秋田県の二級水系一覧では、秋田県を流れる水系のうち、秋田県が管理する二級水系を記述する。2008年現在、21水系、51河川ある十和田湖を含む。
リストの順序は、北から南に、河口の位置を基準にして並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
水系名河川延長(km)流域面積(km2)河川数河口所在地備考 真瀬川 6.000 1八峰町 水沢川 13.320 1八峰町 塙川 15.390 1八峰町 竹生川 12.800 1八峰町、能代市 （米代川） 110.181 84能代市一級水系 鮪川川 2.480 1男鹿市 滝川 7.400 1男鹿市 賀茂川 4.502 3男鹿市 比詰川 3.400 1男鹿市 馬場目川 47.518 23 （雄物川） 129.8 173秋田市一級水系 下浜鮎川 7.500 1秋田市 勝手川 3.900 1由利本荘市 君ヶ野川 7.400 1由利本荘市 二古川 3.800 1由利本荘市 衣川 13.000 1由利本荘市 （子吉川） 60.800 45由利本荘市一級水系 西目川 8.182 1由利本荘市 大沢川 7.500 1にかほ市 白雪川 20.182 1にかほ市 赤石川 8.450 1にかほ市 象潟川 3.600 1にかほ市 奈曽川 12.218 2にかほ市 十和田湖 10.255 1
出典・参考文献 河川表（秋田県河川砂防課）
脚注
関連項目 河川 二級水系 日本の川一覧