Il San Diego Challenger 1998 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 1998. Il torneo si è giocato a San Diego negli Stati Uniti dal 12 al 18 ottobre 1998 su campi in cemento.
Vincitori Singolare
Ville Liukko ha battuto in finale Paul Goldstein con il punteggio di 7–5, 7–6
Doppio
Paul Goldstein / Adam Peterson hanno battuto in finale Michael Hill / Scott Humphries con il punteggio di 6–2, 7–5
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