Appassionato di arti, era un membro onorario della Real Academia de Bellas Artes de San Fernando (1816).

Fu Gran Maestro della Massoneria spagnola (Grande Oriente Nazionale di Spagna). Nel 1839 fu eletto Sovrano Gran Commendatore del Supremo Consiglio del 33º grado per la Spagna del Rito Scozzese Antico ed Accettato, carica che occupò fino al 1844.Galo Sánchez Casado, Los altos grados de la masonería, Ed. Akal, Madrid, 2009, p. 203 e ss. ISBN 978-84-96797-20-8

Biografia Nato al Palazzo Reale di Aranjuez, l'infante Francesco di Paola era il quattordicesimo e ultimo figlio di Carlo IV di Spagna e di sua moglie Maria Luisa di Borbone-Parma, nipote del re Luigi XV di FranciaMateos, Los desconocidos infantes de España, p. 109.. Essendo il più giovane di una famiglia numerosa, era il preferito di sua madreMoral, El Infante don Francisco de Paula de Borbón: masonería y liberalismo a la sombra del trono , p. 149. Suo padre aveva una passione per la caccia e per gli orologi, ma era poco interessato agli affari politiciMateos, Los desconocidos infantes de España, p. 110., tanto che finì per assumere un ruolo passivo nella direzione del proprio regno, lasciando il governo alla moglie e al primo ministro Manuel Godoy. La regina Maria Luisa dominava completamente il re; le mancava però l'acume politico necessario per mantenere il potere da sola, quindi depose la sua fiducia e il dominio di governo a Godoy. Voci di corte attribuivano la paternità di Francesco e di sua sorella Maria Isabella, non al re, ma a Godoy. Tuttavia, biografi e storici recenti hanno considerato queste affermazioni come non veritiereSmerdou, Carlos IV en el exilio , p. 259..

Da bambino Francesco aveva i capelli biondi, gli occhi castani e un'espressione teneraMateos, Los desconocidos infantes de España, p. 111.. La sua educazione fu diversa da quella dei fratelli maggioriMoral, El Infante don Francisco de Paula de Borbón: masonería y liberalismo a la sombra del trono, p. 150: il piano di studi a lui assegnato si ispirava alle teorie pedagogiche di Johann Heinrich Pestalozzi. Cercando di implementare questo sistema di educazione in tutta la Spagna, Godoy convinse la coppia reale ad applicarlo al loro figlio più giovane. Sebbene i suoi genitori desideravano che Francesco intraprendesse una carriera nella marina spagnola, l'educazione dell'infante fu bruscamente interrotta dall'invasione napoleonica in Spagna.

Con il pretesto di risolvere le divergenze tra Carlo IV e suo figlio maggiore Ferdinando VII, che assunse il governo dopo l'ammutinamento di Aranjuez, Napoleone invitò padre e figlio a un incontro a Bayonne, spingendoli entrambi a rinunciare alla corona spagnola a suo favoreSmerdou, Carlos IV en el exilio , p. 65.. Dopo aver raggiunto il suo obiettivo, Napoleone concesse la Spagna a suo fratello Giuseppe Bonaparte e ordinò ai restanti membri della famiglia reale spagnola di lasciare il paeseSmerdou, Carlos IV en el exilio , p. 112.Smerdou, Carlos IV en el exilio , p. 131.. Mentre i suoi genitori e fratelli maggiori erano a Bayonne con Napoleone, Francesco, allora quattordicenne, fu lasciato al Palazzo Reale di Madrid con sua sorella, la deposta regina d'Etruria, e i suoi figli. Il 2 maggio 1808, alla partenza di Francesco di Paola, ultimo maschio della famiglia reale rimasto in terra spagnola, una folla si radunò davanti al Palazzo Reale nel tentativo di impedirne l'allontanamento. L'apparizione di Francesco, pallido e sopraffatto dall'emozione, commosse la folla: benché fosse scarsamente armata, la popolazione si scontrò con le truppe francesi. La rivolta popolare spontanea contro gli invasori francesi si diffuse in tutta Madrid, ma il generale Murat represse brutalmente la ribellioneSmerdou, Carlos IV en el exilio , p. 256..

Esilio Per i successivi sei anni tutti i membri della famiglia reale spagnola vissero in esilio. Ferdinando VII, suo fratello l'Infante Don Carlo e il loro zio, il vecchio Infante Don Antonio, furono confinati sotto stretta sorveglianza al castello di ValençayMateos, Los desconocidos infantes de España, p. 112.. Francesco, ancora adolescente, era l'unico figlio autorizzato ad accompagnare i suoi genitori in esilio in FranciaMateos, That Sweet Young Infante, p. 199..

Il re Carlo IV, la regina e l'infante Francisco de Paula, sempre seguiti da Godoy, si installarono al castello di Compiègne. Alla ricerca di un clima più caldo, si trasferirono a Marsiglia nell'ottobre 1808Smerdou, Carlos IV en el exilio , p. 143.. Trascorsero lì i successivi quattro anni, in circostanze sempre più tese. La sorella dell'Infante, l'ex regina d'Etruria, fu imprigionata in un convento a Roma da Napoleone. Per essere più vicini a lei – e con bei ricordi dei loro primi anni a Napoli e Parma – i genitori di Francesco si trasferirono con lui a Roma nel luglio 1812. Si stabilirono a Palazzo Borghese. Durante i Cento Giorni, in seguito alla fuga di Napoleone dall'Elba, Murat, re di Napoli dal 1808, marciò su Roma in nome dell'imperatore. La famiglia fuggì a Verona. Dopo la definitiva sconfitta di Napoleone, la famiglia reale tornò a Roma, trasferendosi a Palazzo BarberiniSmerdou, Carlos IV en el exilio , p. 243..

Durante l'esilio, l'educazione di Francesco fu trascurata. Godoy, che condivideva la stessa casa con la famiglia reale deposta, gli diede alcune lezioni. A Roma, i genitori di Francesco cercarono di condurlo a una carriera ecclesiastica. Ricevette ordini minori, indossò quotidianamente abiti religiosi e il Papa si offrì di farlo cardinale. Tuttavia Francesco non aveva una vera inclinazione per la vita clericale. Senza fratelli vicini alla sua età, la compagnia costante di Francesco era la figlia di Godoy, Carlota de Godoy Borbon, duchessa di Sueca. Nel 1814 Francesco de Paula aveva vent'anni e Carlota quattordici. Siccome si volevano bene, la regina Maria Luisa volle che si sposassero. Francesco de Paula era riluttante. Scontento della presenza opprimente di Godoy e della corruzione che lo circondava, l'Infante scrisse a suo fratello il re, chiedendogli di poter rinunciare ai suoi ordini religiosi e di poter invece seguire una carriera nell'esercito spagnoloMoral, El Infante don Francisco de Paula de Borbón: masonería y liberalismo a la sombra del trono , p. 151. Ferdinando VII, restaurato sul trono spagnolo dopo la caduta di Napoleone, richiamò suo fratello in Spagna per vanificare la prospettiva di un matrimonio con la figlia di Godoy. Nell'agosto 1816, sia Carlos IV che la regina Maria Luisa permisero al figlio più giovane di partire poiché il suo comportamento a Roma aveva creato preoccupazioneSmerdou, Carlos IV en el exilio , p. 272..

L'Infante lasciò Roma il 22 novembre 1816. Mentre era a Lione in viaggio per la Spagna, rimase coinvolto in uno scandalo che fece deragliare il viaggio. Si scoprì che aveva preso come amante l'amante di uno dei suoi servi, che approfittò finanziariamente della situazione. L'Infante chiese perdono. Ferdinando VII perdonò il fratello ma ritardò il suo ritorno a Madrid, ordinandogli di viaggiare per le corti europeeMoral, El Infante don Francisco de Paula de Borbón: masonería y liberalismo a la sombra del trono , p. 152. Per i successivi diciassette mesi l'Infante visitò Parigi, Bruxelles, Amsterdam, Francoforte, Berlino, Weimar, Lipsia, Dresda, Praga e Vienna. C'erano piani per farlo sposare con una principessa di Sassonia. Nel dicembre 1817, Carlo IV propose di sposare Francesco con una delle figlie gemelle del re di BavieraMoral, El Infante don Francisco de Paula de Borbón: masonería y liberalismo a la sombra del trono , p. 153. Nessuno di questi due progetti è andato a buon fine. L'Infante voleva sposare sua nipote, la Principessa Maria Luisa Carlota di Parma, allora quattordicenne. Tuttavia, la madre della principessa, Maria Luisa (ex regina d'Etruria), si oppose all'unione, ritenendo il fratello ventiduenne troppo temerario per la giovane figlia. Nel marzo 1818, Ferdinando VII, pressato dalla moglie Isabella di Braganza, ordinò infine al fratello di tornare in Spagna.

Matrimoni Primo matrimonio L'infante Francesco tornò in Spagna nell'aprile 1818. Ferdinando VII non permise a suo fratello una posizione di comando nell'esercito spagnolo come aveva desiderato Francesco, ma per il resto lo inondò di onori e privilegi. L'Infante fu nominato Cavaliere degli ordini di Santiago, Calatrava, Alcántara e Montesa, oltre ad avere il controllo e le rendite di alcune delle grandi proprietà che questi ordini detenevano in Spagna. Divenne anche un cavaliere anziano degli ordini di San Giovanni di Gerusalemme che portò benefici simili. Ha ricevuto l'ordine francese di Santo Spirito ed è stato nominato membro onorario della Real Academia de Bellas Artes de San Fernando.

Quando l'infante Francesco si stabilì nel Palazzo Reale, suo padre, Carlos IV, poco prima della sua morte, negoziò il matrimonio di Francesco con la principessa Luisa Carlotta di Borbone-Due SicilieMoral, El Infante don Francisco de Paula de Borbón: masonería y liberalismo a la sombra del trono , p. 154. Ciò avvenne con il consenso di Ferdinando VII. Luisa Carlotta era la figlia maggiore di Francesco I delle Due Sicilie e di Maria Isabella di Borbone-Spagna, sorella dell'infante FrancescoMateos, Los desconocidos infantes de España, p. 114.. Questa era un'unione tra zio e nipote. La coppia si sposò per procura il 15 aprile 1819. Il 14 maggio Luisa Carlotta arrivò a Barcellona. Il matrimonio ebbe luogo il 9 giugno 1819 al Palazzo Reale di Madrid. Francesco aveva venticinque anni e Luisa Carlotta solo quindici. Era vivace, spiritosa, volitiva, irascibile e ambiziosa. Luisa Carlotta dominò rapidamente suo marito, conquistò il cuore del re e iniziò a produrre figli a cui fu concesso il grado e lo status di Infanti di SpagnaMateos, Los desconocidos infantes de España, p. 115.. La coppia ebbe undici figli:

Francesco d'Assisi Luigi, Infante di Spagna (1820-1821); Isabella, Infanta di Spagna (1821-1897), sposò il conte Ignaz Gurowski; Francesco d'Assisi, Duca di Cadice, re-consorte di Spagna (1822-1902), sposò la regina Isabella II di Spagna, sua cugina; Enrico Maria Ferdinando, Duca di Siviglia (1823-1870), sposò Elena de Castellvi y Shelly-Fernandez de Cordova; Luisa Teresa, Infanta di Spagna (1824-1900), sposò José Maria Osorio de Moscoso, duca di Sessa; Duarte Filippo, Infante di Spagna (1826-1830); Giuseppina, Infanta di Spagna (1827-1920), sposò José Güell y Rente; Teresa, Infanta di Spagna (1828-1829); Ferdinando, Infante di Spagna (1832-1854); Maria Cristina, Infanta di Spagna (1833-1902), sposò il cugino, l'Infante Sebastiano di Borbone-Spagna; Amalia Filippina, Infanta di Spagna (1834-1905), sposò Adalberto Guglielmo di Baviera.