Lo Zagreb Open 2006 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 2006. Il torneo si è giocato a Zagabria in Croazia dal 15 al 21 maggio 2006 su campi in terra rossa.
Vincitori Singolare
Daniel Elsner ha battuto in finale Victor Crivoi con il punteggio di 4–6, 6–1, 6–2
Doppio
Yves Allegro / Michal Mertiňák hanno battuto in finale Julien Jeanpierre / Nicolas Renavand con il punteggio di 6–1, 6–2
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