Il Samarkand Challenger 2006 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 2006. Il torneo si è giocato a Samarcanda in Uzbekistan dal 14 al 20 agosto 2006 su campi in Terra rossa.
Vincitori Singolare
Janko Tipsarević ha battuto in finale Édouard Roger-Vasselin con il punteggio di 6–3, 6–2
Doppio
Satoshi Iwabuchi / Gouichi Motomura hanno battuto in finale Jun Woong-sun / Frank Moser con il punteggio di 2–6, 6–2, [10-5]
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