Appartenente al ramo dei Conti Capponi alle Rovinate di Firenze, è stato un importante amministratore di enti granducali e opere di carità.A. Pieraccini, La famiglia Capponi di Firenze. cenno storico genealogico, Pisa 1882, p. 15
Biografia Figlio primogenito del Conte Ferrante (1762-1819) e della seconda moglie Maria Teresa Pandolfini (1795), dama dell’imperatrice Maria Luisa moglie di Napoleone I.Litta-Passerini Tav. XIX Giovan Battista, a differenza degli antenati, si occuperà poco di politica facendolo solo quando il dovere e il granduca lo richiesero per l'amministrazione come gonfaloniere diversi municipi, essendo principalmente interessato ad opere di carità e beneficenza, operando per la basilica di San Miniato, come membro della congregazione di San Giovanni e del conservatorio di San Francesco di Sales.Cesare Guasti, Opere. Biografie, Prato Tipografia Successori Vestri 1895, pp. 100-101. Sposò Luisa Velluti-Zati, dama della Granduchessa Maria Antonia, dalla quale ebbe tre figli Carlo (1831-1865), Ferdinando Carlo Arcivescovo di Pisa (1835-1903) e Luigi (1834-1921). La sorella Maria Lucrezia (1804-) sposerà Cosimo Antinori rinsaldando i forti legami tra le due famiglie che ancora oggi esistono.
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