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La prima stagione di SpongeBob è stata trasmessa in America dal 1º maggio 1999 al 3 marzo 2001, consiste in 20 episodi a loro volta suddivisi in due (tre per la prima puntata) episodi ciascuno dalla durata di 10 minuti. In Italia il cartone venne trasmesso in prima visione assoluta su Italia 1 dal 30 agosto 2004 al 22 ottobre 2004.
nºTitolo originaleTitolo italianoPrima TV USAPrima TV Italia1Help WantedCercasi aiuto1º maggio 199930 agosto 2004Reef BlowerL’aspira reef Tea at the Treedome Tè sotto l'albero31 agosto 20042BubblestandBolle di sapone17 luglio 19991º settembre 2004Ripped PantsPantaloni strappati2 settembre 20043JellyfishingA caccia di meduse31 luglio 19993 settembre 2004PlanktonPlankton6 settembre 20044Naughty Nautical NeighborsUn vicino conteso7 agosto 19997 settembre 2004Boating SchoolL'esame di guida8 settembre 20045Pizza DeliveryConsegna a domicilio14 agosto 19999 settembre 2004Home Sweet PineappleCasa dolce ananas10 settembre 20046Mermaid Man and Barnacle BoyIl ritorno dei supereroi21 agosto 199913 settembre 2004 Pickles Tutta colpa dei sottaceti14 settembre 20047Hall MonitorIl guardiano della scuola28 agosto 199915 settembre 2004 Jellyfish Jam Meduse scatenate!16 settembre 20048Sandy's RocketA caccia di alieni17 settembre 199917 settembre 2004 Squeaky Boots Stivali sguish-sguish20 settembre 20049Nature PantsRitorno alla natura!11 settembre 199921 settembre 2004 Opposite Day Un giorno al contrario22 settembre 200410Culture ShockUn vero talento18 settembre 199923 settembre 2004 F.U.N. Un plancton per amico24 settembre 200411MuscleBob BuffPantsMister muscoli2 ottobre 199927 settembre 2004 Squidward the Unfriendly Ghost Il fantasma del vicino28 settembre 200412The ChaperoneUn cavaliere speciale8 marzo 200029 settembre 2004 Employee of the Month L'impiegato del mese!30 settembre 200413Scaredy PantsLa spugna del terrore28 ottobre 19991º ottobre 2004 I Was a Teenage Gary Una tata per Gheri4 ottobre 200414SB-129Un salto nel tempo31 dicembre 19995 ottobre 2004 Karate Choppers Il karate... che passione!6 ottobre 200415Sleepy TimeUn giro nei sogni17 gennaio 20007 ottobre 2004Suds L'attacco di schiuma8 ottobre 200416Valentine's DaySan Valentino14 febbraio 200011 ottobre 2004 The Paper Il foglio di carta12 ottobre 200417Arrgh!Il tesoro dei pirati15 marzo 200013 ottobre 2004Rock BottomRock Bottom14 ottobre 200418TexasNostalgia del Texas22 marzo 200015 ottobre 2004 Walking Small Le lezioni di Plankton18 ottobre 200419Fools in AprilPesce d'aprile1º aprile 200019 ottobre 2004 Neptune's Spatula La spatola nel grasso20 ottobre 200420HookyGli ami da pesca23 febbraio 200121 ottobre 2004 Mermaid Man and Barnacle Boy II Le avventure di Waterman & Supervista3 marzo 200122 ottobre 2004
Cercasi aiuto SpongeBob SquarePants è una spugna marina che abita con la sua chiocciola di mare Gary in un ananas situato nella città sottomarina di Bikini Bottom nell'Oceano Pacifico. Un giorno si alza presto dal suo letto e, dopo aver salutato Gary, si precipita al Krusty Krab, un ristorante dove vengono cucinati i Krabby Patty, dei panini con hamburger. Notando il cartello cercasi aiuto, SpongeBob vuole farsi assumere; poco dopo desiste, ma la stella marina Patrick Stella, il suo migliore amico, riesce a convincerlo a cambiare idea. Il polpo Squiddi Tentacolo - cassiere del locale - e il granchio venale Mr. Krab - proprietario del fast food - credono che SpongeBob non sia affatto esperto e lo mandano a comprare una grossa spatola idrodinamica, con accessori e motore turbo. Mentre SpongeBob è al supermercato, un numeroso gruppo di acciughe affamate arriva per mangiare e inizia a distruggere tutto il ristorante. In quel momento giunge SpongeBob con la spatola richiesta, con stupore di Squiddi e Krab, e si precipita in cucina, dove prepara Krabby Patty per tutta la clientela; così, malgrado il parere contrario di Squiddi, Mr. Krab lo assume. Alla fine Patrick chiede a SpongeBob di fargli un Krabby Patty, ma la spugna ne prepara così tanti da farlo uscire dal ristorante.
L'aspira reef Squiddi trova una conchiglia vicino a casa sua e decide di metterla davanti all'abitazione di SpongeBob. Egli tenta allora di disfarsene con un aspirapolvere, disturbando Squiddi e finendo per riempire sempre di più il cortile di rifiuti. A un certo punto finisce per risucchiare tutto l'oceano, facendo esplodere il serbatoio dell'aspirapolvere. Dopo che l'acqua è tornata all'oceano, le case di Squiddi e di Patrick sono sommerse di sabbia, mentre quella di SpongeBob è pulita.
Tè sotto l'albero SpongeBob cerca di catturare una medusa, ma improvvisamente la sua vista ricade su uno scoiattolo femmina di nome Sandy Cheeks venuto dalla superficie che è alle prese con un'ostrica gigante, così decide di salvarla. La spugna, dopo aver salvato Sandy, fa conoscenza con lei imparando anche l'arte del karate. Più tardi, SpongeBob si rende conto che Sandy indossa una tuta subacquea in grado di farle respirare l'aria e subito i due organizzano un appuntamento nella cupola abitata da Sandy per prendere il tè. SpongeBob non riconosce comunque cos'è l'aria e inizia a confondersi, ma Patrick gli consiglia di alzare sempre il mignolo per fare una bella figura. Sfortunatamente SpongeBob si rende conto che la cupola di Sandy è piena d'aria e, poiché le creature marine muoiono senz'acqua, decide di scappare dalla cupola. Patrick, il quale ha assistito alla scena, cerca di convincere SpongeBob che è dopotutto una cosa ingrata allontanarsi da un'amica, ma, quando entra nella cupola e sente l'aria dappertutto, decide di scappare via con SpongeBob, ma la porta si è purtroppo chiusa a chiave. Alla fine Sandy salva la vita a SpongeBob e Patrick, dando a entrambi un casco pieno d'acqua da utilizzare in casa sua. Da quel momento, inizia l'amicizia dei tre.
Bolle di sapone SpongeBob crea un bancone in cui si pagano 25 centesimi per fare delle bolle di sapone e per eseguirle alla perfezione bisogna usare una tecnica da lui inventata. Patrick approva moltissimo la sua idea, ma Squiddi esprime il suo interesse solo nel suonare il suo clarinetto e vuole essere lasciato in pace. Subito dopo però vuole avere un insegnamento su come si fanno le bolle, ma non riesce a crearle in modo corretto, poiché non utilizza la tecnica usata da SpongeBob che con Patrick cerca di fargliela ricordare. Alla fine Squiddi ne fa uso creando un'enorme bolla di sapone e felice rientra in casa a suonare il clarinetto, ma non si accorge che la bolla ha racchiuso in essa la sua dimora per poi scoppiare e farla cadere al suolo. SpongeBob e Patrick scappano nelle proprie case facendo finta che non fosse successo niente.
Pantaloni strappati In spiaggia, SpongeBob fa divertire Sandy quando all'improvviso Larry l'Aragosta, un atletico crostaceo, invita i due a un torneo di sollevamento pesi. SpongeBob, cercando di far colpo su Sandy, prova a sollevare un peso, ma si strappa i pantaloni. Tutti ridono e SpongeBob in un primo momento si imbarazza, ma poi capisce che tutti hanno creduto che fosse stato uno scherzo e quindi ritira fuori sempre lo stesso tormentone. Esagera e finge di annegare per ritirare la stessa battuta, non facendo ridere nessuno. SpongeBob si ritrova da solo e incontra altri ragazzi finiti come lui. Essi chiedono cosa sia successo a SpongeBob e questi intona una canzone per spiegarglielo. La canzone fa capire ai bagnanti i suoi sentimenti e lo perdonano.
A caccia di meduse SpongeBob e Patrick si accingono ad andare a caccia di meduse e invitano anche Squiddi, il quale, molto sgarbatamente, li deride e se ne va via con la sua bicicletta, ma una medusa lo fa inciampare giù da un precipizio. SpongeBob e Patrick, saputo dell'infortunio del polpo, gli preparano delle "sorprese" nel tentativo farlo stare meglio e infine lo portano al campo delle meduse per una battuta di caccia. Squiddi, acciaccato, all'inizio è riluttante, ma, dopo aver catturato una medusa, si lascia prendere la mano e si ritrova a dover fare i conti con una gigantesca medusa infuriata che alla fine lo punge. Arrivato a casa, Squiddi, infuriato, libera la medusa da lui catturata perché punga i due malcapitati SpongeBob e Patrick. Il polpo se la ride, ma viene punto ancora dalla medusa gigante di prima.
Plankton! Plankton, nemico giurato di Mr. Krab, cerca senza successo di guadagnarsi l'amicizia di SpongeBob per rubare la formula segreta del Krabby Patty. Quella stessa notte, per vendicarsi di SpongeBob, Plankton decide di prendere il controllo del suo organismo e quindi del suo cervello, per fargli rubare un Krabby Patty ed analizzarlo in laboratorio. Dopo aver rubato il panino, SpongeBob decide di ingannare Plankton, facendogli venire voglia di mangiare il Krabby Patty, rinunciando al suo cervello. Alla fine Plankton cade accidentalmente all'interno del computer e SpongeBob può riprendersi il panino per riportarlo indietro.
Un vicino conteso SpongeBob e Patrick giocano a mandarsi messaggi tramite bolle di sapone. Squiddi, intento a mangiare un soufflé, è infastidito dalla cosa, quindi decide di intromettersi nel gioco offendendo i due e facendoli litigare. Tuttavia Squiddi si strozza con la forchetta e Patrick lo salva, fissandosi di diventare amico del calamaro. SpongeBob e Patrick competono per le amicizie di Squiddi, facendolo diventare matto. Il polpo, per porre fine all'incubo, decide di riunire i due offrendo loro della soda. Ridendo e distruggendo la casa di Squiddi con le bolle di soda, i due tornano amici. Squiddi li scaccia via di casa e, a conclusione dell'episodio, gli piomba addosso tutto ciò che gli è rimasto di casa sua: la porta.
L'esame di guida SpongeBob non riesce per l'ennesima volta a prendere la patente ferendo gravemente la sua professoressa, la signora Puff. Decide così di farsi aiutare da Patrick, che gli dirà cosa deve fare tramite una radio trasmittente piazzata sulla sua testa, ma SpongeBob inizia poi a sentirsi in colpa di aver imbrogliato e inizierà a guidare male per la disperazione, mandando la signora Puff in ospedale. A fine episodio, SpongeBob decide di andare a trovare l'infortunata insegnante all'ospedale.
Consegna a domicilio Mr. Krab commissiona la consegna di una pizza a domicilio a SpongeBob e Squiddi. Durante il viaggio, i due trovano numerose insidie, ma riescono comunque ad arrivare a destinazione. SpongeBob consegna la pizza al cliente, il quale lo sgrida severamente per aver dimenticato la bibita accompagnatoria, non prevista dall'ordine. SpongeBob si mette a piangere, e Squiddi sbatte la pizza in faccia al cliente come punizione per come ha trattato la povera spugna. I due ritornano quindi al Krusty Krab.
Casa dolce ananas La casa di SpongeBob viene divorata dai nematodi. La spugna è perciò costretta a trasferirsi, tra i dolori di Patrick e le gioie di Squiddi. SpongeBob e Patrick provano a ricostruire casa, ma senza successo. SpongeBob viene allora a dormire sotto la roccia di Patrick, ma se la vede con gli incubi notturni dell'amico. Prova quindi a dormire da Squiddi, ma egli lo scaccia. Proprio quando sembra che l'unica cosa da fare sia tornare dai genitori, SpongeBob piange sul semino dell'ananas, che germoglia e ricresce sopra Squiddi, ridando a SpongeBob la sua casa.
Il ritorno dei supereroi SpongeBob e Patrick ammirano due supereroi, Waterman & Supervista, e giocano spesso a imitarli. Tuttavia scoprono che i due supereroi sono ormai pensionati, e così attuano varie strategie per farli tornare in azione, facendoli quasi litigare e facendosi scacciare via. Ma alla fine Waterman & Supervista torneranno in azione.
Tutta colpa dei sottaceti