Ct値（シーティーち、英: cycle threshold または threshold cycle）は、リアルタイムPCRにおいて蛍光シグナルが設定した閾値を初めて超える増幅サイクル数を指す指標である。
概要 Ct値は試料中の標的DNAまたはRNAの初期量と逆相関し、標的核酸量が多いほど少ない増幅サイクルで蛍光シグナルが閾値に達するため、Ct値は小さくなる。逆に、同一の検査系・測定条件では、Ct値が高いほど閾値に達するまでに多くの増幅サイクルを要し、試料中の標的核酸の初期量が少ないことを示す。この指標は遺伝子発現量の相対定量や絶対定量に広く用いられる。MIQEガイドラインでは、Ct値の測定条件や解析方法を適切に報告することの重要性が指摘されている。
用語 Ct値は、threshold cycleまたはcycle thresholdの略称として用いられる。一方、MIQEガイドラインでは、装置メーカーごとに異なるCt、Cp、TOPなどの呼称を統一するため、quantification cycleを意味するCqという用語の使用が提案されている。
解釈上の注意 Ct値は試料中の標的核酸量を推定するための指標であるが、測定値は閾値の設定、PCR効率、試料の品質、阻害物質の有無、検出試薬、装置、解析ソフトウェアなどの影響を受ける。そのため、異なる検査系や施設で得られたCt値を単純に比較することは適切ではない。
感染症検査におけるCt値 感染症の核酸検査では、Ct値が低いほど検体中の標的核酸量が多い傾向を示す。ただし、Ct値は検体採取時期、採取部位、検体量、保存・輸送条件、検査法などの影響を受けるため、Ct値のみから感染性や重症度を判断することはできない。
脚注
関連項目 リアルタイムPCR 相対定量 絶対定量