Carriera Zaballa passò professionista nel 2001 con la Kelme. Vi rimase fino al 2003, quando si trasferì alla Saunier Duval-Prodir, con la quale vinse una tappa alla Vuelta a España 2004 e la Clásica San Sebastián 2005. Nel 2006, mentre era sotto contratto con la Caisse d'Epargne, fu coinvolto nell'Operación Puerto e sospettato di aver avuto dei contatti con il dottor Fuentes. Poté tuttavia continuare a correre e nel 2007 vinse la Euskal Bizikleta.
Da allora, come altri ciclisti spagnoli coinvolti nell'Operación Puerto, ha corso per alcune stagioni con piccole squadre portoghesi vincendo, nel 2010, la Vuelta a Asturias. Nel 2011 ha vestito la divisa del team Continental italiano Miche-Guerciotti, per poi ritirarsi dall'attività al termine della stagione. Dopo il ritiro, a seguito di una positività all'efedrina riscontrata in un controllo antidoping durante la Vuelta a Asturias 2010, è stato squalificato per nove mesi dall'UCI e privato dei risultati ottenuti dal maggio del 2010.
Scontata la squalifica, ha ripreso a correre nel 2013 con la Christina Watches-Onfone, vincendo due tappe al Tour de Tipaza, corsa a tappe algerina, e la Destination Thy in Danimarca. Ha concluso l'attività professionistica al termine della stagione 2014.
Palmarès Strada 2001 1ª tappa Giro del Portogallo 8ª tappa Tour de l'Avenir
2004 3ª tappa Vuelta a Aragona 19ª tappa Vuelta a España
2005 Classica di San Sebastián
2007 3ª tappa Euskal Bizikleta Classifica generale Euskal Bizikleta
2008 3ª tappa GP Internacional Paredes Rota dos Móveis
2010 5ª tappa Vuelta a Asturias Classifica generale Vuelta a Asturias
2011 5ª tappa Vuelta a Asturias
2013 1ª tappa Tour de Tipaza Classifica generale Tour de Tipaza Destination Thy
Altri successi 2005 Classifica scalatori Volta a la Comunitat Valenciana
2011 Classifica a punti Vuelta a Asturias
Ciclocross 2008-2009 (L.A. Aluminios-MSS) Ciclocross de Medina de Pomar
Piazzamenti Grandi Giri
Giro d'Italia 2003: 27º
Tour de France 2002: 116º 2005: ritirato (5ª tappa)
Vuelta a España 2003: 30º 2004: 30º 2005: 58º
Competizioni mondiali
Campionati del mondo su strada Verona 2004 - In linea: 45º Madrid 2005 - In linea: 16º
Campionati del mondo di ciclocross Hoogerheide 2009 - Elite: 29º Tábor 2010 - Elite: 46º
Note
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