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La terza stagione di Battlestar Galactica è stata trasmessa sul canale Sci Fi Channel dal 6 ottobre 2006 al 25 marzo 2007. In Italia, invece, è andata in onda su FX dal 5 maggio al 7 luglio 2007.

nºTitolo originaleTitolo italianoPrima TV USAPrima TV Italia 1 Occupation L'attentato 6 ottobre 2006 5 maggio 2007 2 Precipice Esecuzione sommaria 3 Exodus, Part I & II Esodo (prima e seconda parte) 13 ottobre 2006 12 maggio 2007 4 20 ottobre 2006 5 Collaborators Collaboratori 27 ottobre 2006 19 maggio 2007 6 Torn Odio e rancore 3 novembre 2006 7 A Measure of Salvation Il prezzo della salvezza 10 novembre 2006 26 maggio 2007 8 Hero Eroe 17 novembre 2006 9 Unfinished Business Conti in sospeso 1º dicembre 2006 2 giugno 2007 10 The Passage Il passaggio 8 dicembre 2006 11 The Eye of Jupiter L'occhio di Giove 15 dicembre 2006 9 giugno 2007 12 Rapture Gli ultimi cinque 21 gennaio 2007 13 Taking a Break from All Your Worries Un attimo di pausa 28 gennaio 2007 16 giugno 2007 14 The Woman King Il medico della morte 11 febbraio 2007 15 A Day in the Life Anniversario di matrimonio 18 febbraio 2007 23 giugno 2007 16 Dirty Hands Mani sporche 25 febbraio 2007 17 Maelstrom Tragico epilogo 4 marzo 2007 30 giugno 2007 18 The Son Also Rises Anche i figli si ribellano 11 marzo 2007 19 Crossroads: Part I & II Crocevia (prima e seconda parte) 18 marzo 2007 7 luglio 2007 20 25 marzo 2007

L'attentato Titolo originale: Occupation Diretto da: Sergio Mimica-Gezzan Scritto da: Ronald D. Moore Trama La terza stagione ha inizio con dei flash di grande impatto che illustrano quanto sia dura la condizione di prigionieri, in diverse forme, di Scorpion e Tigh oltre al comportamento, come al solito ambivalente, di Ellen, la moglie del colonnello.

Dopo 132 giorni dallo sbarco dei cyloni, i coloniali sopravvivono su New Caprica come possono, sotto il giogo degli invasori. Tigh (cieco ad un occhio cavatogli sotto tortura), Tyrol ed Anders sono i leader dei ribelli con l'ausilio di un appoggio anonimo dall'ufficio della presidenza (che si rivelerà essere il tenente Gaeta) mentre altri umani sono divenuti dei collaborazionisti, membri della cosiddetta "polizia provvisoria". Scorpion è tenuta prigioniera da una copia di Numero Due che vorrebbe farla diventare sua compagna devota ed innamorata.

Intanto nello spazio, l'ammiraglio Adamo ed il resto del suo equipaggio discutono sui tempi ed i modi del ritorno su New Caprica. Apollo, visibilmente sovrappeso, riceve grosse critiche dal padre che lo accusa di essersi eccessivamente "rilassato" durante l'ultimo anno e mezzo di forzata inattività. Sul pianeta, i resistenti inviano un ex combattente in missione suicida per uccidere quanti più collaborazionisti possibile oltre al presidente Baltar, ma questi, per un imprevisto legato alla propria pigrizia ed incompetenza, riesce a scampare.

Esecuzione sommaria Titolo originale: Precipice Diretto da: Sergio Mimica-Gezzan Scritto da: Ronald D. Moore Trama Il presidente Baltar va dalla Roslin, adesso in isolamento, le intima di dissociarsi dagli attacchi suicidi e la fa rilasciare. L'ex presidente non concede nulla all'interlocutore, ma faccia a faccia con Tigh, lo critica duramente senza però sortire l'effetto sperato: gli attacchi continueranno. Sul Galactica, l'ammiraglio Adamo progetta un'azione disperata per salvare i coloni su New Caprica imperniata sull'impegno attivo sul campo di Sharon. Apollo si dichiara immediatamente contrario; la sua priorità è quella di salvare i superstiti a bordo delle navi coloniali. Scorpion, imprigionata dal giorno di sbarco dei cyloni, apprende l'esistenza di Kacey, la figlia nata da un suo ovulo sottrattole durante la sua permanenza nella "Fattoria" fecondato da Numero Due che non intende lasciar nulla di intentato per "conquistare" la sua amata. Scorpion, sconvolta dalla notizia di una figlia segreta, lascia la bambina da sola nella stanza-prigione dove vive da mesi, salvo poi accorgersi, dopo un incidente domestico capitato alla bambina, di essere già legata alla piccola.

Alla fine la situazione precipita; un altro attacco suicida provoca una dura rappresaglia cylone. "O si aumenta il controllo o si perde il controllo" sentenzia Fratello Cavil. I rappresentanti Cyloni obbligano Baltar, sotto minaccia delle armi, a firmare un ordine che prevede l'esecuzione sommaria di più di duecento coloni (tra i quali anche Cally, Roslin e Zarek) rapiti nelle loro tende la notte precedente.

Esodo, Parte I Titolo originale: Exodus, Part I Diretto da: Félix Enríquez Alcalá Scritto da: Bradley Thompson e David Weddle Trama Un collaborazionista "pentito" libera Cally pochi istanti prima dell'esecuzione firmata da Baltar. L'azione si sposta di un'ora indietro con Tigh e Tyrol che pianificano la (vincente) missione di salvataggio dei condannati e, contemporaneamente, Anders e Sharon vengono attaccati nel luogo fissato per l'incontro. La prudenza di quest'ultima evita la disfatta inoltre si scopre che la Signora Tigh è la traditrice.

In sogno, Numero Tre scopre che la bimba metà umana e metà cylone è viva e si mette alla sua ricerca. Scorpion, invece, scopre un lato di sé che non conosceva e il rapporto con la bimba si fa sempre più stretto. Sul Galactica, i dettagli del piano sono definiti: Apollo condurrà la flotta al sicuro, attenderà 18 ore il Galactica con le altre navi e poi continuerà la ricerca della Terra. Tramite Sharon, la resistenza e il Galactica coordinano le operazioni: per coprire l'arrivo della nave i ribelli dovranno compiere attacchi simultanei per distrarre le difese cyloni. Cyloni che, dalla loro, paiono molto "demotivati" e valutano seriamente la possibilità di andarsene previa nuclearizzazione di tutti gli esseri umani su New Caprica.

Sharon si infiltra nella base nemica e recupera le "chiavi di lancio" per permettere alle navi di riprendere il volo con Tigh che, disperato, affronta la moglie traditrice. Numero Tre si accorge di Sharon e, in un intenso confronto, la informa che sua figlia è viva, ma il (nuovamente) tenente non le crede. Le spara e se va. Adesso tutte le pedine sono al proprio posto; il Galactica è pronto ad attaccare.

Esodo, Parte II Titolo originale: Exodus, Part II Diretto da: Félix Enríquez Alcalá Scritto da: Bradley Thompson e David Weddle Trama Tigh consola la moglie e le offre da bere dicendole che ha capito che le sue azioni erano solo per proteggerlo. La donna si accascia lentamente, avvelenata dal marito. In orbita, l'attacco ha inizio: due squadre composte da viper e raptor lanciano dei “droni” per simulare la presenza di due astronavi sul DRADIS cylone. Come previsto due astrobasi cyloni vengono dirottate per fronteggiare il fasullo nemico e il Galactica si getta nell'atmosfera di New Caprica inviando i viper a supporto dei ribelli. Anders e i suoi fanno irruzione nel centro di detenzione liberando i prigionieri tra cui una Scorpion priva di sensi.

I cyloni però, si accorgono del trucco e fanno riconvergere le astrobasi in un attacco simultaneo al Galactica. La situazione è disperata per i nostri: i motori FTL sono distrutti, la struttura compromessa, la fine si avvicina. “Onore al merito”, l'Ammiraglio Adamo elogia il coraggio e la perizia dell'equipaggio e si prepara a morire. In quel momento la Pegasus comandata da Apollo giunge in battaglia e sferra l'attacco alle astrobasi cyloni distruggendone subito una e dando la possibilità al Galactica di riparare i motori FTL e riorganizzarsi. Adesso, però, è la Pegasus sotto attacco e in grossa difficoltà.

Intanto nel Colonial One Gaeta è deciso a uccidere il presidente ma desiste e in cambio Baltar giura di rimediare impedendo a Numero Tre D'Anna di nuclearizzare il pianeta. Scorpion, ripresasi, torna nell'alloggio/prigione per riprendere Kacey e lì affronta e uccide di nuovo Numero Due che le ripete il suo “amore”. In orbita, la Pegasus ormai distrutta viene fatta evacuare da Apollo e scontrare con una astrobase cylone. L'impatto ne distruggerà anche una terza: l'esito della battaglia è capovolto.

I cyloni si ritirano con D'Anna e Numero Sei che trovano la piccola Hera illesa tra le braccia della defunta Maya. Baltar si unisce a loro dopo la promessa di Numero Tre che non attiverà la bomba. Scorpion ritrova Anders, ma anche la vera madre di Kacey che riprende la piccola: le parole di Leoben erano menzogne. Laura Roslin si riappropria del Colonial One e fa rientro sul Galactica insieme agli abitanti di New Caprica che portano l'Ammiraglio Adamo in trionfo. La puntata si chiude sullo sguardo affranto di Tigh senza l'adorata consorte: non tutti si sono salvati su New Caprica.

Collaboratori Titolo originale: Collaborators Diretto da: Michael Rymer Scritto da: Mark Verheiden Trama A bordo delle navi coloniali una commissione istituita dall'attuale Presidente Zarek, formata dal Colonnello Tigh, Capo Tyrol e i civili Samuel Anders, Charlie, Diana e Jean, è chiamata a giudicare (e condannare a morte, nel caso) i "collaborazionisti", ovvero quelle persone che, in vari modi, hanno collaborato con i cyloni durante l'occupazione. Intanto, su una astrobase cylone, l'ormai ex presidente Baltar si sveglia dopo tre giorni, prigioniero.

A bordo del Colonial One, il Presidente Zarek, conscio dell'impossibilità di mantenere il potere senza l'appoggio militare, convoca la Dott.ssa Roslin e le offre la presidenza in cambio di una carica politica di rilievo proprio mentre l'Ammiraglio Adamo scopre che alcune persone stanno sparendo a bordo della sua nave: l'epurazione è iniziata. Il prossimo bersaglio è il tenente Felix Gaeta e qui la commissione si divide a causa dell'inconsistenza delle prove di colpevolezza a suo carico. Anders si dimette ed è sostituito dalla moglie Scorpion che decreta la colpevolezza di Gaeta. Nel mondo cylone, il destino di Baltar è appeso a un filo: è in corso una votazione sul fatto di giustiziarlo o no e, per adesso, il parziale vede tre voti a favore dell'esecuzione e tre contro: il voto di una quanto mai incerta Caprica Six sarà quello decisivo.

Il tenente verrà salvato in extremis poiché costretto da una furente Scorpion a rivelare, in propria difesa, che era proprio lui il contatto nella presidenza, essenziale nel coordinare l'azione dei ribelli a quella del Galactica. Contemporaneamente la nuova Presidente Laura Roslin emana un decreto di amnistia volta ad accendere un sentimento di conciliazione nazionale. Conto dei superstiti: 41.435

Odio e rancore Titolo originale: Torn Diretto da: Jean de Segonzac Scritto da: Anne Cofell Saunders Trama Dopo che Scorpion si è scontrata con il suo Viper durante un addestramento, Apollo le toglie il permesso di volare. Il colonnello Tigh è in lutto per la moglie. Lui e Scorpion criticano i membri dell'equipaggio che hanno trascorso l'occupazione su New Caprica con la flotta, fino a quando l'ammiraglio Adamo gli ordina di fermarsi. Scorpion se ne va stizzita, ma successivamente si taglia i capelli e cerca Kacey per salutarla. Tigh invece si rinchiude nella sua stanza e inizia a bere pesantemente.

Il tenente Felix Gaeta ricostuisce il lavoro di Gaius Baltar sulla posizione della Terra e determina che la flotta deve navigare verso una nebulosa a forma di testa di leone (la Nebulosa Testa di Leone appunto). I piloti scelgono il nuovo soprannome per Sharon, "Athena", dopo aver spiegato che "Boomer" si riferiva a qualcun altro.

Conto dei superstiti: 41.422

Il prezzo della salvezza Titolo originale: A Measure of Salvation Diretto da: Bill Eagles Scritto da: Michael Angeli Trama Gaius, ritornato a bordo dell'astrobase cylone dopo la missione sulla nave infetta, viene torturato dai cyloni perché ritenuto colpevole di averli ingannati e convinti a inviare una loro nave verso il radiofaro infetto rinvenuto nella Nebulosa del Leone. Tale convinzione dei cyloni viene avvalorata dal fatto che Gaius salito a bordo dell'astrobase infetta nasconda deliberatamente al suo ritorno di aver visto il radiofaro.