A 2008–2009-es UEFA-kupa az UEFA-kupa 38. szezonja. A döntőt az isztambuli Şükrü Saracoğlu Stadionban, a Fenerbahçe otthonában játszották 2009. május 20-án.
Ezen a néven ez volt a kupa utolsó kiírása, a következő szezontól átvette a helyét az Európa-liga.
Csapatok 53 nemzet 119 csapata kvalifikálta magát az UEFA-kupa 2008–09-es kiírásába. Három csapat az UEFA Fair Play díja által jutott be, míg további 35 csapat az Intertotó-kupából és a Bajnokok Ligájából csatlakozik a versenybe. Az országok meghatározott számú csapatot indíthattak a kupában. A hazai kiírások (bajnokság, kupa, ligakupa) által akár 4 csapat is indulhatott egy országból. Az alábbiakban olvasható a 2008–09-es UEFA-kupa kvalifikációjának rendszere.
1-6. helyen álló szövetségekből 3 csapat 7-8. helyen álló szövetségekből 4 csapat 9-15. helyen álló szövetségekből 2 csapat 16-21. helyen álló szövetségekből 3 csapat 22-53. helyen álló szövetségekből 2 csapat - kivéve Liechtenstein (38.), Andorra (51.) és San Marino (52.), itt +1 csapat indul 3 UEFA Fair Play díjas 11 győztes a 2008-as Intertotó-kupából 16 vesztes a Bajnokok Ligája harmadik selejtezőköréből 8 harmadik helyezett a Bajnokok Ligája csoportköréből
Első selejtezőkör: (74 csapat) 33 kupagyőztes a 21.-53. labdarúgó-szövetségből 32 ezüstérmes a 19.-37., 39.-50. és az 53. labdarúgó-szövetségből 6 harmadik helyezett a 16.-21. labdarúgó-szövetségből 3 UEFA Fair Play díjas
Második selejtezőkör: (64 csapat) 37 győztes az első selejtezőkörből 6 kupagyőztes a 15.-20. labdarúgó-szövetségből 7 harmadik helyezett a 9.-15. labdarúgó-szövetségből 3 ezüstérmes a 16.-18. labdarúgó-szövetségből 11 továbbjutó az Intertotó-kupából
Első kör: (80 csapat) 32 győztes a második selejtezőkörből 14 nemzeti kupagyőztes az 1.-14. labdarúgó-szövetségből 2 harmadik helyezett a 7.-8. labdarúgó-szövetségből 5 negyedik helyezett a 4.-8. labdarúgó-szövetségből 7 ötödik helyezett az 1.-3. és az 5-8. labdarúgó-szövetségből 2 hatodik helyezett az 1.-2. labdarúgó-szövetségből 2 ligakupa-győztes a 3.-4. labdarúgó-szövetségből 16 kieső a Bajnokok Ligája harmadik selejtezőköréből
Csoportkör: (40 csapat) az első kör 40 győztese
Egyenes kieséses szakasz: (32 csapat) 24 csoportelső, -második, -harmadik a csoportkörből 8 kieső a Bajnokok Ligája csoportköréből (a csoportok harmadik helyezettjei)
Csatlakozás helyeA legjobb 32 Bordeaux1 Werder Bremen1 Sahtar Doneck1 Marseille1 Aalborg BK1 Fiorentina1 Dinamo Kijiv1 Zenyit1 (Címvédő)Első kör Valencia Hamburg Heerenveen Standard Liège2 Sevilla Wolfsburg NEC Nijmegen Slavia Praha2 Racing Santander Borussia Dortmund CSZKA Moszkva Galatasaray2 Portsmouth Benfica Motherwell Olimbiakósz2 Everton Marítimo Metaliszt Harkiv Levszki Szófia2 Tottenham Hotspur Vitória Setúbal Club Brugge Sparta Praha2 AC Milan Rapid București Baník Ostrava Brann2 Sampdoria Dinamo Bucureşti Kayserispor3 Partizan2 Udinese Unirea Urziceni Schalke 042 Wisła Kraków2 Nancy Timișoara Vitória Guimarães2 Artmedia Petržalka2 Saint-Étienne Feyenoord Twente2 Dinamo Zagreb2 Paris St-Germain Ajax Szpartak Moszkva2 Kaunas2Második selejtezőkör FK Moszkva Aris Thessaloniki Makkabi Netánja3 Braga4 Queen of the South Litex Lovecs FK Crvena zvezda3 Vaslui4 FK Dnyipro Dnipropetrovszk Lokomotiv Szófia Deportivo4 Grasshopper4 Gent Young Boys Aston Villa4 Rosenborg4 Slovan Liberec Zürich Napoli4 Sturm Graz4 Beşiktaş JK Lillestrøm Rennes4 Elfsborg4 AEK Athén Stabæk Stuttgart4Első selejtezőkör Cserno More Hajduk Split Zesztaponi Sahter Karagandi Bellinzona APÓEL WIT Georgia Glentoran Viking Omonia FC Vaduz CliftonvilleA kupadöntős Coleraine nem kapott 1 UEFA licencet. A másik döntős, a Linfield a Bajnokok Ligájában indult, a bajnokságban 3. helyezett csapat indulhatott az UEFA-kupában. Hapóél Íróní Kirjat Smóná Kalmar Milano Bangor City Hapóél Tel-Aviv Djurgården Peliszter The New Saints Vojvodina Interblock Ljubljana FH EB/Streymur Borac ČačakHabár a FK Zemun szerb kupadöntősként kvalifikálta magát, nem kapott UEFA licencet, így a Borac Čačak kapta meg a helyét az UEFA-kupában, akik a 4. helyen végeztek a szerb bajnokságban. Koper ÍA B36 Tórshavn Brøndby Zrinjski Mostar MTZ-RIPA Grevenmacher Midtjylland Široki Brijeg Homel Racing FC København Liepājas Metalurgs Vllaznia Shkodër Birkirkara Red Bull Salzburg Olimps Partizani Marsaxlokk Austria WienAz UEFA koefficiens szerint az osztrákkupa-győztes indulhat ebben a körben, de mivel az osztrák kupa 2008-as szezonjában csak amatőr csapatok játszottak, ezt a helyet a bajnokság 3. helyezettje kapta. Sūduva FC Flora Sant Julià Legia Warszawa Vėtra TVMK Juvenes/Dogana Lech Poznań Haka Ararat Jerevan Mogren Győri ETO Honka Bananc Jerevan Zeta Debrecen Dacia Chișinău Xəzər Lənkəran Manchester City MŠK Žilina Nistru Otaci Olimpik Baku Nordsjælland Spartak Trnava Cork City Tobol Hertha BSC Slaven Belupo St Patrick’s Athletic
1 Az UEFA Bajnokok Ligája csoportkörének harmadik helyezettjei 2 Az UEFA Bajnokok Ligája harmadik selejtezőkörének vesztesei 3 Alsóbb selejtezőkörből lépett fel 4 Az UEFA Intertotó-kupa harmadik körének győztesei
Fordulók és időpontok DátumEseményDátumEsemény2008. július 1.Az első selejtezőkör sorsolása2008. december 17.Csoportkör, 5. játéknap2008. július 17.Első selejtezőkör, 1. mérkőzés2008. december 18.2008. július 31.Első selejtezőkör, 2. mérkőzés2008. december 19.A legjobb 32 és a nyolcaddöntő sorsolása2008. augusztus 1.A második selejtezőkör sorsolása2009. február 18.A legjobb 16 közé kerülésért, 1. mérkőzés2008. augusztus 14.Második selejtezőkör, 1. mérkőzés2009. február 19.2008. augusztus 28.Második selejtezőkör, 2. mérkőzés2009. február 26.A legjobb 16 közé kerülésért, 2. mérkőzés2008. augusztus 29.Az első kör sorsolása2009. március 12.Nyolcaddöntő, 1. mérkőzés2008. szeptember 18.Első kör, 1. mérkőzés2009. március 18.Nyolcaddöntő, 2. mérkőzés2008. október 2.Első kör, 2. mérkőzés2009. március 19.2008. október 7.A csoportkör sorsolása2009. március 20.A negyeddöntő és az elődöntő sorsolása2008. október 23.Csoportkör, 1. játéknap2009. április 9.Negyeddöntő, 1. mérkőzés2008. november 6.Csoportkör, 2. játéknap2009. április 16.Negyeddöntő, 2. mérkőzés2008. november 27.Csoportkör, 3. játéknap2009. április 30.Elődöntő, 1. mérkőzés2008. december 3.Csoportkör, 4. játéknap2009. május 7.Elődöntő, 2. mérkőzés2008. december 4.2009. május 20.Döntő Isztambulban
Selejtezők Első selejtezőkör Az első selejtezőkör sorsolását 2008. július 1-jén tartották. Az odavágókat július 17-én, a visszavágókat július 31-én játszották, az FC Nordsjælland - FC TVMK Tallinn meccs kivételével, ami július 29-én volt.
!colspan="5"|Déli-mediterrán régió
!colspan="5"|Közép-keleti régió
!colspan="5"|Északi régió
Második selejtezőkör
!colspan="5"|Déli-mediterrán régió
!colspan="5"|Közép-keleti régió
!colspan="5"|Északi régió
Első kör 32 csapat csatlakozott a kiírásba az első körnél a második selejtezőkör 32 győzteséhez és a Bajnokok Ligája harmadik selejtezőkörének 16 kiesőjéhez. A 80 csapatot 8 csoportra osztották (10 csapat/csoport), minden csoportban 5 kiemelt és 5 nem kiemelt csapat van, valamint egy csoportban sics két ugyanolyan országból érkezett csapat. A csapatok hazai és idegenbeli mérkőzéseket játszanak, amiket szeptember 18-án és október 2-án tartanak. A párosítások győztesei továbbjutnak a csoportkörbe.
!colspan="5"|1. csoport
!colspan="5"|2. csoport
!colspan="5"|3. csoport
!colspan="5"|4. csoport
!colspan="5"|5. csoport
!colspan="5"|6. csoport
!colspan="5"|7. csoport
!colspan="5"|8. csoport
Csoportkör
A csoportkör sorsolását Nyonban, Svájcban tartják 2008. október 7-én 12:00-kor. A 40 csapatot 5 csoportra osztották az UEFA koefficiens szerint. A legnagyobb koefficiensű 8 csapat az 1. csoportba, a következő 8 a 2. csoportba került, és így tovább. A csapatok minden csoportból kapnak ellenfelet a sorsolás során, két csapat egy országból nem kerülhet egy csoportba.
Szabály Az UEFA szabályainak 6.06-os paragrafusa szerint, ha két vagy több csapat egyforma pontszámmal rendelkezik a csoportmérkőzések végén, a következő kritériumok döntenek a helyezésről: gólkülönbség; szerzett gólok száma; idegenben szerzett gólok száma; győzelmek száma; idegenbeli győzelmek száma; koefficiens pontok száma
1. AC Milan Sevilla Valencia Benfica Schalke 04 CSZKA Moszkva Tottenham Hotspur Hamburg
2. Stuttgart Ajax Olimbiakósz Deportivo Club Brugge Szpartak Moszkva Paris Saint-Germain Heerenveen
3. Rosenborg Udinese Feyenoord Braga Slavia Praha Manchester City Galatasaray Sampdoria
4. Hertha BSC Partizan Nancy Portsmouth Aston Villa Racing Santander København Dinamo Zagreb
5. Saint-Étienne Wolfsburg Standard Liège Twente NEC Metaliszt Harkiv Lech Poznań Žilina
A csoport CsapatMGyDVRgKgGkP Manchester City421165+17 Twente420258–36 Paris Saint-Germain412175+25 Racing Santander412165+15 Schalke 04411256–14
2008. október 23.Twente1–0Racing SantanderSchalke 043–1Paris Saint-Germain2008. november 6.Racing Santander1–1Schalke 04Manchester City3–2Twente2008. november 27.Paris Saint-Germain2–2Racing SantanderSchalke 040–2Manchester City2008. december 3.Manchester City0–0Paris Saint-GermainTwente2–1Schalke 042008. december 18.Paris Saint-Germain4–0TwenteRacing Santander3–1Manchester City
B csoport CsapatMGyDVRgKgGkP Metaliszt Harkiv431030+310 Galatasaray430141+39 Olimbiakósz420293+66 Hertha BSC402216–52 Benfica401329–71
2008. október 23.Hertha BSC1–1BenficaGalatasaray1–0Olímpiakósz2008. november 6.Benfica0–2GalatasarayMetaliszt Harkiv0–0Hertha BSC2008. november 27.Olímpiakósz5–1BenficaGalatasaray0–1Metaliszt Harkiv2008. december 3.Metaliszt Harkiv1–0OlímpiakószHertha BSC0–1Galatasaray2008. december 18.Olímpiakósz4–0Hertha BSCBenfica0–1Metaliszt Harkiv
C csoport CsapatMGyDVRgKgGkP Standard Liège430153+29 Stuttgart421163+37 Sampdoria421145–17 Sevilla420252+36 Partizan400418–70
2008. október 23.Sevilla2–0StuttgartPartizan1–2Sampdoria2008. november 6.Stuttgart2–0PartizanStandard Liège1–0Sevilla2008. november 27.Sampdoria1–1StuttgartPartizan0–1Standard Liège2008. december 3.Standard Liège3–0SampdoriaSevilla3–0Partizan2008. december 18.Sampdoria1–0SevillaStuttgart3–0Standard Liège
D csoport CsapatMGyDVRgKgGkP Udinese430164+29 Tottenham Hotspur421174+37 NEC420265+16 Szpartak Moszkva411256–14 Dinamo Zagreb410349–53
2008. október 23.Udinese2–0Tottenham HotspurDinamo Zagreb3–2NEC2008. november 6.Tottenham Hotspur4–0Dinamo ZagrebSzpartak Moszkva1–2Udinese2008. november 27.NEC0–1Tottenham HotspurDinamo Zagreb0–1Szpartak Moszkva2008. december 3.Szpartak Moszkva1–2NECUdinese2–1Dinamo Zagreb2008. december 18.NEC2–0UdineseTottenham Hotspur2–2Szpartak Moszkva
E csoport CsapatMGyDVRgKgGkP Wolfsburg4310137+610 Milan422085+38 Braga420275+26 Portsmouth411278–14 Heerenveen4004313–100
2008. október 23.Heerenveen1–3MilanBraga3–0Portsmouth2008. november 6.Milan1–0BragaWolfsburg5–1Heerenveen2008. november 27.Portsmouth2–2MilanBraga2–3Wolfsburg2008. december 4.Wolfsburg3–2PortsmouthHeerenveen1–2Braga2008. december 17.Portsmouth3–0HeerenveenMilan2–2Wolfsburg
F csoport CsapatMGyDVRgKgGkP Hamburg430173+49 Ajax421154+17 Aston Villa420256–16 Žilina411234–14 Slavia Praha402225–32
2008. október 23.Aston Villa2–1AjaxŽilina1–2Hamburg2008. november 6.Ajax1–0ŽilinaSlavia Praha0–1Aston Villa2008. november 27.Hamburg0–1AjaxŽilina0–0Slavia Praha2008. december 4.Slavia Praha0–2HamburgAston Villa1–2Žilina2008. december 17.Hamburg3–1Aston VillaAjax2–2Slavia Praha
G csoport CsapatMGyDVRgKgGkP Saint-Étienne422094+58 Valencia413084+46 København412145–15 Club Brugge403123–13 Rosenborg402218–72
2008. október 23.København1–3Saint-ÉtienneRosenborg0–0Club Brugge2008. november 6.Saint-Étienne3–0RosenborgValencia1–1København2008. november 27.Club Brugge1–1Saint-ÉtienneRosenborg0–4Valencia2008. december 4.Valencia1–1Club BruggeKøbenhavn1–1Rosenborg2008. december 17.Club Brugge0–1KøbenhavnSaint-Étienne2–2Valencia
H csoport