Il pino di Jeffrey (Pinus jeffreyi) e l'angiosperma Dodecatheon jeffreyi delle Primulaceae, sono due specie che omaggiano il suo nome.
Bibliografia
Harvey, A. G., John Jeffrey: Botanical Explorer, in The Siskiyou Pioneer in Folklore, Fact and Fiction and Yearbook, Siskiyou County Historical Society. 1947. pp. 17-19, 39.