Il palmarès del Club Atlético Peñarol conta 54 campionati uruguaiani (l'ultimo nella stagione 2024), di cui 5 vinti come CURCC, 12 Liguillas, 5 Coppe Libertadores e 3 Coppe Intercontinentali, titoli che rendono il Peñarol la più titolata squadra uruguaianaIl Peñarol ha vinto anche altri due titoli nazionali, tuttavia non riconosciuti dall'AUF: uno nel 1924, organizzato dalla Federación Uruguaya de Futbol (una federazione fondata l'anno prima da alcuni club dissidenti e contrapposta all'AUF, ma sciolta nel 1925), l'altro nel 1926, organizzato da un Consejo Provisorio ma senza l'autorizzazione dell'AUF, che preferì in quell'anno non organizzare alcun campionato, a causa della confusione generata dalla "secessione" della FUF di 3 anni prima.. Il club è stato incoronato miglior del XX secolo in Sudamerica dall'IFFHS, istituto riconosciuto e autorizzato dalla FIFA, il 17 settembre 2009.
È nel ristretto club delle nove squadre al mondo che siano riuscite a centrare in due occasioni, nel 1961 e nel 1982, il Treble composto dai 3 titoli di campione del proprio paese, del continente e del mondo. Ci sono riuscite anche Santos (1962 e 1963), il classico rivale, Nacional Montevideo (1971 e 1980), Ajax (1972 e 1995), Boca Juniors (2000 e 2003), Manchester United (1999 e 2008), (1965 e 2010) , Barcellona (2009, 2011 e 2015) e Bayern Monaco (2013 e 2020). Nell'agosto del 2007 è stato invitato in Italia dal per disputare il Trofeo del Centenario, partita celebrativa dei festeggiamenti per i primi cento anni della società granata. Approfittando della trasferta, la squadra ha visitato Pinerolo, dove è stata ricevuta in Comune dal sindacoArticolo “Il Peñarol di Montevideo ricevuto in comune nella sua Pinerolo” - http://www.ecodelchisone.it, 22 agosto 2007..
Competizioni nazionali Campionati uruguaiani: 54 (record) Campionati uruguaiani di AUF: 52 1900, 1901, 1905, 1907, 1911, 1918, 1921, 1928, 1929, 1932, 1935, 1936, 1937, 1938, 1944, 1945, 1949, 1951, 1953, 1954, 1958, 1959, 1960, 1961, 1962, 1964, 1965, 1967, 1968, 1973, 1974, 1975, 1978, 1979, 1981, 1982, 1985, 1986, 1993, 1994, 1995, 1996, 1997, 1999, 2003, 2009-2010, 2012-2013, 2015-2016, 2017, 2018, 2021, 2024 Campionati uruguaiani di FUF: 1 1924 Coppa del Consiglio Provvisorio: 1 1926
Supercopa Uruguaya: 3 2018, 2022, 2026
Copa Uruguay: 1 2025
Competizioni internazionali (record uruguaiano) 1960, 1961, 1966, 1982, 1987
(record sudamericano condiviso con San Paolo, Nacional e Boca Juniors) 1961, 1966, 1982
(record a pari merito con il Santos) 1969
Copa de Honor Cousenier: 3 1909, 1911, 1918
Tie Cup: 1 1916
Copa Ricardo Aldao: 1 1928
1942
Competizioni giovanili
2022
Altri piazzamenti
Secondo posto: 1902, 1903, 1906, 1909, 1910, 1912, 1914, 1915, 1916, 1917, 1920, 1923 (FUF), 1927, 1933, 1934, 1939, 1941, 1942, 1943, 1946, 1947, 1948, 1950, 1952, 1955, 1956, 1957, 1963, 1966, 1969, 1970, 1971, 1972, 1976, 1977, 1984, 1986, 1988, Apertura 1994, Clausura 1995, Clausura 1997, Apertura 2003, Apertura 2006, Clausura 2007, Clausura 2013, Clausura 2014, Clausura 2016, Apertura 2018, Clausura 2019, Clausura 2023 Terzo posto: 1913, 1919, 1980, 1989, 1990, Apertura 1997, Apertura 1998, 2004, 2005, Clausura 2011, Apertura 2011, Apertura 2014, Apertura 2017, Apertura 2021
Semifinalista: 2022, 2023
Semifinalista: 2026
Finalista: 2019, 2025
Finalista: 1962, 1965, 1970, 1983, 2011 Semifinalista: 1963, 1967, 1968, 1969, 1972, 1974, 1976, 1979, 1981, 1985, 2024
Finalista: 1960, 1987
Finalista: 1993, 1994
Semifinalista: 2021
Semifinalista: 1952
Semifinalista: 1990, 1991
Semifinalista: 1999
Finalista: 1941, 1946
Note
Peñarol