千円紙幣（せんえんしへい）は、日本銀行券（日本銀行兌換券を含む）の1つ。千円券（せんえんけん）、千円札（せんえんさつ）とも呼ばれる額面1,000円の紙幣。1994年（平成6年）4月以降、発行されている日本銀行券の中で最小額面である。
発行中の千円紙幣は、2004年（平成16年）から発行されている野口英世の肖像のE号券と、2024年（令和6年）から発行されている北里柴三郎の肖像のF号券である。
一覧 これまでに下記の6種類が発行されており、既に失効している甲号券を除く5種類は発行終了したものも含めいずれも日本国の法定通貨として無制限の強制通用力を有する 。仮に決済時において受取人が有効な千円紙幣を受取拒否した場合は民法上の受領遅滞となり、その時点で支払は完了したものとみなされ支払人（債務者）を債務不履行に問うことができなくなるなど、受取人（債権者）に対して不利な効果を生ずることになる。
+日本銀行券／日本銀行兌換券 千円券 様式符号 画像 額面 寸法 主な図柄の説明 年月日 記事 表面 裏面 表面 裏面 透かし 製造開始印刷局から日本銀行への納入開始日を記載。 発行開始 支払停止 失効 日本銀行兌換券 甲 1,000円 172 × 100 mm 日本武尊、建部神社本殿 彩紋 「1000」の数字、鳳凰 1941年（昭和16年）12月26日 1945年（昭和20年）8月17日 不詳 1946年（昭和21年）3月2日 甲千圓券 日本銀行券 B 1,000円 164 × 76 mm 聖徳太子 法隆寺夢殿 「日銀」の文字、桜花 1949年（昭和24年）11月25日 1950年（昭和25年）1月7日 1965年（昭和40年）1月4日 有効 B千円券 C 1,000円 164 × 76 mm 伊藤博文 日本銀行本店本館 肖像 1963年（昭和38年）5月17日 1963年（昭和38年）11月1日 1986年（昭和61年）1月4日 有効 C千円券 D 1,000円 150 × 76 mm 夏目漱石 丹頂 肖像、丸印 1983年（昭和58年）4月8日 1984年（昭和59年）11月1日 2007年（平成19年）4月2日 有効 D千円券 E 1,000円 150 × 76 mm 野口英世 富士山、桜 肖像、縦棒 不詳 2004年（平成16年）11月1日 発行中（緊急時のみ） 有効 E千円券 F 1,000円 150 × 76 mm 北里柴三郎 葛飾北斎筆『富嶽三十六景』「神奈川沖浪裏」 肖像、格子模様、縦棒 不詳 2024年（令和6年）7月3日 発行中 有効 F千円券
甲号券
1942年（昭和17年）4月16日の大蔵省告示第178号「兌換銀行券千圓券發行」1942年（昭和17年）4月16日大蔵省告示第178號「兌換銀行券千圓券發行」で紙幣の様式が定められている。主な仕様は下記の通りである。 日本銀行兌換券 額面 千圓（1,000円） 表面 日本武尊と建部神社本殿、兌換文言 裏面 彩紋、断切文字 透かし 「1000」の数字、鳳凰 印章 〈表面〉総裁之印 〈裏面〉文書局長、発行局長 銘板 内閣印刷局製造 記番号仕様 記番号色 黒色 記番号構成 〈記号〉組番号：「｛」＋数字1桁＋「｝」 〈番号〉通し番号：数字6桁 寸法 縦100mm、横172mm 製造実績 印刷局から日本銀行への納入期間 1941年（昭和16年）12月26日 - 1943年（昭和18年）9月28日 記号（組番号）範囲 1 - 9（1記号当たり900,000枚製造） 製造枚数 8,100,000枚 発行開始日 1945年（昭和20年）8月17日（告示上：1942年（昭和17年）4月20日1942年（昭和17年）4月16日付け大蔵省告示第178号「昭和十六年法律第十四號第三條ノ規定ニ依リ兌換銀行券條例第三條ニ規定スルモノノ外日本銀行ノ發行スル兌換銀行券ノ種類ニ千圓券ヲ追加シ本年四月二十日ヨリ之ヲ發行ス」では同年4月20日と予告されていた。） 通用停止日 1946年（昭和21年）3月2日1946年（昭和21年）2月17日勅令第84號「日本銀行券預入令」、ならびに1946年（昭和21年）2月17日大蔵省令第13號「日本銀行券預入令施行規則」（証紙貼付券に限り1946年（昭和21年）10月31日1946年（昭和21年）9月12日大蔵省告示第687號「日本銀行券預入令の特例の件第一條第一項に規定する日」） 失効券
第二次世界大戦後のインフレーション抑制を目的とした金融緊急措置令などに基づく新円切替が行われる以前（旧円）の最高額紙幣である。
戦時インフレ発生の懸念から更なる高額券の準備が必要となったため1941年（昭和16年）に製造を開始した。1942年（昭和17年）の大蔵省告示で様式と発行開始日が公示されたが、これは1942年（昭和17年）2月の日本銀行法施行に伴い、1942年（昭和17年）5月1日以降はそれ以前から発行されている券種を除き「兌換銀行券」の名称を用いた新たな銀行券を発行できなくなるため、既に製造されていた甲千圓券が発行できない状況に陥らないようにすることを目的とした形式的なものである。そのような事情で発行されたため、発行後数年間は日本銀行に死蔵されることになる。
そして終戦直後の1945年（昭和20年）8月17日に他の新紙幣の発行とともに流通が開始されたが、新円切替に伴い発行から1年も経たず、1946年（昭和21年）3月2日限りで失効した。製造数は8,100,000枚（うち発行数は不明）。失効後も証紙を貼り付けて臨時に新様式券（新円）の代わりとする「証紙貼付銀行券」が発行され流通・通用したが、この「証紙貼付銀行券」も新円の流通拡大に伴い1946年（昭和21年）10月末に失効した。
表面右側には福井県吉田郡永平寺町にある二本松山古墳から出土した古墳時代の「金銅製冠」および「短甲」を身に着けた日本武尊の肖像が描かれている。なお日本武尊の肖像は、文献資料や絵画・彫刻を参考にしつつ帝室博物館学芸員の関保之助の考証を基に、高松宮宣仁親王をモデルとしてデザインしたものとされる。表面左側には滋賀県大津市にある建部神社（現・建部大社）の本殿本殿は現存するものの、手前に拝殿が増築され拝殿と本殿を結ぶ回廊が建てられたため、現在では同じ風景を眺めることはできない状態となっている。が描かれている。輪郭には唐草模様の他に、勾玉、宝相華、桐紋が散りばめられており、地模様として八稜鏡型の輪郭と、その外側に瑞雲、宝相華、菊花があしらわれている。「日本銀行兌換券」と表記されているものの、実質的な発行開始時点で既に1942年（昭和17年）5月の日本銀行法施行により金本位制が廃止されていたため、実質的にも法的にも不換紙幣として扱われており金貨との兌換は行われていなかった。
裏面には彩紋と共に、宝相華、桐、唐草模様などが印刷されている。裏面右端には「日本銀行」の断切文字（割印のように券面内外に跨るように印字された文字）が配置されている。
透かしは「1000」の数字と鳳凰の図柄である。透かし模様が確認しやすいよう、透かしの入った中央部分は文字と淡い印刷色の地模様のみの印刷となっている。
使用色数は、表面7色（内訳は凹版印刷による主模様1色、地模様4色、印章1色、記番号1色）、裏面4色（内訳は凹版印刷による主模様1色、地模様2色、印章・断切文字1色）となっている。
なお額面金額1000円のA号券（A千円券）は検討が行われ、後述の通り2種類の図案が考案されたものの結局発行されなかった。
このように甲千圓券は短命な超高額券であった。発行枚数が少なく、かつ高額券ゆえほとんど回収されたため、現存数は多くない。2014年（平成26年）現在の価格に換算すると約180万円ほどの額に相当する。またこの紙幣の現代の古銭的価値も数万円以上の値がつくことがある。
製造された甲千圓券の一部は台湾銀行に引き渡され、裏面に銀行名や印章の加刷を行ったうえで1945年（昭和20年）8月の終戦直後に台湾でも発行された。このほか朝鮮銀行に対しても同様に終戦直後に甲千圓券の一部が引き渡され、台湾同様に現地で発行するため表面に題号の加刷が行われたものの、こちらは発行準備のみで実際の発行には至らなかった。
B号券
246px|right|thumb|表面 246px|right|thumb|裏面 B券とも呼ばれる。1949年（昭和24年）12月28日の大蔵省告示第1048号「昭和二十五年一月七日から発行する日本銀行券千円の様式を定める件」1949年（昭和24年）12月28日大蔵省告示第1048号「昭和二十五年一月七日から発行する日本銀行券千円の様式を定める件」で紙幣の様式が定められている。主な仕様は下記の通り。 日本銀行券 額面 千円（1,000円） 表面 聖徳太子 裏面 法隆寺夢殿 透かし 「日銀」の文字、桜花 印章 〈表面〉総裁之印 〈裏面〉発券局長 銘板 日本政府印刷庁製造 記番号仕様 記番号色 黒色 記番号構成 記号：英字1 - 2文字＋通し番号：数字6桁＋記号：英字1文字 寸法 縦76mm、横164mm 製造実績 印刷局から日本銀行への納入期間：1949年（昭和24年）11月25日 - 1963年（昭和38年）8月9日
製造枚数 2,825,000,000枚 発行開始日 1950年（昭和25年）1月7日 支払停止日 1965年（昭和40年）1月4日 有効券 1946年（昭和21年）2月に終戦直後のインフレーション抑制を目的とした新円切替が実施され、切替用の新紙幣としてA号券が新たに発行されたが千円券（A千円券）の発行は計画されていたものの結果的に見送られた。しかし新円切替をもってしてもインフレーションの進行は抑えきれず、当時の最高額面券であったA百円券の発行量が著しく増大して1949年（昭和24年）頃には発行枚数の95％以上を占めるほどになったため、金融機関の処理や高額の現金決済に支障を来たすようになり更に高額面の紙幣が必要とされるようになった。当時の切迫した状況から極めて短期間のうちに検討から製造まで行わざるを得ず、不十分な出来栄えで粗末な作りとなっていたA号券の偽造が横行したこともあり、B千円券は他のB号券に先駆けて1950年（昭和25年）に発行された。
表面右側には乙百圓券の検討時に作成された原画を基にして新たに彫刻された聖徳太子の肖像が描かれ、肖像の下には甲百圓券を最後に途絶えていた肖像の人名表記が復活している。肖像を囲む円形の枠には法隆寺の古瓦模様、中央上下には宝相華の唐草模様、地模様には法隆寺が所蔵する玉虫厨子の「透金具の天平模様」があしらわれている。裏面左側には肖像の聖徳太子に因んで奈良県生駒郡斑鳩町にある法隆寺夢殿を、右端には正倉院御物の「四騎獅子狩文錦」の織物の図柄の一部分を描いている。かつての乙百圓券やい百圓券ほどではないものの、肖像の聖徳太子にゆかりのある法隆寺や正倉院に関連する図柄が多く採用されている。なおこのデザインは、当初五百円券として準備が進められていたものを転用したものである。裏面の「NIPPON GINKO」の文字の上下などに施されている細かい模様には、「千」のマイクロ文字が組み込まれているD号券（一部）・E号券・F号券のそれほど細かくはないが、当時の印刷機では潰れてしまう。。
記番号はアルファベット1桁または2桁＋数字6桁＋アルファベット1桁の形式、すなわち「A123456B」や「AB123456C」のような形式が採用された初の日本の紙幣であり、それがそのままC号券・D号券・E号券・F号券でも用いられている。
透かしは「日銀」の文字と桜花の図柄であるが、他のB号券同様印刷と重なっていることもあり確認しにくい。当初の紙幣用紙は第二次世界大戦以前と同じく三椏のみを原料としたものであったが、のちに三椏の需給が逼迫したことからマニラ麻や木綿、尿素樹脂が混合されるようになった。この影響により発行途中で紙質が変化しており前期はクリーム色紙、後期は白色紙である。なお製造効率向上のためにA号券までに発行されていた日本銀行券の高額券とは異なって券面の寸法が横長となっており、以降もこれに近いスタイルが受け継がれている。
使用色数は、表面5色（内訳は凹版印刷による主模様1色、地模様2色、印章1色、記番号1色）、裏面3色（内訳は凹版印刷による主模様1色、地模様1色、印章1色）となっている。第二次世界大戦後初の表裏両面が凹版印刷された本格的な銀行券である。
なおい号券からA号券までは、戦時中・終戦直後ということもあり、印刷局のみならず一部を民間の印刷会社に委託して製造していたが、様々な問題特にA号券では多数の民間委託先で分散して製造を行った結果、一部で管理が行き届かず製造管理や品質管理、秘密保持が不十分となり、そのことが偽造券が多発する原因の一つとなっていた。があったこともありB号券以降は再び全量が印刷局で製造されている。
日本銀行の窓口で鑑定の上無償で現行の紙幣に引き換えできる他、市中の金融機関の窓口に持ち込むと口座への預け入れや現行の紙幣への交換ができるが、場合によっては日本銀行での鑑定に回され日数を要する場合がある他、取り扱い手数料が要求される金融機関が多くなっている。市中での行使に関しては、自動販売機や鉄道駅の券売機、ATM、自動釣銭機等の各種機器で受け付けられない他、手動レジを用いた対面取引で行使しようとする場合であっても、店員が知らなかったり、見慣れぬ紙幣で真贋が判断できないなどという場合もあるが、店舗側が受け取った後の金融機関による両替の際に前述のような手数料の支払いを避けるためという理由が大きく、2026年（令和8年）現在では、日本国内の大部分の一般商店が受け取りを拒否する方針としており、市中で実際に行使するには厳しい状態となっている。
C号券
246px|right|thumb|表面 246px|right|thumb|裏面 C券とも呼ばれる。1963年（昭和38年）3月5日の大蔵省告示第55号「昭和三十八年中に発行を開始する日本銀行券千円の様式を定める件」1963年（昭和38年）3月5日大蔵省告示第55号「昭和三十八年中に発行を開始する日本銀行券千円の様式を定める件」で紙幣の様式が定められている。主な仕様は下記の通り。 日本銀行券 額面 千円（1,000円） 表面 伊藤博文 裏面 日本銀行本店本館 透かし 伊藤博文の肖像 印章 〈表面〉総裁之印 〈裏面〉発券局長 銘板 大蔵省印刷局製造 記番号仕様 記番号色 黒色／青色（製造時期により2種類あり） 記番号構成 記号：英字1 - 2文字＋通し番号：数字6桁＋記号：英字1文字 寸法 縦76mm、横164mm 製造実績 印刷局から日本銀行への納入期間 1963年（昭和38年）5月17日 - 1984年（昭和59年）1月27日
製造枚数 12,960,000,000枚［記番号：黒色］ 12,478,000,000枚［記番号：青色］ 発行開始日 1963年（昭和38年）11月1日1963年（昭和38年）10月19日日本銀行公告「新様式千円券発行期日公告」 支払停止日 1986年（昭和61年）1月4日 有効券 B千円券は戦前からの印刷技術や紙幣製造設備の延長線上で作られたものであったため、印刷技術の向上によりチ-37号事件などでB千円券の偽造が多発し精巧な偽造券が見られるようになったことから、当時ようやく近代化が進められつつあった紙幣製造設備の能力をフル活用して新たな印刷技術や偽造防止技術を盛り込んだ紙幣として発行された。
デザイン決定については東京大学心理学教室の調査結果などを参考に決定された。デザイン決定の経緯については、A案の聖徳太子続投、B案の渋沢栄一、そしてC案の伊藤博文があったが、A案は聖徳太子の続投はC一万円券およびC五千円券でも肖像として採用されており、おかしいとの理由で不採用となったちなみに、C号券の一万円券は発行開始日が1958年（昭和33年）12月1日、五千円券は発行開始日が1957年（昭和32年）10月1日で、千円券は発行開始日が1963年（昭和38年）11月1日であるため、C号券の千円券が発行されるまでの（B号券が発行・流通していた）間は、千円券、五千円券、一万円券はすべて、聖徳太子の肖像の紙幣であった。。B案の渋沢栄一は最終選考に残ったものの、当時は偽造防止に主に肖像にヒゲがある人物が用いられていたため不採用となり後にF一万円券の肖像として採用される。、最終的にC案の伊藤博文が採用された。採用を見送られたB案のデザインはお札と切手の博物館の展示物で確認することが可能である。B案のデザインの試作品は七十七銀行本店ビルにある金融資料館にも展示されている一万円札肖像画採用の渋沢栄一縁の地、仙台・ 七十七銀行金融資料館に「幻の千円札」、産経新聞、2019年4月12日。七十七銀行と渋沢栄一の縁（ゆかり）、七十七銀行 - 2024年7月14日閲覧。。この他にも当初の肖像人物の候補の中には過去の天皇や文化人なども見られるが、天皇が中間券種に登場するのは疑問があること、文化人は一部の年代には人気があるもののこの時点では銀行券としての重々しさに欠けるとされたことからいずれも対象外とされた。
表面右側には初代内閣総理大臣である伊藤博文の写真を基にした大型の肖像、下部には菊花を描き、地模様として中央には宝相華模様と法隆寺所蔵の「橘夫人念持仏厨子」の光背、左上や右側に桜花があしらわれている。裏面中央には日本銀行本店本館が描かれており、同じ題材を用いたC五千円券とほぼ同じ構図ではあるものの、前庭の樹木や建物の窓の様子、屋上の通信用アンテナなどに細かな差異が見られる。従来の日本銀行券に存在した額縁状の重厚な輪郭枠を完全に取り去った、今までにない非常に開放的なデザインとなっている。
記番号はアルファベット1桁または2桁＋数字6桁＋アルファベット1桁の形式である。初期の記番号の色は黒色だったが、この形式の記番号としては史上初めて129億6千万枚を発行して記番号が一巡したため、1976年（昭和51年）7月1日発行分1976年（昭和51年）6月18日日本銀行公告「新様式千円券発行期日公告」独立行政法人 国立印刷局 - 現在でも使えるお札から記番号の色が青色1976年（昭和51年）3月18日大蔵省告示第22号「昭和五十一年中に発行を開始する日本銀行券千円の様式を定める件」に変更された。
C千円券の変遷の詳細を整理すると下表の通りとなる。
発行開始日日本銀行への納入期間記番号色変更理由1963年（昭和38年）11月1日1963年（昭和38年）5月17日 - 1976年（昭和51年）4月2日黒色1976年（昭和51年）7月1日1976年（昭和51年）4月2日 - 1984年（昭和59年）1月27日青色記番号の組み合わせ枯渇
透かしも伊藤博文の肖像であるが、表面右側に印刷された肖像とは違い横顔になっている。B号券以前の透かしよりも精緻で明瞭となったほか、B号券とは異なりその部分には印刷がされていないためこれを容易に確認できる。 伊藤博文の横顔を映した写真が存在しないため、国会議事堂中央広間内にある伊藤博文の銅像を側面から見たものをモデルとしている。紙幣用紙については強度を向上するため、強靭なマニラ麻を主体に木材パルプ、藁などを混合しており、三椏は2割程度の配合となっていることから従来の紙幣用紙とは色調や感触が異なっている。
B号券では製造効率の向上のためにB五十円券を除き縦方向の寸法を同じにして、横方向の寸法のみを額面金額が上がるにつれて8mm間隔で長くしていたが、C号券では券種識別性向上のために額面金額が上がるにつれて縦方向に4mm、横方向に5mmずつ長くする形式に変更された。
使用色数は、表面10色（内訳は凹版印刷による主模様2色、地模様6色、印章1色、記番号1色）、裏面5色（内訳は凹版印刷による主模様1色、地模様3色、印章1色）となっている。従来の紙幣と比べて明るい色調やグラデーション模様などをふんだんに用いた券面となっている。
黒色記番号の紙幣には、沖縄の本土復帰に伴う通貨交換（第五次通貨交換）用の特殊記号券が存在し、記番号の英字の組み合わせのうちごく一部の特定のものがこれに当たるが、その現存数は非常に少ない。
日本銀行の窓口で鑑定の上無償で現行の紙幣に引き換えできる他、市中の金融機関の窓口に持ち込むと口座への預け入れや現行の紙幣への交換ができるが、場合によっては日本銀行での鑑定に回され日数を要する場合がある他、取り扱い手数料が要求される金融機関が多くなっている。市中での行使に関しては、自動販売機や鉄道駅の券売機、ATM、自動釣銭機等の各種機器で受け付けられない他、手動レジを用いた対面取引で行使しようとする場合であっても、店員が知らなかったり、見慣れぬ紙幣で真贋が判断できないなどという場合もあるが、店舗側が受け取った後の金融機関による両替の際に前述のような手数料の支払いを避けるためという理由が大きく、2026年（令和8年）現在では、日本国内の大部分の一般商店が受け取りを拒否する方針としており、市中で実際に行使するには厳しい状態となっている。
D号券 225px|right|thumb|表面 225px|right|thumb|裏面 D券とも呼ばれる。1984年（昭和59年）6月25日の大蔵省告示第76号「昭和五十九年十一月一日から発行する日本銀行券壱万円、五千円及び千円の様式を定める件」1984年（昭和59年）6月25日大蔵省告示第76号「昭和五十九年十一月一日から発行する日本銀行券壱万円、五千円及び千円の様式を定める件」で紙幣の様式が定められている。主な仕様は下記の通り。 日本銀行券 額面 千円（1,000円） 表面 夏目漱石 裏面 丹頂 透かし 夏目漱石の肖像、丸印が1つ（視覚障害者用識別マーク） 印章 〈表面〉総裁之印（ミニ改刷後は特殊発光インキ） 〈裏面〉発券局長（ミニ改刷後は特殊発光インキ） 銘板 大蔵省印刷局製造／財務省印刷局製造／国立印刷局製造（製造時期により3種類あり） 記番号仕様 記番号色 黒色／青色／褐色／暗緑色（製造時期により4種類あり） 記番号構成 記号：英字1 - 2文字＋通し番号：数字6桁＋記号：英字1文字 視覚障害者用識別マーク 丸印が1つ（透かし・左下隅） 寸法 縦76mm、横150mm 製造実績 印刷局から日本銀行への納入期間 1983年（昭和58年）8月18日 - 2003年（平成15年）
製造枚数 12,960,000,000枚［記番号：黒色］ 5,832,900,000枚［記番号：青色］ 12,960,000,000枚［記番号：褐色］ 1,341,900,000枚［記番号：暗緑色・大蔵省銘］ 4,980,000,000枚［記番号：暗緑色・財務省銘］ 245,200,000枚［記番号：暗緑色・国立銘］ 発行開始日 1984年（昭和59年）11月1日 支払停止日 2007年（平成19年）4月2日 有効券 C千円券の発行開始から約20年が経過しC号券で使用された紙幣製造技術や偽造防止技術が陳腐化してきたことや、飛躍的な印刷技術の向上を背景に1980年代初め頃から精巧な偽造券が散見されるようになったことから、偽造防止対策強化のためにD号券が発行された。D一万円券、D五千円券、D千円券の3券種同時の改刷であるが、日本銀行券で3券種が同日に改刷されるのは第二次世界大戦以降では初めてである。またこの頃にはATMや両替機、自動販売機（自動券売機）といった紙幣取扱機器も広く普及し始めていたことからこれも念頭に置いたうえで改刷が行われた。
D号券では各額面の人物肖像に文化人が採用された。世界的な傾向として国家元首や政治家だけでなく、文化人も紙幣肖像に採用されるようになったことがD号券で文化人が採用された理由である。千円券の肖像には小説家の夏目漱石が選ばれ、表面右側に肖像が描かれている。原画の写真は明治天皇の崩御から間もないころに撮られたものであり、漱石自身が明治天皇の熱烈な崇拝者でもあったことから服喪中の黒ネクタイを着用した肖像となっている。
裏面には中央の空白を挟んで両側に特別天然記念物である釧路湿原の丹頂のつがいを描いており、左側が雄、右側が雌である。また券面中央の透かし部分の楕円形の空白は丹頂の卵の形状をイメージしたものである。この楕円形の空白の輪郭は、表裏両面で位置が一致するよう印刷されている。なお日本銀行券では日本銀行行章は裏面にのみに印刷されているものが多い中、このD千円券は表面の額面金額の文字に重なっている所にも日本銀行行章が入っている数少ない例の一つである。
初期の記番号は黒色で印刷されていたが、129億6千万枚を発行して記番号が一巡したため、1990年（平成2年）11月1日発行分から記番号の色が青色に変更された1990年（平成2年）6月20日大蔵省告示第107号「平成二年十一月一日から発行する日本銀行券千円の様式を定める件」。1993年（平成5年）12月1日発行分からは記番号の色を褐色に変更する1993年（平成5年）6月24日大蔵省告示第134号「平成五年十二月一日から発行する日本銀行券壱万円、五千円及び千円の様式を定める件」とともに、「ミニ改刷」と呼ばれる一部改造券を発行した。従来のデザインはそのままに、追加でマイクロ文字（「NIPPON GINKO」、凹版印刷部分に表裏の要所で採用）、特殊発光インキ（紫外線照射により発光するインキであり、表面印章「総裁之印」のオレンジ色発光と、裏面印章「発券局長」の赤色発光が確認できる。）等の偽造防止技術が施されている。なおミニ改刷前の青色記番号は記番号の組み合わせを全部使い切っていなかった。この褐色記番号も129億6千万枚を発行して記番号が一巡したため、2000年（平成12年）4月3日発行分から記番号の色が暗緑色に変更された2000年（平成12年）2月2日大蔵省告示第26号「平成十二年四月三日から発行する日本銀行券千円の様式を定める件」。
中央省庁再編及び独立行政法人化に伴う製造者の名称変更に伴い、暗緑色記番号の紙幣の製造者名の銘板表記については、当初の「大蔵省印刷局」、2001年（平成13年）5月14日発行分からの「財務省印刷局」2001年（平成13年）3月30日財務省告示第85号「平成十三年五月十四日から発行する日本銀行券壱万円、五千円及び千円の様式を定める件」、2003年（平成15年）7月1日発行分からの「国立印刷局」2003年（平成15年）6月13日財務省告示第482号「平成十五年七月一日から発行を開始する日本銀行券壱万円、五千円及び千円の様式を定める件」。以上の3種類が存在する。
D千円券の変遷の詳細を整理すると下表の通りとなる。下記の6タイプに分かれる。
発行開始日記番号色マイクロ文字印章銘板（製造者名）変更理由1984年（昭和59年）11月1日黒色なし特殊発光なし大蔵省印刷局製造1990年（平成2年）11月1日青色記番号の組み合わせ枯渇1993年（平成5年）12月1日褐色あり特殊発光あり偽造防止力向上のための様式変更（ミニ改刷）2000年（平成12年）4月3日暗緑色記番号の組み合わせ枯渇2001年（平成13年）5月14日財務省印刷局製造製造者の組織変更2003年（平成15年）7月1日国立印刷局製造製造者の組織変更
透かしは肖像と同じ夏目漱石であり、従来よりも大型で白黒の階調のはっきりしたすき入れとなっている。視覚障害者が触覚で容易に券種を識別できるよう、表面から見て左下隅に識別マークとして点字の「あ」を模した「丸印が1つ」透かしにより施されている。透かしによる視覚障害者用識別マークは世界初である。
B千円券とC千円券は同じ寸法であったが、D千円券ではサイズの縮小が行われそれらより横幅が14mm短くなった（縦方向は変更なし）。これは世界的な紙幣の小型化の流れに合わせたものであるほか、製造能力の向上や省資源化、機械等での取扱上の利便性などを考慮したものである。同時に改刷されたD号券3券種で比較すると縦方向の寸法は同じで、横方向の寸法のみを額面金額が上がるにつれて5mmずつ長くする形式となっている。E千円券以降もこのD千円券のサイズを踏襲している。