第71回選抜高等学校野球大会（だい71かいせんばつこうとうがっこうやきゅうたいかい）は、1999年（平成11年）3月25日（木）から4月4日（日）までの12日間にわたって阪神甲子園球場で行われた選抜高等学校野球大会である。
概要 今大会から1回戦の2回表と2回裏に両対戦校の校歌が場内放送で流された。また、大会期間中の第1試合前に近畿圏の小中学生による始球式が行われた。
前年夏の大会で採用された新審判服が春の大会にも登場。春は長袖の水色シャツにグレーのスラックスとなり、気候に応じてブレザー・Vジャン・セーターを着用する（セーターは2000年春〈第72回〉から、Vジャンは2001年春〈第73回〉からそれぞれ登場）。球審は今大会からインサイドプロテクターとなった（一部の球審はアウトサイドプロテクターを使用していた）。
沖縄尚学が沖縄県勢で春夏通じての初優勝を果たした。決勝戦では対戦相手の水戸商応援団を巻き込んでのウェーブが起こった。この関係で沖縄尚学・水戸商両チームにユネスコ・日本フェアプレー賞実行賞が贈られた。
日程 1999年（平成11年） 3月25日 - 開会式は雨のため開始が予定より1時間遅れの午前10時開始。 3月27日 - 第1試合の長崎日大対駒大高は当初1時間半遅れの11時開始の予定だったが、雨が止まないためさらに3時間半遅れの14時開始となった。これに伴い同日第3試合に予定されていた福井商対日大三は翌3月28日の第1試合に順延された。 4月4日 - 決勝戦。閉会式。
出場校
組み合わせ・試合結果 1回戦 - 準決勝
決勝
大会本塁打 1回戦 第1号：今村春樹（市川） 第2号：小林安治（水戸商） 第3号：加藤光弘（海星） 第4号：上田譲二（今治西） 第5号：高橋隼人（今治西） 2回戦 第6号：加藤光弘（海星） 決勝 第7号：浜田政（沖縄尚学）
その他の主な出場選手
備考 3月29日の第1試合から、3月30日の第1試合まで4試合連続延長戦となった。
関連項目 第29回明治神宮野球大会 第81回全国高等学校野球選手権大会
外部リンク 第71回選抜高校野球大会