Si è laureato nel 1966 al Brooklyn College della City University of New York. In seguito è diventato professore di antropologia, neuroscienze e biologia comportamentale alla Emory University. È sposato con Marjorie Shostak, con la quale ha avuto tre figli.

Dal 1985 ha contribuito notevolmente allo sviluppo del concetto di dieta paleolitica e il suo impatto sulla salute Eaton SB, Konner MJ, Cordain L. Diet-dependent acid load, Paleolithic nutrition, and evolutionary health promotion, American Journal of Clinical Nutrition, 2010, pp. 295-7.. Sull'argomento ha scritto diversi libri, alcuni assieme a sua moglie Marjorie.

Cresciuto in una famiglia di fede ebraica, Konner ha affermato di aver perso la fede all'età di 17 anni. So Was It Odd of God?, sul New York Times (2010)

Pubblicazioni (parziale) Believers: Faith in Human Nature, W.W. Norton & Company, 2019 Women After All: Sex, Evolution, and the End of Male Supremacy, W.W. Norton & Company, 2015 Paleolithic nutrition: twenty-five years later, Nutrit. Clinical Practice, 2010 , su ncbi.nlm.nih.gov The Evolution of Childhood, Harvard University Press, 2010 The Jewish Body, ed. Alfred A. Knopf, New York, 2009 Unsettled: An Anthropology of the Jews, New York, Viking Compass, 2009 The Tangled Wing: Biological Constraints on the Human Spirit, Times Books, 2ª ed. 2002 Tradotto in italiano da Libero Sosio con il titolo L'ala impigliata. I condizionamenti biologici dello spirito umano, Feltrinelli, Milano 1984. Medicine at the Crossroads: The Crisis in Healthcare, Pantheon Books, 1993 Why the Reckless Survive ... and Other Secrets of Human Nature, New York, Viking, 1990 Becoming a Doctor: A Journey of Initiation in Medical School, New York, Viking, 1987

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