 (DrugE2) Microcin J25 Exporter (McjD) Drug/Siderophore Exporter-3 (DrugE3) (Putative) Drug Resistance ATPase-1 (Drug RA1) (Putative) Drug Resistance ATPase-2 (Drug RA2) Macrolide Exporter (MacB) Peptide-4 Exporter (Pep4E) 3-component Peptide-5 Exporter (Pep5E) Lipoprotein Translocase (LPT) β-Exotoxin I Exporter (βETE) AmfS Peptide Exporter (AmfS-E) SkfA Peptide Exporter (SkfA-E) CydDC Cysteine Exporter (CydDC-E)
Jegyzetek
Források Dean, Michael. The Human ATP-Binding Cassette (ABC) Transporter Superfamily. Bethesda (MD):National Library of Medicine (US), NCBI; 2002 November. Szentpétery, Z.; Kern, A.; Liliom, K.; Sarkadi, B.; Váradi, A.; Bakos, E.; J. Biol. Chem. 2004, 279, 41670-41678. ABC Nomenclature Committee. ABC-Transporter Genes nomenclature scheme, enacted October 22, 1999. Verified availability August 2, 2005. Fitzgerald, M. L.; Okuhira, K.; Short, G. F.; Manning, J. J.; Bell, S. A.; Freeman, M. W.; J. Biol. Chem. 2004, 279, 48477-48485. Wain, H. M.; White, J. A.; Povey, S. Deeley, R. G. Matsson, P. ATP-Binding Cassette Efflux Transporters and Passive Membrane Permeability in Drug Absorption and Disposition. Acta Universitatis Upsaliensis.
További információk ABC transzporterek csoportjai
Kategória:Molekuláris biológia