水口 憲哉（みずぐち けんや、1941年(昭和16年) - ）は、日本の水産学者。
満洲国大連で生まれ、東京・新宿で育つ。東京水産大学（現東京海洋大学）で30数年、日本全国の漁業における環境問題、特に原子力発電所と漁場との関係について研究してきた。1970年より、原子力発電所・火力発電所・ダム・ゴルフ場などの建設の影響を受ける各地の漁村をまわって、漁民らの研究会に数多く参加した。現在東京海洋大学名誉教授、農学博士。人と魚と水の関係学専攻。
1970年 東京大学農学博士。論文は「オイカワ(Zacco platypus(T&S))の繁殖生態と分布域の拡大にともなう二三の形質の変異」「オイカワ(Zacco platypus(T&S))の繁殖生態と分布域の拡大にともなう二三の形質の変異」 東京大学 博士論文, 甲第2306号, 1970年, 。
夷隅東部漁協の組合員。千葉県いすみ市岬町の自宅に資源維持研究所を開設し、相談活動をおこなっている 水口憲哉『これからどうなる海と大地 海の放射能に立ち向かう』七つ森書館、2011年07月、著者プロフィール、ISBN 978-4-8228-1135-8。
2012年、東京電力福島原子力発電所事故調査委員会（国会事故調）参考人を務めた。
主要論文
安田富士郎, 水口憲哉, 「マダイ類2属, ChrysophrysとPagrusに属する6種の骨格の研究」『魚類学雑誌』 16巻 1号 1969年 p.31-34, 水口憲哉, 檜山義夫, 「オイカワ, Zacco platypus (Temminck and Schlegel) の繁殖―I.臀鰭における性徴と成熟」『魚類学雑誌』 16巻 1号 1969年 p.17-23, 安田富士郎, 水口憲哉, 「インド・太平洋産マダイ属3種の種の特微について」『魚類学雑誌』 16巻 1号 1969年 p.24-30, 水口憲哉, 「房総沿岸におけるイセエビの移動に関する試論」『日本ベントス研究会連絡誌』 1978巻 15-16号 1978年 p.67-72,
岡崎登志夫, 渡辺昌和, 水口憲哉, 細谷和海, 「遺伝的に識別されるカワムツ (Zacco temmincki) の2型について」『魚類学雑誌』38巻 2号 1991-1992年 p.133-140,
水口憲哉, 「有毒化学物質の真の危機とは何か-「環境ホルモン騒ぎ」をこえて」『有機合成化学協会誌』 57巻 1号 1999年 p.47-52,
主要著作 『放射能がクラゲとやってくる』七つ森書館 『釣と魚の科学』産報出版 『反生態学』どうぶつ社 『海と魚と原子力発電所』農文協 『魚をまるごと食べたい』七つ森書館 『魔魚狩り』フライの雑誌社 『桜鱒の棲む川』フライの雑誌社 『淡水魚の放射能 川と湖の魚たちにいま何が起きているのか』フライの雑誌社、2012年9月 水口憲哉・明石昇二郎編著『別冊宝島1807号〈食品の放射能汚染完全対策マニュアル〜〇ベクレルの食卓を目指すためのバイブル〉』宝島社
脚注