Questa voce raccoglie le informazioni riguardanti l'Associazione Calcio Pisa 1909 nelle competizioni ufficiali della stagione 2012-2013.
Stagione I neroazzurri vengono inseriti nel girone B della Lega Pro Prima Divisione (composto da sole 16 squadre), assieme a molte squadre meridionali e alle altre toscane (, e ). Viene riconfermato sulla panchina pisana Alessandro Pane.
Quanto al calciomercato il Pisa conferma l'ossatura della squadra: Maurizio Pugliesi, Francesco Colombini, Amedeo Benedetti, Francesco Favasuli, Leonardo Perez, Giacomo Tulli, Leonardo Gatto, affiancandoli a numerosi giovani arrivati in prestito dalle categorie superiori. La difesa viene puntellata con l'ingaggio di Rocco Sabato, mentre a centrocampo arrivano gli esperti Nicola Mingazzini e Antonio Buscè. L'ultimo giorno di mercato estivo viene poi ingaggiato l'attaccante Stefano Scappini.
Dopo un andamento altalenante, il 19 marzo 2013 - a seguito della pesante sconfitta per 3-0 con la - viene esonerato Alessandro Pane e torna per la terza volta sulla panchina nerazzurra Dino Pagliari.
Da lì in poi i risultati migliorano nettamente e la squadra riesce a raggiungere i playoff all'ultimo tuffo. In semifinale il Pisa elimina il favoritissimo (arrivato secondo), ma poi nella finale con il deve piegarsi ai tempi supplementari: i pontini arrivano in serie B per la prima volta nella loro storia.
Rosa
Risultati Lega Pro Prima Divisione
Girone di andata
Girone di ritorno
Play-off
Coppa Italia
Coppa Italia Lega Pro
I nerazzurri non partecipano alla fase a gironi, ma sono direttamente ammessi al Primo Turno della fase eliminatoria.
Statistiche Statistiche di squadra
Note