Endocnidozoa亜門（Endocnidozoaあもん、、学名：）は、ポリポディウム綱とミクソゾア綱をまとめた刺胞動物の分類群である。本分類群に含まれる2綱はどちらも内部寄生性だが、それぞれ独立して寄生生活を獲得したと考えられる。
系統関係 Endocnidozoa亜門は刺胞動物の中で、亜門と姉妹群を成す。この関係は数多くの分子系統解析によって支持されている。
概要 Endocnidozoa（エンドクニドゾア）亜門は、刺胞動物門に属する分類群の一つ。チョウザメ類の卵などに寄生するポリポディウム綱（Polypodiozoa）と、主として魚類に寄生するミクソゾア綱（Myxozoa）の2つの綱（二系統）で構成される。 本分類群に属する生物はすべて他の動物の体内に侵入して生活する「内部寄生性」に特化しており、通常のクラゲやサンゴのような自由生活期を持たない。かつてミクソゾアは独自の「胞子虫」として単細胞の原生動物に分類されていたが、分子系統解析および極嚢（胞子発射組織）が刺胞動物の「刺胞」と相同であることが明らかになり、本門へ組み込まれた。
系統関係と進化 Endocnidozoa亜門（ミクソゾア綱 ＋ ポリポディウム綱）は、分子系統解析（SSU rDNAなど）において単系統群を形成することが示されている。しかし、この2つの系統は形態や生活環が大きく異なっており、「それぞれが独立して寄生生活を獲得した（収斂進化）」と考えられている。
二系統の特徴と違い = ポリポディウム綱 (Polypodiozoa) : チョウザメ類の卵細胞内に寄生する。細胞内で裏返しの状態で成長し、のちに脱出して自由生活を行うなど、極めて特異な生活環を持つ。
ミクソゾア綱 (Myxozoa) : 主に魚類と環形動物（イトミミズなど）の2つの宿主を交代しながら寄生する（一部はコケムシに寄生）。多細胞動物でありながら、寄生生活への適応として体構造を極限まで退化・単純化させており、かつては原生生物と誤認されていた。
系統的位置をめぐる議論 近年の分子系統学（ゲノムデータ解析）においては、Endocnidozoaの系統的位置について主に以下の2つの仮説が議論されている。
水母亜門（Medusozoa）の内部、あるいはその近縁（ヒドロ虫綱の姉妹群）とする説：特にポリポディウム綱やミクソゾア綱の持つ一部の神経ペプチド遺伝子や特徴が、ヒドロ虫類と共通している点から支持される。
花虫亜門（Anthozoa）や他のすべての刺胞動物の姉妹群（根元で分岐した系統）とする説。
脚注
出典
参考文献