本項、魚類用語（ぎょるいようご）では、魚類の身体の名称、特徴や生態などを示す用語について記す。ただし、狭義の魚類に含まれない無顎類（円口類）を含む。
身体の構造
魚類の体部は頭部、軀幹部、尾部に分けられる。
頭部
頭部（とうぶ、） 吻端から鰓蓋末端までの部分。 吻（ふん、） 眼の前縁より前の部分。吻の形は食性によって異なる。ヒイラギ、マトウダイなどは膜を折りたたんだような吻を一気に伸ばして獲物を捕らえる。ヤガラ類などは吻部が筒状に伸び、カジキ、サヨリなどは吻部が槍のように延長する。吻の先端は吻端（ふんたん）と呼ばれる。 （がんかくいき） 眼と眼の間。 （こうれつ） 口の開口部。 （がくぶ、） 眼の背後方に当る頭部。 （きょうぶ、） 眼より下方の部位。眼と前鰓蓋骨隆起線との間。 後頭部（こうとうぶ、） または 後頭（こうとう） 眼より後方の頭部背面。項部の直前の部分。後頭部は魚種により突出したり、窪んだり、棘や皮弁を備えたりする。 （こうぶ、） 後頭部直後の部分。軀幹部近くの頭部背面。後頭部などとの境界は厳密には定められていない。 （ほうごうぶ、） または 下顎縫合部（かがくほうごうぶ） 両側の下顎が合着する部位。 頤（おとがい、） または （おとがいぶ、、 ） 縫合部の後方部。下顎縫合部の直後。 （きょうぶ、） 左右の鰓膜が接近する付近の頭部下面。頤の後方。 （こうぶ、） 峡部の直後、胸部との間。胸鰭基底の下部より前の部分。
軀幹部 軀幹部（躯幹部、くかんぶ、） または 胴（どう）、胴部（どうぶ） 鰓蓋（または鰓孔）末端から肛門（または総排泄孔）までの部分。大きく胸部と腹部に分けられるが、これらの境目に明確な区別はない。 （けんぶ、） 軀幹部の前側部、胸鰭を支える骨（肩帯）があるところ。 胸部（きょうぶ） 軀幹部の下面前方。鰓蓋末端から腹部前端までの軀幹部。喉部の後方。 腹部（ふくぶ、） 軀幹部の下面後方。胸部後端から肛門までの軀幹部。 （えき、） または 腋部（えきぶ） 対鰭（普通胸鰭）内部の基底付近の体部。腹鰭の腋部として使用されることもある。
尾部
尾部（びぶ、） 肛門より後方の体部。肛門から尾鰭基底まで。 （びへい、） または 尾柄部（びへいぶ） 尾部のうち臀鰭基底末端（臀鰭の最後の軟条基底）から尾鰭起部までの部分。
鰭
200 px|thumb|left|一般的な魚類（カクレクマノミ）の鰭。 鰭（ひれ、、） 魚の体壁から突出する扁平な構造。推進力を産み出し、体の安定を担う運動器官。鰭条、鰭膜からなる。また、対鰭と不対鰭に大別される。
（きじょう、） または 条（じょう） 鰭の支持物として担鰭骨から鰭の外縁に向かって放射状もしくは平行に走る細線状の構造。鰭膜とともに鰭を形成する。ホウボウの胸の付け根にある「足」は味覚を感じる器官だが、これは鰭条の一部が変化したものである。 （かくしつきじょう、） 軟骨魚類の鰭条。角質からなり、分節せず細長い。 （りんじょうきじょう、） 硬骨魚類の鰭条。骨質からなり、細かく分節する。軟条と棘条に分かれる。 （きょくじょう、） または 棘（きょく、）、鰭棘（ききょく） 固く、分節していない鱗状鰭条。軟条より骨化が進んでいる。左右の接合分節が認められない。全ての鰭に棘条がない硬骨魚類もいる（原棘鰭上目など）。背鰭のものを背鰭棘（せびれきょく）、臀鰭のものをものを臀鰭棘（しりびれきょく）という。アンコウやカエルアンコウのように擬餌状体と誘引突起のように変化したものや、ゴンズイやオコゼ、アイゴなどのように毒腺を持つものもある。 （ゆうりきょく） 一つの鰭の中で他の鰭条から離れている棘。 （きょくじょうなんじょう、） 普通棘条は分節しないが、コイ目の背鰭、臀鰭前部には分節的な棘条がある。
（なんじょう、） 柔軟で分節している鱗状鰭条。分節のある左右1対の鰭条が癒合した状態。多くの場合先端は癒合せずに分節している。 （ぶんしなんじょう、） 起部が1本で先端に向かって分枝する軟条。分枝条（ぶんしじょう）、分岐軟条（ぶんきなんじょう）とも呼ばれる。 （ふぶんしなんじょう、） 起部から先端まで1本の軟条。不分枝条（ふぶんしじょう）、不分岐軟条（ふぶんきなんじょう）とも呼ばれる。 （ゆうりなんじょう、） 一つの鰭の中で他の鰭条から離れている軟条。多くはほかのものより太く、感覚能がある。 （きまく、） 鰭条を連結し、鰭を形成する膜。 鰭条間膜（きじょうかんまく）、条間膜（じょうかんまく）とも呼ばれる。 （きてい、） 鰭の前端基部から後端基部までの部分。 （きぶ、） または 始部（しぶ） 鰭の最前端起部。 対鰭（ついき、ついびれ、） または 有対鰭（ゆうついき） 魚類の両体側にあって対となっている鰭。胸鰭と腹鰭を言う。水平翼として揚力を生じさせると同時に体のローリングを防ぐ。遊泳にブレーキをかけ、進行方向に対して左右、上下に方向転換する際のバランスを取る。
（とうき、あたまびれ、）
（むなびれ、きょうき、） 胸に対にある鰭。四肢動物の前肢に当る。トビウオでは飛行に使用される。ホウボウ科では胸鰭が著しく長く、下部の軟条3対は肥厚して遊離し、指状の動きをして餌生物を探す。ウツボ（ウナギ目）やタウナギ（タウナギ目）にはない。 （こつしつばん、） ドジョウ科特有のもので、雄の胸鰭基部に発達する。ドジョウ科の種の判別は骨質盤の形で判別する。 （はらびれ、ふっき、） 腹に対にある鰭。四肢動物の後肢に当る。サメの腹鰭は交尾器（鰭脚）、ハゼの腹鰭は吸盤に変化する。またウツボやウナギ（ともにウナギ目）、タウナギ（タウナギ目）にはない。 （はらびれぜんよう、ふっきぜんよう） ガンギエイなどが持つ。腹鰭の前部。 （ふついき、） または 正中鰭（せいちゅうき、）、垂直鰭（すいちょくき、すいちょくびれ）、主鰭（しゅき）、無対鰭（むついき） 体の正中線上にある鰭。背鰭、臀鰭、尾鰭、小離鰭の総称。体の横揺れを防ぎ、泳ぎの推進力を生み出し、方向転換を補助する。
背鰭（せびれ、はいき、、） 背中線上に沿って1–3基ある鰭。遊泳の際、体の安定性を保つ。また瞬間的な方向転換に役立つ。1基が普通であり、マサバ、カツオ、ブリ、マアジ、カワハギなどは2基、ヘビギンポ、マダラ、スケトウダラなどは3基、ポリプテルスなどは数基ある。 （第一背鰭、だいいちせびれ、） または 棘条背鰭（きょくじょうせびれ） 背鰭の第1基。ほとんどの魚類が持つ。 （第二背鰭、だいにせびれ、） または 軟条背鰭（なんじょうせびれ） マサバ、カツオ、ブリ、マアジ、カワハギなどがもつ。 （第三背鰭、だいさんせびれ、） タラ類などが有する。 臀鰭（しりびれ、でんき、尻鰭、） 遊泳の際、体の安定性を保つ。遊泳そのものに重要な役割はない。穴を掘って産卵床を作る魚類においては、雌が産卵床を掘る際、礫と礫の間に砂利や砂を除去できたかどうかを探る道具として使われる。通常1基だが、リュウグウノツカイ、フリソデウオなどは0基、タラ類は2基ある。 （しりびれようまくとっき） ヤツメウナギが持つ鰭状突起物
尾鰭（おびれ、びき、、） 魚類の尾端にあり、脊柱後端部で支持される鰭。支持する骨格との関係で分類される。左右の動き（ビート）で遊泳時の主な推進力を作り出す。尾鰭の上部を上葉（じょうよう）、下部を下葉（かよう）という。リボンイワシの幼魚期の尾鰭は著しく長く、尾鰭長（リボン状尾鰭）は体長の14.6倍。 （げんせいび、） または 両尾（りょうび） 尾鰭後端が細く尖り、脊椎骨末端がまっすぐな尾鰭。背腹で相称となる。円口類などがもつ、原始的な尾鰭である。発生的には下記の尾鰭も原生尾に近い形態を経過して形成される。 （いび、） または 歪尾（わいび）
上葉と下葉が著しく異なった尾鰭。軟骨魚類、チョウザメなど古いグループのもの。脊柱の尾端が背側に曲がってできるため、サメの尾鰭の上葉の中には脊柱が走り末端まで通っているのに対し、下葉は鰭を支える下索軟骨と角質鰭条で支持されているだけで柔らかい。上葉は縮小し、下葉が発達するため、背腹で不相称となる。 （せいび、） 上下両尾が同長で同形な尾鰭。真骨類の多くが持つ。異尾よりもいっそう上葉が縮小し、下葉が発達して相称となることで形成される。 （きょうび、） ウナギ、ハイギョにみられるように、二次的に原正尾に近い形になったもの。マンボウの舵鰭もこの名で呼ばれることがある。 （ぎび） タラ科魚類にある特殊な尾鰭骨格。脊椎骨の後方の神経棘と血管棘が尾鰭棘条の大部分を支持する。 尾鰭後縁（おびれこうえん、びきこうえん） 尾鰭の最後の縁。尾鰭後縁の形は種によってさまざまである。生態と関係が深い。円いものを円形（えんけい、）、まっすぐなものを截形（せつけい、）、円く窪んでいるものを湾入形（わんにゅうけい、わんにゅうがた、）や三日月形（みかづきけい、みかづきがた、）、鋭く切れ込んでいるものは二叉形（にさけい、）、後方に鋭く突出するものは尖形（せんけい）と呼ばれる。楔形（くさびがた、）、二重湾入形（にじゅうわんにゅうけい、にじゅうわんにゅうがた）、二重截形（にじゅうせつけい）のものもある。截形や楔形のものは泳ぎが遅く、三日月形や二叉形のものは泳ぎが速い。マダイは二叉形、ジンベエザメは三日月形の尾鰭を持つ。 膜鰭（まくき、） 多くの種の不対鰭は、発生過程で一続きの膜状の鰭となることがあり、この膜状の鰭をいう。幼生期に中間部が消失して鰭条を持った成魚の鰭に置き換わる。
（あぶらびれ、） 背鰭と尾鰭の中間にある膜状の小さな鰭状突起物。原則として鰭条が欠く。機能は定かではない。真骨類の低位グループにある。旧サケ目（サケ目のサケ科、キュウリウオ目のキュウリウオ科やシラウオ科）、ハダカイワシ目のハダカイワシ科、ナマズ目のハマギギ科（ゴンズイ科などにはない）、カラシン目、ヒメ目のエソ科、アオメエソ科など約10科がもつ。 （しょうりき、） または 離鰭（りき、はなれびれ） 背鰭や臀鰭後方に独立にある、小さな遊離した鰭。泳ぐ際、水の渦流を少なくする。マグロ、アジ、サンマ、サワラなどがもつ。 イトマキエイ類（イトマキエイ、オニイトマキエイ、ヒメイトマキエイなど）の頭部にある耳状の突起。体盤を形成する胸鰭が頭の両側でいったん消失し、吻端で再度出現し形成される耳朶状のもの。近縁のトビエイ類にはない。食事の際手や唇のような働きをする。 （かじびれ、） または 橋尾（きょうび） マンボウの体の後端にある鰭。マンボウには尾鰭がなく、背鰭と臀鰭の要素が組み合わさってできたもの。左右に舵を切る。
鱗
鱗（うろこ、） 体表を覆う硬質の小薄片状形成物。真皮に起生する皮骨（外骨格）。大きく楯鱗、硬鱗、骨鱗に区別される。 楯鱗（じゅんりん、） または 皮歯（ひし、） 板鰓類の鱗。真皮に形成され、骨性の基底版から突起が体表に突出する。突起内部には髄腔があり、血管や神経が入る。髄腔を象牙質が囲み、外表面は表皮由来のエナメロイド（、中胚葉性エナメル、ちゅうはいようせいエナメル、）が覆う。歯と同じ構造をしているため皮歯とよばれるが、発生も歯と同様である。サメ類では全身に密生し「鮫肌」となるが、エイ類では退化的で体表各所に点在する。とくにシビレエイは完全に退化する。 硬鱗（こうりん、） 狭義にはガノイン鱗のこと。広義にはコズミン鱗を含む。 ガノイン鱗（ガノインりん、） または 硬鱗（こうりん） ガー、チョウザメ類などがもつ鱗。真皮内の骨板中に細い血管が走り、その表面は表皮と真皮に由来するガノイン（、硬鱗質、こうりんしつ）で覆われる。ガノインにより真珠光沢が付与される。菱形板状で大形、蝶番様構造で互いに連結する。 コズミン鱗（コズミンりん、） 肉鰭類の鱗。デボン紀の魚類には一般的であったが、現生ではラティメリアのみがもつ。骨性の基底板の上に脈管系を伴ったコズミン（）と呼ばれる象牙質層ができ、その表面をエナメロイドが覆う。 （こつりん、） または 葉状鱗（ようじょうりん、）、板状鱗（ばんじょうりん、） 硬骨魚類にみられる鱗。真皮に由来する、骨性の円形の薄板。硬い骨質の上層（骨質層）と膠原繊維の下層（繊維板層）からなる。通常は皮膚の薄層がその表面を覆うが、裸出し前端のみが真皮中にあることも多い。前方の鱗が後方のものを覆い、屋根瓦状に配列する。同心円状の線条（隆起線）及び放射状の線条（溝条）がある。 円鱗（えんりん、） 後部の表面（露出面）が滑らかで棘を持たない鱗。硬骨魚類に普通にみられる。形は円形、四角形、卵形など様々。マイワシ（ニシン科）、カタクチイワシ（カタクチイワシ科）、サケ（サケ科）、アユ（キュウリウオ科）、コイ（コイ科）、メダカ（メダカ科）などにみられる。 櫛鱗（しつりん、） 薄く、後部表面（露出面・自由面）に多数の小棘がある鱗。小棘の発達程度は種や部位によってさまざまである。イットウダイ（イットウダイ科）、ソコダラ類（ソコダラ科）、スズキ（スズキ科）、イサキ（イサキ科）、マダイ（タイ科）、カナガシラ（ホウボウ科）などにみられる。小棘の発達が悪いものを特に有毛鱗（ゆうもうりん、）という。 側線鱗（そくせんりん、） 側線上に並んだ鱗。鰓蓋後部上から尾鰭基底までの数を側線鱗数という。 （ゆうこうそくせんりん、） または 側線有孔鱗（そくせんゆうこうりん） 外部から小孔の見える側線鱗。 胸甲（きょうこう、） 胸鰭基底から後方に伸びる硬い鱗の集まり。マグロ、カツオ類に発達している。 隆起線（りゅうきせん、） または 環状隆起線（かんじょうりゅうきせん）、環状線（かんじょうせん、）、成長線（せいちょうせん）、同心円線（どうしんえんせん） 円鱗や櫛鱗の表層に同心円状に並んだ隆起。各隆起線間は魚体の成長速度に比例し、成長の速いときには広く成長帯とよばれ、遅いときには狭くなり休止帯と呼ばれている。大抵年周期で形成される。 年輪（ねんりん、） 年周期で休止帯によって形成される輪紋。休止帯は水温の変化、採餌量の減少、その他の生理的要因によって形成される。 コンディション輪（コンディションりん、） 繁殖期に形成される産卵記号で、体の脂質含量の低下に伴い形成される輪紋。 擬年輪（ぎねんりん、） 何らかの生理的要因によって形成される輪紋。 溝条（こうじょう、） または 放射条（ほうしゃじょう、） 円鱗、櫛鱗の外面に放射状に走る小溝。放射状に走るもの以外に前後、上下方向に走るものもあり、これにより鱗は柔軟性を得て魚体の運動を円滑にする。鱗の破損を防いでいる。 鱗相（りんそう、） または 鱗紋（りんもん、） 円鱗及び櫛鱗の表面に隆起線と溝条によって形成される紋様。 鱗鞘（りんしょう、） 背鰭や臀鰭の基底部を覆う鱗の集合体。鱗で形成された溝状部。 鱗板（りんばん、） トゲウオやカジカなどの体表を覆う鱗のようにかたくて大きな板状の鱗。有無や数、配列の仕方は分類形質となる。 腋鱗（えきりん、） サケ科魚類に独特の、腹鰭基部にある葉状の鱗。 （りょうりん、） イワシ類の腹縁やアジ類の体側にある肥大した鱗。表面に鋭い稜線を形成している。有無や数は種の識別に用いられる。俗にゼンゴやゼイゴとも呼ばれる。 腹部稜鱗（ふくぶりょうりん） サッパやコノシロ、イワシなど（ニシン科）の腹中線に並ぶ稜鱗。 楯状鱗（じゅんじょうりん） アジ類の側線上にある稜鱗。鱗列に沿って稜線を形成する。
呼吸器官
鰓（えら、、） 呼吸機能や摂食機能、浸透調整機能などをもつ。水中の酸素を取り込み、血中の炭酸ガスを排出する（呼吸機能）。周りの水中の酸素量の85%あまりまで利用できる。 水と一緒に飲み込んだ餌を水と分けて咽に送り込む（摂食機能）。 内鰓（ないさい、、） 鰓蓋の中にある鰓。外鰓の対義語。 外鰓（がいさい、） 鰓孔の外に突き出た羽毛状の鰓。ハイギョやポリプテルスの幼生、軟骨魚類の後期胚にある。支持骨を欠く。 全鰓（ぜんさい、） または 完全鰓（かんぜんさい） 硬骨魚類では鰓隔膜が退縮して鰓弓の部分だけが残り、この前後に鰓隔膜から突出する2列の櫛状となって直接相対し、合する片鰓。 鰓蓋（さいがい、えらぶた、羅・） 硬骨魚類の鰓を外側から覆う保護のための構造。内部はいくつかの骨格要素を持つ。 鰓腔（さいこう、さいくう） 鰓室（さいしつ、） 鰓の収められている体の腔所。 鰓弁（さいべん、） または 鰓葉（さいよう） 鰓腔の中に詰まっている呼吸器官で、血管が透けて見えるため赤い。ガスや塩類の交換がなされる。鰓弓の外側に並んでいる。表面に多数鰓薄板が並ぶ。 鰓蓋鰓（さいがいさい、） 硬骨魚類の鰓蓋の内面に生じ、鰓としての機能を持つ鰓弁。鰓蓋は本来鰓弓に相当する第二咽頭弓から発達したものなので、しばしば機能を持った鰓となり、擬鰓とは異なる。 二次鰓弁（にじさいべん、） 二次鰓弁の毛細血管の流れる血液の流れは呼吸水の流れと反対である。表面には塩類細胞がある。 （えんるいさいぼう、） または 塩類分泌細胞（えんるいぶんぴつさいぼう、） 硬骨魚類の二次鰓弁の上皮組織にみられる大型の好酸性分泌細胞。ミトコンドリアと滑面小胞体に富み、ナトリウムイオンと塩化物イオンを能動的に排出する。海水魚では塩類細胞基底部は血管に接し、他端はピットを形成して外界に接する。基底部と側面の細胞膜から入り込んだ滑面小胞体が網目状にミトコンドリアを取り巻きながら端部に向かう。海水魚の鰓に多く、淡水魚に少ない。ニジマスやウナギなどの広塩魚を淡水から海水に移すと塩類細胞は急激に数と大きさを増し、ミトコンドリアも増加する。ナトリウム–カリウムATPアーゼ活性が高く、排出の原動力となる。コルチゾルやACTHは塩類細胞とこの酵素活性を増加させる。 鰓薄板（さいはくばん、） 鰓弁の表面に直立して並んでいる。総面積は広く、平均して体表の表面積の2倍前後ある。 （さいれつ、） または 鰓孔（さいこう、えらあな、鰓穴） 鰓腔から体外へ呼吸水を出す孔。（脊椎動物全体では、脊椎動物胚の咽頭から外界に開通する裂孔。そのうち魚類では鰓裂に面した前後の壁に多数の鰓弁を生じ呼吸器官となる。）成魚では体外側及び咽頭に面する部位を区別して外鰓裂（外鰓孔）、内鰓裂（内鰓孔）という。鰓裂（咽頭裂）の数は動物により異なり、ヌタウナギ類では6–14対、ヤツメウナギ類では7対（真の眼を含めて名の由来となる）、軟骨魚類では6対、まれに8対、硬骨魚類では5対ある。 鰓膜（さいまく、） 鰓条骨を繋ぎ、支えている膜。呼吸の際、鰓腔内の水圧を調節する働きがある。左右の鰓膜が峡部で合一するかどうかは魚類の区別に重要な分類形質である。 鰓隔膜（さいかくまく、えらかくまく、） または 鰓間隔壁（さいかんかくへき） 鰓裂間にある膜（隔壁）。軟骨魚類ではよく発達し長く、その前後の壁に生じる片鰓は完全に隔てられる。硬骨魚類では退縮して短く、その前後の片鰓は全鰓となる。 鰓耙（さいは、、） または 鰓篩（鰓師、さいし） 無顎類を除く魚類にある鰓弓の内側から前方へ向かい並んでいる結節状や繊維状の突起。微細な餌を水から濾し分ける働きがある。 プランクトン食の種は羽毛状でよく発達し、数が多い。魚食性のものや底生生物を主食とするものは瘤状で数が少ない。鰓耙数や形はよい分類形質となる。 鰓歯（さいし、） 鰓耙のうち歯状のもの。 片鰓（へんさい、、） または 半鰓（はんさい） 鰓裂の一側（外壁か内壁の鰓弁列）を総称して言う語。 （偽鰓、ぎさい、、） 鰓蓋の内側にあり、支持骨である鰓弓を持たない鰓。軟骨魚類の呼吸孔と硬骨魚類のそれに相当する部位で、顎骨弓と舌骨弓間の第1咽頭裂に当る部位に発達する鰓と系列相同の構造である。軟骨魚類では呼吸孔鰓（こきゅうこうさい、）という。動脈血のみが流れ、呼吸作用はない。硬骨魚類では鰓のような外観を保持する場合もあるが、筋肉や結合組織で覆われ、血液を満たし腺状を呈することもある。皮下に埋没することもある。働きは十分に判明していないが、血液の酸素と炭酸ガスの分圧の受容器として働いているという説、ナトリウムの排出に関与しているという説などがある。強力な二酸化炭素排出能力を持つ。その有無は分類形質となる。 （鰓嚢、さいのう、） 円口類において鰓裂の途中が拡張して形成される囊状の器官。その内面に多数の鰓弁を生じ、鰓を形成する。鰓囊は鰓弓骨格に相当する軟骨が複雑に変形した鰓籠により包まれている。 （いんひかん、） または 食道皮管（しょくどうひかん、） ヌタウナギ類の左体側最後の鰓囊の直後にみられる小管。咽頭内の余分な水分を外に排出するためのもの。鰓裂に由来はするが才能を形成することなく、咽頭と体側外面の間に単純な小管をなす。この外鰓孔は他の外鰓孔より遥かに大きい。ヤツメウナギではこれを欠く。 鰓籠（鰓篭、さいろう、） ヤツメウナギ類に独特の骨格部分。鰓の流出管を囲み、軟骨からなる複雑な籠状の器官。鰓を保護する。ただしヌタウナギ類では痕跡的。 噴水孔（ふんすいこう、） または 呼吸孔（呼吸口、こきゅうこう、） 軟骨魚類や基部で分岐した硬骨魚類の一群に見られる、眼の直後、鰓裂の前方に開孔した呼吸器官。サメ類、エイ類、一部のチョウザメ類が持つ。板鰓類では眼の後方にあり、咽頭に通じる小孔。これは本来は顎弓と舌弓の間にある第1鰓裂の痕跡である。エイ類では実際に呼吸孔を通じて呼吸用の水が咽頭に導かれる。 上鰓器官（じょうさいきかん、） カムルチーなどの鰓腔上部にみられる、鰓腔や鰓蓋の粘膜が襞状になり、毛細血管が発達して補助的に空気呼吸する器官。発生的起源が迷路器官と異なり、迷路を形成しない。 （めいろきかん、） または 迷路状器官（めいろじょうきかん、） キノボリウオなど迷器類（めいきるい、）に属する魚類における補助的な空気呼吸器官。鰓の上部にあり、舌顎突起で不完全に区画された上鰓腔内に血管の富んだ多数の襞を持つ室を形成している。第1鰓弓の上皮が発達したもので、1–2層の扁平上皮もしくは立方上皮からなり、上皮内血管がみられる。
歯・消化器官
歯（は、） 魚類の歯は上下両顎（顎骨）、前鋤骨、舌、口蓋骨、咽頭骨、中篩骨などにある。顎骨以外のものは餌を噛み砕いたり、切り刻んだりするには小さすぎ、口に咥えた餌を逃さないためにあると考えられる。摩耗するとすぐその付近から新たな歯が生え始める。 円錐歯（えんすいし、） 断面は丸く、先の尖った錐状の歯。待ち伏せて餌を獲るマエソ、アンコウなどでは大きくて数が多い。高速で泳ぐカツオ、サワラなどでは小さい。 臼歯状歯（きゅうしじょうし、） または 臼歯（きゅうし） 噛み合う面が広くて臼のような形をした歯。径が大きくなり、先端が平たい。固い殻を持つ動物を食べるマダイやイシダイなどによく発達する。 門歯状歯（もんしじょうし、） 板状で切縁がナイフのように鋭い葉。上顎と下顎で癒合しており噛み切るのに適した歯または、1列に密に並んでいる歯をいう。前者はブダイ科やトラフグ科、後者はイスズミ科で見られる。 犬歯状歯（けんしじょうし、） または 犬歯（けんし） 長く牙状の歯。円錐歯が肥大かつ彎曲した歯のこと。貪食なミズウオ、タチウオによく発達する。 敷石状歯（しきいしじょうし、） タイル状の歯 鋸歯状歯（きょしじょうし、） 鋸の歯のような歯。 絨毛状歯（じゅうもうじょうし、） 微細な歯。 絨毛状歯帯（じゅうもうじょうしたい） 微小な歯が密生した歯帯。 上顎歯（じょうがくし） 上顎骨に並ぶ歯。 前上顎骨歯（ぜんじょうがくこつし） 上顎歯のうち前上顎骨に並ぶ歯。 主上顎骨歯（しゅじょうがくこつし） 上顎歯のうち主上顎骨に並ぶ歯。 下顎歯（かがくし） または 歯骨歯（しこつし） 下顎骨（歯骨）に並ぶ歯。 鋤骨歯（じょこつし） 鋤骨に並ぶ歯。 口蓋骨歯（こうがいこつし） 口蓋骨に並ぶ歯。 口蓋歯（こうがいし） ヌタウナギ科で口蓋中央にある1本の針状歯。 内翼状骨歯（ないよくじょうこつし） 内翼状骨に並ぶ歯。 副蝶形骨歯（ふくちょうけいこつし） 副蝶形骨に並ぶ歯。 基舌骨歯（きぜっこつし） または 舌下歯（ぜっかし） 基舌骨にある歯。 基鰓骨歯（きさいこつし） 基鰓骨に並ぶ歯。 咽頭歯（いんとうし、） 咽頭骨に並ぶ歯。食物の咀嚼に使われる。形状は食性と関係している。固い餌を食べるブダイ、ベラ、ウミタナゴ類はよく発達する。 上咽頭歯（じょういんとうし、） 上顎の咽頭歯。 下咽頭歯（かいんとうし、） 下顎の咽頭歯。 歯板（しばん、） 大きな歯が互いに癒合したもの。
（かくしつし、） 円口類の口腔およびその周辺や舌にある歯状物。表皮の角質形成物で、脊椎動物の象牙質を持つ真歯とは異なる。円錐形を成し、消耗すると更新される。 （じょうしんし） ヤツメウナギ類の背面にある一群の歯。 （かしんし） ヤツメウナギ類の腹面にある一群の歯。 （そくしんし） または 内側唇歯（ないそくしんし） ヤツメウナギ類の口の左右側面にある歯のこと。 （しゅうへんし） ヤツメウナギ類にある歯。その周りにはがある。 （こうしばん、） ヤツメウナギ類が持つ角質の歯。餌となる生物への吸着や、筋肉を舐めとるといった作用がある。 （じょうこうしばん、 下より上方にある歯板。ヤツメウナギ類の口歯板の背側。 （かこうしばん、） 舌より下方にある歯板。ヤツメウナギ類の口歯板の腹側。 （ぜんぜっしばん） ヤツメウナギ類にある歯板。 （かとうし、） 必要に応じて基部が折れ曲がって、内側または奥の方に倒れ、再び元に戻る歯。 （ゆうさようし、） または 作用歯（さようし）、機能歯（きのうし） 表面上に突出して作用している歯。 （ほじゅうし、） 現在作用している歯の直下または近くにあって、有作用歯が脱落した際発達して代替する歯。 （がいれつし） メジナ属で上下顎歯の歯列で摂餌に機能している歯の列。
口腔咽喉囊（口腔咽喉嚢、こうこういんこうのう、こうくういんこうのう） ペリカンのように下顎の腹面にできた袋状物。フクロウナギ、ウケグチザラガレイなどの深海魚にみられる。 咽喉囊（咽喉嚢、いんこうのう） 咽頭にある盲囊。餌となる微生物を集めるのに役立つ。 食道（しょくどう、） 消化管の一部。 食道囊（食道嚢、しょくどうのう、） 食道にある膨れた袋状物。内面に歯の形をした突起がある。 胃（い、） 消化管の一部。硬骨魚類の中でもコイ類、ダツ類、サンマ類、ベラ類、ブダイ類は胃を欠く。 腸（ちょう、） 消化管の一部。腸の巻き方は近似種間でかなり異なる。 螺旋弁（らせんべん、） 腸の内面にある。消化吸収の効果を大きくする。軟骨魚類や原始的な硬骨魚類にある。 直腸（ちょくちょう、） 腸の末端部。 腹腔（ふくこう、ふっこう、ふくくう、、） 消化管、鰾、生殖腺、腎臓などの諸器官を包蔵した体腔。 腹膜（ふくまく、） 腹腔の内壁および腹腔の中の内部各器官を覆う薄い膜。 肝膵臓（かんすいぞう、） 膵臓の組織が肝臓内に入り込んだもの。コイ、キス、タイ、ベラ、カワハギなどがもつ。 幽門垂（ゆうもんすい、） 硬骨魚類の胃と腸の境（幽門部）にある紐状あるいは棍棒状の盲囊。食物の消化と脂肪などの栄養分の蓄積をする働きがある。分類形質となる。
感覚器官とその付属器
眼（目、め、、） 魚類の眼には涙腺がなくレンズが球形で、角膜（かくまく、）に接近して位置する。 網膜にうまく像を結ぶため、硬骨魚類ではレンズ牽入筋（レンズ収縮筋）の作用でレンズを後方に移動させる。いっぽう軟骨魚類ではレンズは正常な位置で遠くを見るようになっており、近くを見るときはレンズ牽入筋の働きで前方に移動させる。 瞳孔（どうこう、） または 瞳（ひとみ） レンズの前面に虹彩（こうさい、）があり、その中央部に円形の瞳孔が位置する。多くの硬骨魚類の瞳孔の大きさは明るさによって変化しない。 虹彩皮膜（こうさいひまく）