オウム真理教事件（オウムしんりきょうじけん）は、1980年代末期から1990年代中期にかけてオウム真理教が起こした一連の事件の総称である。
概要 オウム真理教の教祖である麻原彰晃（本名：松本智津夫）が、1990年代（平成初期）に宗教を隠れ蓑に日本国（政府）を転覆して、自らがその王として君臨するという野望を抱き、それを現実化せんとする過程で、世界各国での軍事訓練や軍事ヘリの調達、自動小銃の製造や化学兵器（サリンやVX）の生産を行い武装化し、教団と敵対する人物の殺害や、無差別テロを実行した一連の事件をいう公安調査庁の公式YouTube動画。29人が死亡し（殺人28名、逮捕監禁致死1名地下鉄サリン事件発生直後に入浴し溺死した人物。松本サリン事件で負傷した河野義行の妻。）負傷者は6,000人を超えた。教団内でも判明しているだけで5名が殺害され、死者・行方不明者は30名を超える『生きている不思議 死んでいく不思議』-某弁護士日記「死刑執行回避署名のお願い」。社会に与えた影響などから、2014年（平成26年）に警視庁の行ったアンケートで「警視庁140年の十大事件」一位とされている。
特に注目された事件として、教団と対立する弁護士とその家族を殺害した1989年（平成元年）11月の坂本堤弁護士一家殺害事件、教団松本支部立ち退きを求める訴訟を担当する判事の殺害を目的としてサリンを散布し計7人の死者と数百人の負傷者を出した1994年（平成6年）6月27日の松本サリン事件、教団への捜査の攪乱と首都圏の混乱を目的に5輌の地下鉄車輌にサリンを散布して計12人刑事訴訟としては12人。オウム被害者救済法としては13人。の死者と数千人の負傷者を出した1995年（平成7年）3月20日の地下鉄サリン事件が挙げられる。多数の死傷者を出したこれら3つの事件に対して、毎日新聞では「オウム3大事件」と表現している。神奈川新聞、日刊スポーツ、スポーツ報知など他のメディアも、2018年（平成30年）7月のオウム死刑執行の報道では、オウム死刑囚が3大事件のどれに関与したかを報じている。
2011年（平成23年）12月、それまでに起訴された全ての刑事裁判が終結し、189人アレフ発足以後の逮捕者を除く。が起訴され、13人の死刑判決と5人の無期懲役判決が確定した。同年12月31日には16年以上にわたり逃亡を続けてきた平田信が警視庁に出頭し、翌2012年（平成24年）1月1日に逮捕され、平田を匿って逃亡に協力していた元女性出家信者も同年1月10日に逮捕、両者とも起訴された。同年6月3日には同じく逃亡していた菊地直子が潜伏先で逮捕され、同月15日には同じく逃亡を続けていた高橋克也が身柄を確保、逮捕された。これで警察庁からオウム真理教事件に関する特別指名手配を受けていた3人は、すべて逮捕・起訴された（平田は2016年（平成28年）1月13日に懲役9年、菊地は2017年（平成29年）12月27日に無罪が確定）。
最後のオウム事件被告である高橋は、最高裁まで争い2018年1月18日付で上告棄却、1月25日付で異議申立ても棄却されたことにより無期懲役が確定し、これをもってオウム事件の裁判は完結。7月6日に麻原と側近の計7名、7月26日には他の側近6名の死刑がそれぞれ執行され、刑事上では収束となった。
事件一覧
+オウム真理教事件発生年月日事件名死者（人）負傷者（人）動機 1988年9月22日 在家信者死亡事件（立件なし）10信者の事故死とその隠蔽 1989年2月10日 男性信者殺害事件10 教団から脱退しようとした人物の殺害 1989年11月4日 坂本堤弁護士一家殺害事件30 教団と敵対する人物の殺害 1990年 国土法違反事件土地売買の隠蔽 1991年 女性信者殺害事件（立件なし）10スパイと疑った信者の殺害 1992年9月14日 オカムラ鉄工乗っ取り事件（立件なし） 資産の強奪と教団の武装化 1993年6月6日 逆さ吊り死亡事件10信者の事故死とその隠蔽 1993年6月28日 第一次亀戸異臭事件（立件なし）00 細菌兵器培養と無差別テロ 1993年7月2日 第二次亀戸異臭事件（立件なし）00 細菌兵器培養と無差別テロ 1993年11月 第一次池田大作サリン襲撃未遂事件（立件なし）00 教団と敵対する創価学会指導者の暗殺 1993年11月～ サリンプラント建設事件 教団の武装化 1993年12月18日 第二次池田大作サリン襲撃未遂事件（立件なし）0数名実行犯の新実智光も負傷。 教団と敵対する創価学会指導者の暗殺 1994年1月30日 薬剤師リンチ殺人事件10 教団から脱退させようとした人物の殺害 1994年2月～ 自動小銃密造事件 教団の武装化 1994年3月27日 宮崎県資産家拉致事件01 資産の強奪 1994年5月9日 滝本太郎弁護士サリン襲撃事件01 教団と敵対する人物の殺害 1994年5月～ LSD密造事件イニシエーション用の違法薬物製造 1994年6月27日 松本サリン事件7裁判で認定された死者数のため、河野義行の妻はカウントしない。600住民調査での数。裁判では144人。1997年12月に裁判迅速化のため4人に変更。降幡賢一『オウム法廷6』 p.27 教団支部立ち退き裁判を担当する判事の殺害とサリンの実験 1994年7月～ 覚醒剤密造事件イニシエーション用の違法薬物製造 1994年7月10日 男性現役信者リンチ殺人事件10 スパイと疑った信者の殺害 1994年7月15日 元仙台支部長死亡事件（立件なし）10 信者の事故死とその隠蔽 1994年7月28日 元女性看護師拉致監禁事件01 教団から脱退しようとした人物の監禁 1994年9月20日 江川紹子ホスゲン襲撃事件（立件なし）01 教団と敵対する人物の殺害 1994年9月～ チオペンタールナトリウム密造事件イニシエーション用の違法薬物製造 1994年11月20日 鹿島とも子長女拉致監禁事件01 出家を拒否した人物の監禁 1994年12月2日 駐車場経営者VX襲撃事件01 教団を脱走した信者を匿った人物の殺害 1994年12月9日 大阪における拉致監禁事件（元自衛官）平成8年警察白書 警察庁「元自衛官拉致事件 オウム大阪支部の幹部逮捕へ」 読売新聞 1995/4/2401 教団から脱退しようとした人物の監禁 1994年12月10日 ピアニスト監禁事件01 出家を拒否した人物の監禁 1994年12月12日 会社員VX殺害事件10 スパイと疑った人物の殺害 1994年12月28日 三菱重工広島研究所侵入事件東京キララ社編集部『オウム真理教大辞典』 p.128 データ収集 1994年12月?日 府中運転免許試験場侵入事件 データ収集 1994年12月～1995年3月 メスカリン密造事件イニシエーション用の違法薬物製造 1995年1月4日 被害者の会会長VX襲撃事件01 教団と敵対する人物の殺害 1995年1月 自動車免許証偽造事件 犯罪目的で偽造免許証を製作 1995年2月28日 公証人役場事務長逮捕監禁致死事件10 教団を脱走した信者を匿った人物の拉致と多額の布施を見込める信者の奪還 1995年3月15日 霞ケ関駅アタッシュケース事件（立件なし）00 教団への捜査の攪乱と首都圏の混乱 1995年3月19日 大阪における拉致監禁事件（大学生）江川紹子『「オウム真理教」追跡2200日』 p.32101 教団から脱退しようとした人物の監禁 1995年3月19日 島田裕巳宅爆弾事件00 偽旗作戦 1995年3月19日 東京総本部火炎瓶投擲事件00 偽旗作戦 1995年3月20日 地下鉄サリン事件126,300 教団への捜査の攪乱と首都圏の混乱 1995年3月20日 名古屋における老女拉致事件01 資産の強奪 1995年3月22日 第6サティアン礼拝堂信者監禁事件「五人は回復に向かう オウム教施設から救出された信徒の容体」 朝日新聞 1995年3月30日朝刊06 教団からの脱会阻止 1995年3月22日 第10サティアン信者監禁事件0 教団からの脱会阻止 1995年4月～5月 新宿駅青酸ガス事件00 教団への捜査の攪乱と首都圏の混乱 1995年5月16日 東京都庁小包爆弾事件01 教団への捜査の攪乱と教団の解散権を持つ都知事への妨害 2000年6月～7月 シガチョフ事件00 獄中の麻原彰晃奪還 ※太字は死者が出た事件。
※死者は刑事裁判で認定された死者数。
その他関連事件・問題 村井秀夫刺殺事件 TBSビデオ問題 農水省オウムソング事件 温熱療法 (オウム真理教) 観念崩壊セミナー オウム真理教ソフト開発業務受注問題 宗教法人オウム真理教解散命令事件 オウム真理教の国家転覆計画 このほか、実行には至らなかったものの宗教団体「幸福の科学」を主宰する大川隆法や教団を風刺する漫画を雑誌連載していた漫画家の小林よしのりを殺害する計画もあった。また、当時新進党幹事長であった有力政治家の小沢一郎も仮想敵としていた。
関与疑惑があった事件、模倣犯・愉快犯等による事件（無関係も含む） テレビ長官狙撃自白報道
日本テレビ郵便爆弾事件 (公訴時効成立) 横浜駅異臭事件 全日空857便ハイジャック事件 全日空61便ハイジャック事件 パソコン遠隔操作事件 八王子スーパー強盗殺人事件（未解決）
その他証言 NHKによれば2004年時点で行方不明者リストには50人以上の名前がある終わらないオウム ～信者の親たちは今～ - NHK クローズアップ現代 全記録。
化学実験中に中毒になった女性信者がオウム真理教附属医院で死亡し無届けで処理されたという証言「『死体、無届け処理』 オウムのN被告、薬物犠牲の女性も目撃」 読売新聞 1995/10/19。 栄養失調になった女性信者が死亡し隠蔽されたという証言「山梨のオウム施設 信者の遺体”極秘処理”」 読売新聞 1995/3/29。 少なくとも5人の信者が薬物により死亡したという報道「信者5人が薬物死 『上九』の施設で昨年秋から」 読売新聞 1995/7/21。
逮捕者 立件された一連の事件に関与して逮捕された者は403名（1996年1月18日時点）、起訴192名。
主要逮捕者
+オウム真理教事件（当表にて、立件されなかった事件は割愛）男 性 信 者 殺 害 事 件坂 本 弁 護 士 事 件国 土 法 違 反 事 件サ リ ン プ ラ ン ト 建 設 事 件薬 剤 師 リ ン チ 殺 人 事 件滝 本 サ リ ン 事 件逆 さ 吊 り 死 亡 事 件自 動 小 銃 密 造 事 件松 本 サ リ ン 事 件男 性 信 者 リ ン チ 殺 人 事 件駐 車 場 経 営 者 V X 襲 撃 事 件会 社 員 V X 殺 害 事 件被 害 者 の 会 会 長 V X 襲 撃 事 件公 証 人 役 場 事 務 長 致 死 事 件島 田 爆 弾 事 件及び火 炎 瓶 事 件地 下 鉄 サ リ ン 事 件新 宿 駅 青 酸 ガ ス 事 件東 京 都 庁 小 包 爆 弾 事 件人物●●●●●●●●●他身柄拘束日判決役職逮捕時のもの。ホーリーネーム 麻原彰晃（松本智津夫）○○○○○○○○○○○○○薬物密造 1995年5月16日死刑2018年7月6日東京拘置所にて執行。神聖法皇マハーグル・アサハラ 井上嘉浩○○○○○○○○○公務執行妨害 1995年5月15日死刑一審は無期懲役判決。2018年7月6日大阪拘置所にて執行。諜報省アーナンダ 遠藤誠一○○○○薬物密造 1995年4月26日死刑第一厚生省ジーヴァカ岡﨑一明（宮前一明）○○ 1995年9月6日死刑2018年7月26日名古屋拘置所にて執行。（脱退）マハーアングリマーラ 土谷正実○○○○○薬物密造 1995年4月26日死刑第二厚生省クシティガルバ 豊田亨○○○○ 1995年5月15日死刑2018年7月26日東京拘置所にて執行。科学技術省ヴァジラパーニ 中川智正○○○○○○○○○○○ 1995年5月17日死刑2018年7月6日広島拘置所にて執行。法皇内庁ヴァジラティッサ 新実智光○○○○○○○○○監禁犯人蔵匿 1995年4月12日死刑2018年7月6日大阪拘置所にて執行。自治省ミラレパ 端本悟○○○ 1995年7月9日死刑自治省ガフヴァ・ラティーリヤ 早川紀代秀○○○○○薬物密造 建造物侵入 1995年4月20日死刑2018年7月6日福岡拘置所にて執行。建設省ティローパ 林泰男（小池泰男）○○○ 1996年12月3日死刑2018年7月26日宮城刑務所にて執行。科学技術省イシディンナ 広瀬健一○○ 1995年5月16日死刑科学技術省サンジャヤ 横山真人○○ 1995年5月16日死刑科学技術省ヴァジラヴァッリィヤ 北村浩一○○ 1996年11月14日無期懲役自治省カッサパ 杉本繁郎○○○ 1995年5月16日無期懲役自治省ガンポパ 高橋克也○○○○○ 2012年6月15日無期懲役諜報省スマンガラ 外崎清隆○ 1995年4月7日無期懲役自治省ローマサカンギヤ 中村昇○○○○ 1995年7月9日無期懲役検察側の求刑は死刑。自治省ウパーリ 林郁夫○○監禁薬物密造犯人蔵匿 1995年4月8日無期懲役治療省クリシュナナンダ 山形明○○○○旅券法 1995年5月4日懲役20年 検察側の求刑は無期懲役、一審は懲役17年判決。自治省ガル・アニーカッタ・ムッタ 富田隆○○ 1995年6月16日懲役17年 検察側の求刑は無期懲役。自治省シーハ 富永昌宏○○○ 1995年10月8日懲役15年法皇官房ヴェーマチトラ 平田悟○○○○ 1995年10月19日懲役15年諜報省ラーダ 渡部和実○○ 1995年5月16日懲役14年科学技術省ゴーサーラ 青山吉伸○○名誉毀損 1995年5月4日懲役12年法務省アパーヤージャハ 越川真一○恐喝執行妨害 1995年4月6日懲役10年商務省メッタジ 後藤誠○ 1995年5月17日懲役10年メーギヤ 藤永孝三○火薬類取締法違反 1995年4月24日懲役10年科学技術省パーラーパリヤ 高橋昌也○○ 1995年5月16日懲役9年建設省スーリヤ 平田信○○ 2012年1月1日懲役9年車両省ポーシャ 大内利裕○○○ 1998年4月19日懲役8年モスクワ支部プンナ・マンターニプッタ 滝澤和義○○ 1995年5月16日懲役8年科学技術省ウパヴァーナ 富樫若清夫○ 1995年5月17日懲役8年科学技術省マハーナーマ 丸山美智麿○○ 1995年7月9日懲役7年自治省スラーダ 飯田エリ子○ 1995年5月29日懲役6年6か月東信徒庁サクラー 井田喜広○ 1995年6月16日懲役6年 松本知子○ 1995年6月26日懲役6年郵政省ヤソーダラー 松下悟史○ 1996年11月24日懲役4年2か月科学技術省サンヴァッディタ 石井久子○○犯人蔵匿 1995年9月6日懲役4年大蔵省マハーケイマ 松本剛○○ 1995年5月18日懲役4年 八木澤善次○ 1996年11月14日懲役4年 佐々木香世子○ 殺人予備1995年5月17日懲役3年厚生省チャーパー 上祐史浩○ 1995年10月7日懲役3年外務省マイトレーヤ 森脇佳子○殺人予備 1995年5月16日懲役3年厚生省ヴァジラ・サンガー 大内早苗 営利誘拐1995年5月12日懲役2年4か月新信徒庁ソーナー 長谷川茂之○ 1995年4月24日懲役1年6か月自治省 山本まゆみ○犯人蔵匿 1995年11月23日懲役1年4か月労働省キサーゴータミー 岐部哲也 建造物侵入1995年4月8日懲役1年防衛庁マハーカッサパ 都沢和子 建造物侵入1995年5月10日懲役1年西信徒庁ウッパラヴァンナー 菊地直子○2012年6月3日無罪一審は懲役5年判決。第二厚生省エーネッヤカ・ダーヴァナ・パンニャッター 石川公一 容疑のみ1995年4月8日不起訴法皇官房サルヴァニー・ヴァラナヴィシュカンビン 村井秀夫○○○○○○○○○ 1995年4月24日死亡（村井秀夫刺殺事件）科学技術省マンジュシュリー・ミトラ人物男 性 信 者 殺 害 事 件
●坂 本 弁 護 士 事 件
●国 土 法 違 反 事 件サ リ ン プ ラ ン ト 建 設 事 件薬 剤 師 リ ン チ 殺 人 事 件
●滝 本 サ リ ン 事 件逆 さ 吊 り 死 亡 事 件
●自 動 小 銃 密 造 事 件松 本 サ リ ン 事 件
●男 性 信 者 リ ン チ 殺 人 事 件
●駐 車 場 経 営 者 V X 襲 撃 事 件会 社 員 V X 殺 害 事 件
●被 害 者 の 会 会 長 V X 襲 撃 事 件公 証 人 役 場 事 務 長 致 死 事 件
●島 田 爆 弾 事 件及び火 炎 瓶 事 件地 下 鉄 サ リ ン 事 件
●新 宿 駅 青 酸 ガ ス 事 件東 京 都 庁 小 包 爆 弾 事 件他身柄拘束日判決役職ホーリーネーム
地下鉄サリン事件以降の流れ
強制捜査と教団幹部逮捕 1995年3月20日の地下鉄サリン事件発生から2日後の3月22日、オウムの活動拠点である山梨県西八代郡上九一色村（現・南都留郡富士河口湖町）など25の施設へ公証人役場事務長逮捕監禁致死事件実行犯の逮捕などを目的に強制捜査が開始された。
その後、越川真一（4月6日逮捕）、岐部哲也（4月8日逮捕）、林郁夫（4月8日逮捕）、石川公一（4月8日逮捕）、新実智光（4月12日逮捕）、早川紀代秀（4月20日逮捕）、遠藤誠一（4月26日逮捕）、土谷正実（4月26日逮捕）、青山吉伸（5月4日逮捕）、井上嘉浩（5月15日逮捕）と教団幹部が続々と逮捕され、取り調べにより事件が解明されていった。
麻原教祖を逮捕 5月16日には教団教祖であり事件の首謀者とされた麻原彰晃を逮捕するために第6サティアン一帯の強制捜査が行われた。この際に指揮を執ったのは警視庁の井上幸彦警視総監と寺尾正大捜査一課長であり、現場前線での指揮は山田正治理事官が執った。陸上自衛隊から貸し出しを受けた迷彩仕様の化学防護服に身を包み、完全武装した数百名に及ぶ警視庁捜査員、山梨県警察捜査員、また警察の中に化学防護服の扱いに慣れている者が少なかったため、応援としてかけつけた自衛官が一斉に上九一色村に入り、即座に付近一帯を全面封鎖。付近住民を避難させ、カナリアを入れた鳥かごを持つ捜査員を先頭にサティアン内の捜索を開始。
事前の警察への匿名による密告情報では、「麻原はサティアン内の中二階に引き篭もっている」ということだったので、サティアン内へ捜査員を潜入させ、内部の重点捜索を行った。捜索から数時間後、事前の密告情報による中二階は存在しないことが判明し、捜査撹乱を狙った密告であったと判断した山田に焦りの色が見え始め、一斉捜索打ち切りの時刻が迫っていた。
機動捜査隊回報〔H7.5.18 NO10-5.16Xデ－におけるオウム真理教代表者麻原彰晃の逮捕-〕によると、早朝から始まった捜索から既に4時間が経過、「第六サティアンの中には麻原はいないのではないか」と担当捜索隊員も諦めかけていたとき、別働隊として参加していたA班長指揮の当隊員C捜索班捜索班の一員だった牛島寛昭巡査（警視庁本田警察署所属）の証言では、牛島巡査が以前、信者が以前2階と3階の間の外壁の空気穴をカバーで隠していたことを思い出し、牛島巡査以下数名の機動捜査隊員が自発的に第六サティアン内に入って麻原教祖の捜索に当たることになった。一方機動捜査隊回報には、4分駐所の名前の他に功労者として8名の氏名が記載されているが、この中には牛島氏の氏名は見当たらない。が、「よし、我々の手でもう一度探してみよう」と自発的に第六サティアン内に入って麻原の捜索に当たった。
その結果、隊員の一人が所持していたスチールパイプ柄のハンマーで中二階の側壁を叩き割ったところ、紅紫の法衣を身に纏い、仰向け状態で瞑想している麻原を発見。その際、隊員が「麻原だな！何をしている。出てこい！」と呼びかけると「瞑想している。わかりました」と答えたため、さらに付近のラスボードを破壊し、麻原を引きずり出した。
麻原の発見報告を受けた山田が確認したところ、麻原は髭は伸び放題で着衣も薄汚れ、目は虚ろで極度のアルコール中毒患者か廃人のようであったという。当時の麻原は尿失禁もしていた。捜査員が踏み込んだ際は逃亡する気配すら無く横たわったままほとんど身動きしなかったので重度の身体障害があるのかとも思われたが、現場へ赴いた山田が「麻原か?」と尋ねると「はい…」と弱々しく答えて自認したため、その場から別室へ移動し、この部屋で警察嘱託の医師によって身体の異常の有無を診察された後、「特に異常無し」との医師の所見であったことから、同室で山田から逮捕状の執行を下命された前述の機動捜査隊副隊長Bが東京地方裁判所の裁判官から発布された逮捕状〔甲〕記載の別紙「被疑事実の要旨」を麻原に読み聞かせ又は示して、9時45分、麻原を地下鉄サリン事件の被疑者として殺人及び殺人未遂の罪で通常逮捕した。
捜査第一課管理官ら複数の捜査員による監視移動の中、第6サティアンの別室から施設外に出された麻原はそのまま待機していた警察警備車両に逮捕捜査員と共に乗車させられた。連行途中での麻原の奪還や不測の事態に備えるため麻原を乗せたワゴン車とカムフラージュ用ワゴン車両がそれぞれ周到に準備され、その前後を4、5台のパトカーに先導護衛され又麻原を乗せたワゴン車の両サイドを機動捜査隊の捜査車両が厳重警護しながら、警視庁捜査第一課へ護送連行された当初、護送は警視庁が保有していたV-107大型輸送ヘリコプターで行われる予定だったが、当日悪天候の為ヘリコプターが飛べず、警察車両での護送に変更されたとの噂があるが、これについては、確かに当日、降雨で天候がよくなかったが、確証情報は得られていない。。
警視庁・山梨県警察の動き 当時の上九一色村の第6サティアンは、毒ガステロを引き起こした犯罪組織の本拠地ということで、サリン等の毒ガス使用も懸念された。そのため、強制捜査にあたる捜査員全員に化学防護服の着用が命令され、銃撃戦の恐れもあるとして捜査員全員が拳銃携帯にてサティアン捜索に臨んだ。
日本の警察による犯罪捜査において捜査員全員が拳銃携帯で犯罪者の確保にあたることは実に稀なことで、いつも大半の捜査員は拳銃を持たずに捜査を行っているが、捜査員の生命の安全を考え全員武装での捜査となった。さらに、拳銃を携帯しても予備の弾薬まで携行することは無いのだが、本件では予備の弾薬を携行して行った捜査員もいる。
当時の上九一色村は山梨県内にあるので本来は山梨県警察の管轄事件だが、今回のケースは警視庁管内で発生した事件と同一犯であったことこのように別の都道府県警察が合同で捜査を行う場合は警察庁広域重要指定事件に指定される場合が多いが、これらの事件は指定されていない。ただし指定の明確な定義は無い。に加え、事件の規模があまりにも大きかったため、警視庁主導での合同捜査が展開された。山梨県警察からも大量の捜査員が派遣され、警視庁捜査員と合流し隊列を組んで上九一色村へ向かった。これら大多数の捜査員の後を追って多数のマスコミ取材班も現場へ派遣されている。
機動隊の動き テロ事件ということで警視庁刑事部の他に警備部も動員され、警視庁管轄下の機動隊員（警視庁および山梨県警察を含む関東管区警察局管内の機動隊員ら）が大多数動員され山梨県上九一色村のオウム真理教第6サティアンへ派遣された。
警視庁刑事部捜査一課と山梨県警察から動員された数百名の捜査員に加わり、現場での捜索活動及び後方支援を展開。信者からの銃撃が想定されたため、機動隊員もガスマスクと拳銃を装備し厳重警戒態勢にて現地入りした。
防衛庁・自衛隊の動き 防衛庁（現・防衛省）は、オウム真理教が海外で軍事訓練なども行っている武装集団であり、強制捜査時に於ける組織的な武力抵抗により、警察力での対処が困難な場合の治安出動の可能性を考慮し、陸上自衛隊東部方面隊に対し第三種非常勤務態勢を発令していた。また第一空挺団の普通科群1個中隊が富士駐屯地に訓練名目で移動して待機していたとされる作家麻生幾著書「極秘捜査――警察・自衛隊の「対オウム事件ファイル」（文藝春秋、1997年 / 文春文庫、2000年）」。
オウム裁判 その後も、中川智正（5月17日逮捕）、松本知子（6月26日逮捕）、岡﨑一明（9月6日逮捕、後に宮前に改姓）、上祐史浩（10月7日逮捕）など教団幹部の逮捕は続いた。地下鉄サリン事件以降484人の信者が逮捕され、1998年（平成10年）までに189人が起訴された。
裁判に際して弁護側は麻原について「全て弟子の責任」として無罪を主張し、麻原以外の教団幹部について「麻原にマインドコントロールされていた」として減刑を主張した。また、麻原公判など一部の刑事公判では弁護士解任による公判延期や弁護士側の並行審理拒否や審理のボイコット、検察側が提出した申請証拠の不同意と法廷での直接尋問などの要求、被告人に訴訟能力はないとして控訴趣意書の提出を拒否したことなどは一部からは裁判の遅延行為と非難された。そのため、検察が松本・地下鉄両サリン事件の重軽症者を大幅に減らす訴因変更や被害者がいない事件の起訴を取り下げたりと、異例の裁判となった。
2011年11月21日に最後の上告審判決が言い渡され、同年12月12日にこれに対する判決訂正の申立てが却下されたことから、13人への死刑判決・5人への無期懲役判決が確定し、逃亡犯を除く全ての裁判が一旦終結した。
またオウム裁判の傍聴希望者は、麻原彰晃第1審初公判（1万2292人）、麻原彰晃第1審2回公判（5856人）、麻原彰晃第1審判決公判（4658人）、中川智正第1審初公判（4158人）、青山吉伸第1審初公判（3076人）と多く、世間の関心の高さを物語った。
オウム逃亡犯 重大事件に関与しつつも逃亡したオウム信者もいる。警察庁は重大事件に関与したオウム信者19人をオウム真理教関係特別手配被疑者として全国指名手配にした。1996年（平成8年）1月時点で7人のオウム真理教関係特別手配被疑者がいたが、同年11月14日には八木澤善次が出頭し、同じアジトに潜伏していた北村浩一も逮捕された。同月24日に松下悟史が逮捕され、12月3日には林泰男（後に小池に改姓）が女性信者ととともに逮捕された。また特別手配ではないが教団初期の殺人事件に関与しながらも国外にいた大内利裕が日本に強制送還され、1998年に逮捕された。1998年までに逮捕された一連のオウム事件の逃亡犯については2011年までに裁判で刑が確定した。
1996年12月4日以降から約16年の長期にわたって平田信、高橋克也、菊地直子が逃亡中であったが、2012年1月1日に平田が、6月3日には菊地が、同月15日には最後のオウム逃亡犯であった高橋が逮捕された。なお菊池は起訴されたが2017年12月27日に無罪が確定した。
刑事訴訟法第254条2項により、オウム逃亡犯は共犯者の公判中は公訴時効の進行が停止し、また2010年4月27日をもって刑法と刑事訴訟法の改正（即日公布、施行）によって高橋と菊地の指名手配容疑であった地下鉄サリン事件については殺人罪の公訴時効が廃止となり（殺人未遂罪の公訴時効は15年のまま）、平田の指名手配容疑であった公証人役場事務長逮捕監禁致死事件については逮捕監禁致死罪の公訴時効が20年に延長となり、公訴時効が停止・廃止・延長となっていた。また、2010年（平成22年）以降は捜査特別報奨金制度の対象事件にも指定されていた。
麻原彰晃（松本智津夫）ら13人に対する死刑執行