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La sesta stagione della serie televisiva Smallville è andata in onda sul canale statunitense The CW dal 28 settembre 2006 al 17 maggio 2007. In Italia è stata trasmessa in prima assoluta sul canale a pagamento Mediaset Premium dal 6 settembre 2007 al 15 novembre 2007.
Alla fine di questa stagione Annette O'Toole lascia il cast principale della serie.
Gli antagonisti principali sono Lex Luthor e Bizzarro.
nºTitolo originaleTitolo italianoPrima TV USAPrima TV Italia 1 Zod Zod 28 settembre 2006 6 settembre 2007 2 Sneeze Per un soffio 5 ottobre 2006 3 Wither Rampicante 12 ottobre 2006 13 settembre 2007 4 Arrow Freccia Verde 19 ottobre 2006 5 Reunion Fantasmi del passato 26 ottobre 2006 20 settembre 2007 6 Fallout Destino 2 novembre 2006 7 Rage Rabbia 9 novembre 2006 27 settembre 2007 8 Static Frequenze 16 novembre 2006 9 Subterranean La storia di Javier 7 dicembre 2006 4 ottobre 2007 10 Hydro Il potere dell'acqua 11 gennaio 2007 11 Justice La lega della giustizia 18 gennaio 2007 11 ottobre 2007 12 Labyrinth Labirinti della mente 25 gennaio 2007 13 Crimson Il rossetto 1º febbraio 2007 18 ottobre 2007 14 Trespass Sotto i riflettori 8 febbraio 2007 15 Freak Bomba a orologeria 15 febbraio 2007 25 ottobre 2007 16 Promise La promessa 15 marzo 2007 17 Combat Combattimento 22 marzo 2007 1º novembre 2007 18 Progeny Controllo telepatico 19 aprile 2007 19 Nemesis Segreti nel sottosuolo 26 aprile 2007 8 novembre 2007 20 Noir Noir 3 maggio 2007 21 Prototype Progetto Ares 10 maggio 2007 15 novembre 2007 22 Phantom Bizzarro 17 maggio 2007
Zod Titolo originale: Zod Diretto da: James Marshall Scritto da: Steven S. DeKnight Trama Clark vaga per la Dimensione Fantasma, dove può essere ferito; viene quindi attaccato da strani esseri messi in fuga da una ragazza con un particolare cristallo. Sulla Terra Zod ha scatenato il caos ma Lionel, in accordo con Chloe, decide di recuperare il pugnale di Jor-El. La ragazza che ha salvato Clark, Raya, dice di conoscere Jor-El e gli mostra il cristallo con cui ha cacciato gli esseri, che presenta il simbolo kryptoniano di speranza. Martha e Lois sono sopravvissute e l'aereo è caduto vicino alla Fortezza: lì Jor-El spiega alla donna cosa è successo a Clark e la incarica di uccidere Zod (sempre nel corpo di Lex) col pugnale, per poi riportare le due a Smallville, ringraziando Martha per la madre che è stata per suo figlio. Raya spiega a Clark di essere stata assistente di Jor-El nonché gli ultimi momenti di Krypton, durante i quali ella venne rinchiusa da lui per farla sopravvivere mentre lui e Lara restarono fino all'ultimo sul pianeta per tentare di salvarlo. Chloe trova al Daily Planet un ragazzo che conosce, la sua "prima volta", Jimmy Olsen. Zod ferma il virus digitale di Fine e dice a Lana di voler prendere qualcosa al Pentagono per ricreare Krypton sulla Terra. Clark e Raya vengono attaccati dai due kryptoniani sbarcati sulla Terra, ma la ragazza li ferma dicendo che Clark può farli fuggire. Martha e Lionel recuperano il pugnale alla fattoria; Lana li raggiunge e si assume il compito di uccidere Zod. Lana tenta di ucciderlo ma Zod distrugge il pugnale e aziona i satelliti in modo da modificare la conformazione del pianeta. Clark, grazie al sacrificio di Raya, riesce a fuggire dalla Dimensione Fantasma attraverso il portale progettato per gli El, ma insieme a lui fuggono anche alcuni detenuti. Clark salva Martha e Lionel e si dirige da Zod prima che uccida Lana e danneggiando il congegno che aziona i satelliti, fermando il suo piano. I due combattono e Clark viene facilmente sopraffatto, ma con l'inganno lo rispedisce nella Dimensione Fantasma grazie al cristallo di Raya. Clark spiega a Martha che la Fortezza, dove ha portato il cristallo, è morta. Infine Lionel traduce i simboli e Lex trova un frammento della navicella.
Altri interpreti: Terence Stamp (voce originale di Jor-El), Aaron Ashmore (Jimmy Olsen), Leonard Roberts (Nam-Ek), Pascale Hutton (Raya) Nota. La scena in cui Clark si inginocchia di fronte a Zod, imbrogliandolo e usando il cristallo per rimandarlo nella Dimensione Fantasma, ricorda una scena di Superman II in cui l'uomo d'acciaio finge di sottomettersi, inginocchiandoglisi davanti, a Zod ma stritolandogli invece la mano poiché era riuscito a ingannarlo e a privarlo dei superpoteri, riacquistando i suoi.
Per un soffio Titolo originale: Sneeze Diretto da: Paul Shapiro Scritto da: Todd Slavkin e Darren Swimmer Trama Clark, con uno starnuto, scardina la porta del fienile, che cade vicino a Lois; il ragazzo sembra presentare i sintomi del raffreddore mentre la ragazza decide di indagare. Lana va a vivere con Lex, che negli ultimi tempi viene pedinato. Dopo essersi confrontato con Lionel, Lex viene rapito da alcuni uomini interessati ai poteri che aveva quando Zod era in lui e il padre chiede aiuto a Clark. Lana, dopo una visita di Clark, scopre che Lex ha delle telecamere in tutta la casa e che aveva assunto un investigatore privato perché pedinato. Lex confessa ai rapitori che la LuthorCorp sta realizzando un siero che aumenta la forza fisica e dice loro dove trovarlo. Lionel incontra Oliver Queen, un giovane imprenditore ex compagno di studi di Lex che crede coinvolto nel rapimento. Lana, alla ricerca di Lex, viene sequestrata anche lei, ma i due riescono a cavarsela e Clark, usando il super soffio, li aiuta. Lois pubblica un articolo sull'Inquisitor. Infine uno dei rapitori ritorna da Oliver, che gli ordina di trovare l'altro individuo dotato di poteri presente nel laboratorio di cui l'uomo gli parla; il giovane, inoltre, sembra essere uno straordinario arciere.
Altri interpreti: Justin Hartley (Oliver Queen/Freccia Verde), Brendan Penny (Wagner), Emy Aneke (Robert Pontius), Lochlyn Munro (Orlando Block), Jayme Desjardins (non accreditato) (Giornalista).
Rampicante Titolo originale: Wither Diretto da: Whitney Ransick Scritto da: Holly Harold Trama Chloe e Jimmy, ancora intimi, trovano il cadavere di una ragazza in un bosco vicino ad una radura frequentata dalle coppie e assieme a Clark cominciano ad indagare. Lex e Lana hanno i primi problemi di coppia, legati soprattutto al trattamento riservato alla ragazza dai media. Clark ritrova il fidanzato della ragazza ma alcune frasche lo feriscono; indagando, il giovane Kent arriva alla serra di Lex e i due litigano. Lana chiede un consiglio a Chloe sulla sua relazione. Gloria, una guardia forestale incontrata da Clark, sembra riuscire a controllare la vegetazione e attacca Jimmy. Lois va a scusarsi con Oliver dopo il loro primo incontro e il magnate la invita al ballo in maschera di Lex. Chloe e Clark scoprono che le piante che hanno attaccato Jimmy non sono terrestri e il giovane Kent va da Gloria: scopre allora che la ragazza è fuggita dalla Dimensione Fantasma, ma non riesce a fermarla. Chloe salva Clark e Jimmy e rivela all'amico la debolezza delle piante: lui si reca alla serra di Lex e riesce a fermare Gloria. Oliver, facendo una scommessa con Lois, dimostra ancora una volta la sua abilità con l'arco mentre Lana e Lex, dopo essersi riappacificati, fanno l'amore.
Altri interpreti: Aaron Ashmore (Jimmy Olsen), Justin Hartley (Oliver Queen/Freccia Verde), Amber McDonald (Gloria), Chelsea Florko (Jenny), Darren E. Scott (Dottore), Jake LeDoux (Paul Bennett), Carrie Fleming (Backy), Danielle Kremeniuk (EMT numero 1), Randal Edwards (EMT numero 2), Aaron Grain (Tarzan), Anna Williams (Monica), Monica Mustelier (Infermiera), Cameron Park (Fotografo), Drew Scott (non accreditato) (Danny), The All-American Rejects (non accreditati). Musiche: It Ends Tonight (The All-American Rejects); Ache (James Carrington).
Freccia Verde Titolo originale: Arrow Diretto da: Michael Rohl Scritto da: Kelly Souders e Brian Peterson Trama Ad una festa in onore di Martha un uomo mascherato le ruba la preziosa collana prestatale da Lionel, ma Lois riesce a prendergli un anello. Clark conosce Oliver per recuperare la collana di Martha. Lex sta conducendo delle ricerche sul frammento di astronave usato da Zod. Il misterioso ladro-arciere recupera il suo anello addormentando Lois e Chloe. Lionel mette in guardia Lana sulla pericolosità delle ricerche di Lex. Clark, grazie ad una dritta di Lionel, riesce ad intercettare Freccia Verde, il ladro, ma questi riesce a fuggire. Lois viene rapita e Oliver, in risposta alle illazioni di Clark su Freccia Verde, gli rivela che tutti i cimeli che il bandito ha rubato erano stati acquistati illegalmente. Clark, vedendo l'araldo presente sull'anello rubato a Freccia Verde, capisce che la vera identità del bandito è Oliver. Freccia Verde salva poi Lois dai suoi rapitori: la ragazza lo attacca, ma Clark fa in modo che il bandito possa fuggire, per poi raggiungerlo e rivelargli di conoscere la sua vera identità e dicendogli di restituire a Lionel la sua collana. Oliver restituisce alcuni manufatti ai musei e Clark chiede a Chloe di smetterla di indagare su Freccia Verde. Infine Oliver incontra Clark, che a conoscenza dei suoi poteri gli propone di unirsi a lui per aiutare gli indifesi.
Altri interpreti: Justin Hartley (Oliver Queen/Freccia Verde), French Tickner (Simon Westcott), Samantha Zaharia (Candice Westcott), David McIlwraith (Milo), Bill Mondy (Dr. Edward Groll), Jay Hindle (non accreditato) (Sig. Queen). Musiche: It Ends Tonight (The All-American Rejects); Ache (James Carrington); Golberg Variations: Var.21-Canone alla settima(J.S.Bach). Nota. In una scena Chloe soprannomina Clark "uomo d'acciaio", uno degli epiteti più famosi di Superman.
Fantasmi del passato Titolo originale: Reunion Diretto da: Jeannot Szwarc Scritto da: Steven S. DeKnight Trama Lex e Oliver partecipano alla riunione della loro classe quando frequentavano il prestigioso istituto Excelsior, ma durante la festa uno dei loro amici viene ucciso. L'episodio riporta alla mente di Lex le difficoltà che ha vissuto nella scuola e del suo unico amico nell'istituto, Duncan. Clark scopre che assieme a lui sono evasi dalla Dimensione Fantasma anche alcuni prigionieri, che Chloe ribattezza zoners, e decide di chiedere aiuto a Oliver per trovarli. Un altro amico di Oliver viene ucciso e questi, in cambio delle immagini del suo satellite, chiede a Clark di aiutarlo a incastrare Lex per l'omicidio dei due amici. Lana viene ferita in casa di Lex ma Lois dice a Clark che il bersaglio potrebbe essere stato in realtà il magnate. Clark ipotizza che sia Duncan il responsabile, ma Oliver gli dice che il ragazzo venne investito a causa sua e di Lex e che Lionel insabbiò tutto; il magnate confessa di averlo salvato grazie a una cura alla kryptonite. Duncan, che ha ottenuto la capacità di compiere viaggi astrali, attacca Lex e Oliver, ma Clark li salva e questi muore. Grazie alle foto di Oliver, Clark riconosce in un cratere Raya.
Altri interpreti: Justin Hartley (Oliver Queen/Freccia Verde), Rekha Sharma (Dr. Harden), Bryce Hodgson (Duncan Allenmeyer), Sebastian Gacki (Alden), Clifton MaCabe Murray (Geoffrey), Ryan Overton (Oliver Queen adolescente), Lucas Grabeel (Lex Luthor adolescente), Devin Douglas Drewitz (Alden adolescente), Reece Thompson (Geoffrey adolescente), Diego Bedoya (Autista limousine), Alison Araya (Infermiera di Duncan). Musiche: It's Not Over (Daughtry).
Destino Titolo originale: Fallout Diretto da: Glen Winter Scritto da: Holly Harold Trama