Il Giro delle Fiandre 1946, trentesima edizione della corsa, fu disputato il 14 aprile 1946, per un percorso totale di 246 km. Fu vinto dal belga Rik van Steenbergen, al traguardo con il tempo di 6h51'00", alla media di 35,910 km/h, davanti a Louis Thiétard e Briek Schotte.
I ciclisti che partirono da Gand furono 210; coloro che tagliarono il traguardo a Wetteren furono 37.
Ordine d'arrivo (Top 10) CorridoreSquadraTempo1 Rik van SteenbergenMercier-Hutchinson6h51'00"2 Louis ThiétardMetropole-Dunlopa 1'06"3 Briek SchotteAlcyon-Dunlops.t.4 Albert SercuDilecta-Wolbera 5'36"5 Sylvain GrysolleRochet-Dunlops.t.6 Michel RemueAlcyon-Dunlops.t.7 Camille BeeckmanThompsons.t.8 Georges ClaesRochet-Dunlops.t.9 Marcel KintMercier-Hutchinsons.t.10 Maurice ClautierThompsons.t.
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