屋久島（やくしま）は、鹿児島県の大隅半島佐多岬南南西約60kmの海上に位置する島。熊毛郡屋久島町に属し、近隣の種子島や口永良部島などと共に大隅諸島を形成する。南方に位置するトカラ列島や奄美群島などとともに南西諸島を構成する。
九州最高峰の山、宮之浦岳（標高1936m）がある。自然が豊かで、屋久島国立公園の中核をなし、世界自然遺産の一つに登録されている屋久島世界遺産センター 環境省（2021年4月29日閲覧）。
概要 面積504.29 km 国土地理院、周囲130km（東西約28km、南北24km）。円形に近い五角形をしており、淡路島よりやや小さい。鹿児島県の島としては奄美大島に次いで2番目、日本の中では本州など4島を除くと面積第9位である国立天文台(編) 平成19年 理科年表 p.565 ISBN 4621077635 択捉島-国後島-沖縄本島-佐渡島-奄美大島-対馬-淡路島-天草下島-屋久島の順。。
豊かで美しい自然が残されており、島の90%が森林である。島の中央部の宮之浦岳（1936m）を含む屋久杉自生林や西部林道付近など、島の面積の約21%にあたる107.47 km2がユネスコの世界遺産に登録されている。
屋久島が世界遺産に登録されたのは1993年であり、姫路城、法隆寺、白神山地とともに、日本から最初に登録された世界遺産の一つである。
本島においての発電は、屋久島電工が製錬所の自家発電のために建設した火力発電所と水力発電所からの電気を、安房電気利用組合、種子屋久農協、九州電力送配電、屋久島町の4事業者が分担して供給している。したがって本島では九州電力送配電が電気を供給していない世帯や事業者も存在する。平素、島内の電力は水力発電で賄われており、火力発電は緊急時に限って活用される。
地理
地形・地質 屋久島はほぼ全域が山地であり、1,000mから1,900m級の山々の連なりは八重岳と呼ばれ洋上アルプスの異名もある「八重岳」『世界大百科事典』28（平凡社、2009年）p.348。屋久島山地と記述した文献もある勝廣光『奄美の稀少生物ガイド I: 植物、哺乳類、節足動物ほか』南方新社、2007年初島住彦『南九州・里の植物: 太陽の贈り物』南方新社、2001年。中央部には日本百名山の一つで九州地方最高峰の宮之浦岳 (1,936m) がそびえる。このような中央部の高峰は奥岳と呼ばれ、永田岳を除き海岸部の人里から望むことはできない。宮之浦岳、永田岳および栗生岳は屋久島三岳とされ、山頂に一品宝珠大権現が祀られ古来より嶽参りの対象とされてきたが太田五雄『屋久島の山岳 近代スポーツ登山65年の歴史と現在』八重岳書房、1993年、『三國名勝図會』の記す栗生嶽は位置的に現在の黒味岳に相当するとする説もある。海岸部から間近に聳える山々は前岳と呼ばれ、本富岳、国割岳および愛子岳などがある。また、鬼界カルデラを生んだ約7300年前の大噴火の際、屋久島は火砕流によって島の大部分が覆われたことがあるとされている。
地質的には西南日本外帯の四万十帯に属し、島外周部は日向層群（旧称・熊毛層群） の古第三紀堆積岩からなり、中央山岳部は直径約25kmの巨大な花崗岩が貫入している。屋久島の高山はこの1550万年前にできた花崗岩がその後に隆起して形成された。また激しい雨による侵食の結果として残された花崗岩塊が点在し、永田岳の山頂付近に見られるローソク岩のような岩塔が林立する。一般に花崗岩は広い間隔で節理が発達するため巨大な岩塊が生まれる。さらに島の北西-南東方向および、北東-南西方向に発達した渓谷や尾根筋も節理の方向に沿って侵食が進んだ結果である田代博、藤本一美、清水長正、高田将志『山の地図と地形』山と溪谷社、1996年。
屋久島を流れる河川は放射状に広がり、その数は140にも及ぶ。主な河川は安房川、宮之浦川、永田川、栗生川の4つである。また急峻な山々と日本一を誇る雨量のため深い渓谷が刻まれ、河床は急勾配で滝が発達している。大川の滝、千尋の滝などが良く知られ、宮之浦川には、屋久島最大の竜王滝（3段110m）がある。
小島・岩礁 国土地理院地図（抄）。陸繋した浜辺や海礁上の小岩、無名の岩を除く。 山ノ瀬 - （屋久島町）小島沖。
気候
海からの湿った風が島内の山地にぶつかることで地形性降雨が生じ、屋久島の山岳部は多雨地域として知られている。このような気候について、作家の林芙美子は小説『浮雲』（1949年-1951年）のなかで「屋久島は月のうち、三十五日は雨といふ位でございますからね」と登場人物に語らせている。
年間降水量は地域差が大きく、平地では4,000〜5,000mm程度であるのに対し、山地では8,000〜12,000mmに達する。 気象庁の屋久島特別地域気象観測所（沿岸部）の平年降水量は4,651.7mm（1991–2020年）で、気象庁の観測地点の中では全国最多となっている（2位は宮崎県えびの高原アメダスの4,625.0mm）。
とりわけ山岳部では降水量が多く、淀川登山口では1999年に11,720mm、ヤクスギランドでは2012年に11,130mm（平年値10,048mm）を記録している。ヤクスギランドでは、2019年5月19日に日降水量1231 mm、5月18日11時-19日11時の24時間に1676 mmを記録、2日間の総雨量は2333 mmに達した。
こうした降水量は、世界最多とされるインド・チェラプンジの平年値10,449.3mm（1971–2000年）に匹敵する水準であり、屋久島の山岳部が世界屈指の多雨地域であることを示している。
一方、沿岸部の平地では降水が特定の季節に集中する傾向があり、年間を通じて常に降雨が多いわけではない。
また山頂付近の年間平均気温は約6-7℃（北海道札幌市よりも低い）であるために積雪が観測されている。60cm以上の積雪を観測することがあるほか、3月の彼岸以降でも大雪や路面凍結、また4月以降でも頂上付近ではまだ冠雪が見られる。こうした条件により、豊富な流水や湧水に恵まれ、1985年、宮之浦岳流水は名水百選に選ばれている。また、日本の地質百選にも2007年に選定された。
平均気温の推移℃ 最高気温・最低気温・湿度の推移平均最高気温最高気温（最高値）最高気温（最低値）平均最低気温最低気温（最低値）以下の数値は資料不足値の為未記載「2014(4.2)」最低気温（最高値）各階級の日数平均湿度の推移以下の数値は資料不足値の為未記載「2003(74),2011(69),2012(77),2017(74),2021(76)」 出典：気象庁
生物的環境 植物相 温帯最南部のほぼ亜熱帯に属する地域にありながら、2,000m近い山々があるため亜熱帯から亜寒帯に及ぶ多様な植物相が確認されている。
海岸付近の低地はアコウ、ガジュマルなど亜熱帯性の植物相である。このガジュマル林は日本最北端のものとされる。
やや内陸の標高約500mまではシイ、ウラジロガシなど暖帯林、約500mないし600mから1,000mないし1,200mはウラジロガシ、スギおよびイスノキなどの混合林で移行帯となりスギの人工林もあり、約1,000mから1,600mは屋久杉、ヤマグルマおよびモミなどの温帯林となる。約1,600m以上はササに覆われ、ヤクシマシャクナゲなどが点在し、高山的様相を呈する日下田紀三『屋久島 森・水・山』八重岳書房、1993年『屋久島の森林』熊本営林局屋久島森林環境保全センター、1996年。。本州や四国などで落葉広葉樹林帯に相当するブナ林はなく代わりに屋久杉が分布し、同程度の標高である石鎚山脈、剣山地および大峰山脈とは異なり、南海上の島である屋久島はシラビソなどの亜高山帯針葉樹林を欠く足利武三、吉田昭市、瀬尾央 『新版・空撮登山ガイド 四国・九州の山々』山と渓谷社、1996年。
島の中心部には、日本最南端の高層湿原である花之江河（はなのえごう）、小花之江河（こはなのえごう）が存在する。
ヤクシマの名を冠した植物は極めて数が多く、以下のようなものがある。 コケ植物 、、、ヤクシマアミバゴケ、、、、、、、、、、、ヤクシマナワゴケ、 シダ植物 ヤクシマキジノオ、ヤクシマホングウシダ、、、ヤクシマホウビシダ、、ヤクシマミゾシダ、ヤクシマショリマ、、ヤクシマタカノハウラボシ、 双子葉植物 、ヤクシマカラマツ、ヤクシマハコベ、ヤクシマツバキ、ヤクシマコオトギリ、ヤクシマスミレ、ヤクシマミヤマスミレ、、ヤクシマアセビ、ヤクシマシャクナゲ、オオヤクシマシャクナゲ、ヤクシマホツツジ、ヤクシマタチバナ、ヤクシマアジサイ、ヤクシマガクウツギ、ヤクシマショウマ、コヤクシマショウマ、ヤクシマウメバチソウ、ヤクシマダイモンジソウ、ヤクシマバライチゴ、、、ヤクシマサルスベリ、、、、ヤクシマキイチゴ、ヤクシマフウロ、、ヤクシマセントウソウ、、、ヤクシマヘツカリンドウ、ヤクシマトウバナ、、ヤクシマオオバコ、ヤクシマムグラ、ヤクシマヤマムグラ、ヤクシマハシカグサ、ヤクシマウスユキソウ、、、、、、ヤクシマヒゴタイ 単子葉植物 ヤクシマヒロハテンナンショウ、ヤクシマカンスゲ、ヤクシマハマスゲ、ヤクシマイトスゲ、ヤクシマノガリヤス、、ヤクシマノギラン、ヤクシマイトラッキョウ、ヤクシマシライトソウ、ヤクシマチャボゼキショウ、、ヤクシマシュスラン、ヤクシマアカシュスラン、、ヤクシマトンボ、ヤクシマネジバナ、、
また、屋久島の植物にはなぜか他より小さいものが多い。たとえばはかつてはアキノキリンソウの変種とされたものだが、せいぜい7cmにしかならない（アキノキリンソウは30cm以上になる）。このようなものは山野草や盆栽としての鑑賞価値が高いため、これらを屋久島ものと呼んで珍重する動きがある。また、これに便乗する形で、他地域産のものでも小柄な姿のものに対して「屋久島○○」と名付けて販売される場合があるという。
動物相 thumb|ヤクシカ 野生哺乳類としては、ヤクザルやヤクシカ、コウベモグラ、ジネズミ、ヒメネズミ、コイタチ、コウモリ数種しか生息していない。1990年代から外来種のタヌキが観察されるようになり、定着したものと思われる。沖合は古来、様々な鯨類の回遊路にあたり、大幅に種類が減ってしまった現在でもマッコウクジラやイルカ類等が近海で見られ、2010年代からはザトウクジラの確認も増えており、将来的なホエールウォッチングの可能性の調査を兼ねた陸上からの観察会も行われている「馬毛島基地（仮称）建設事業に係る環境影響評価準備書に対する環境の保全の見地からの意見について高田奈央さん／ヤクシマ・クジラ イルカ研究所。薩摩藩政時代にはジュゴンがジュゴンと藻場の広域的調査 - 平成 13 年～17 年度 結果概要 、昭和初期にはカワウソ鹿児島大学総合研究博物館 第13回 特別展 屋久島の自然が生息していたことが報告されているが、標本等は残されていない。
ヤクシカは杉の芽や希少植物を食害する面もあるため、捕獲して食肉として加工する屋久島ジビエ加工センターが2017年度に整備された「鹿児島・屋久島加工センター 国産ジビエ認証取得 離島で初 ヤクシカ利活用へ弾み」『日本農業新聞』2021年2月12日18面。
爬虫類ではニホントカゲやマムシなどが知られ、日本本土とほぼ共通である。
島北部の永田浜は世界有数のアカウミガメの産卵地であり、ラムサール条約登録湿地となっている（後述）。
動物相の特徴 上記のような哺乳類、爬虫類、両生類、昆虫類は日本本土と共通、あるいは関係が深いものである。それに対してこの島より南の南西諸島に見られるアマミノクロウサギやハブなど、南西諸島に独特のものは見られない。そのため、この島の南側に分布境界線として渡瀬線（渡瀬ライン）を認める。
屋久杉 thumb|200px|ウィルソン株付近の杉林
スギ（杉、）の屋久島に産し、樹齢が1000年を超えるものをヤクスギと呼んでいる。屋久島の強風、多雨、地質、シカの生息などの自然環境に対応して抗菌性を持つ樹脂を多量に分泌し、極めて長寿になる、幼樹の葉が鋭いなど、特徴的な形質を有する。
ヤクスギ、モミ、ツガを主体とする温帯針葉樹林は屋久島の標高600m以上に分布する。600 - 1,200 ｍは低地を占める照葉樹林との移行帯であり、両方の要素が混交する。
抗菌性が強く耐久性があることが重視され、中世以降、建築材や造船材として開発された山本秀雄編『屋久島歴史小年表』有限会社生命の島、2007年。豊臣秀吉による京都の方広寺大仏殿建立の際、石田三成が島津義久に屋久島の木材資源調査を指示しており、実際に木材が薩南海域から大坂へ運ばれた形跡がある屋久町郷土史編さん委員会編『屋久町郷土誌 第1巻』1993年3月。
17世紀に薩摩藩によるヤクスギの伐採が本格化し、明治になるまでにヤクスギの良木のほとんどが伐採された。樹齢1000年程度の巨木は年輪が歪み、山地での製材が不可能であったため放置され、現在も生きているものが多い。伐採跡地にはスギの稚樹が成長し、以来300～400年を経て美しい二次林を形成している。三次林となっている林分も広い。現在は1000年程度の巨木や変形木をヤクスギ（屋久杉）とよび、二次林・三次林をつくる若いスギをコスギ（小杉）と呼ぶ屋久杉自然館編『屋久島やくすぎ物語』屋久杉自然館、2004年。
明治以降、屋久島の山林の大半は国有林に編入され、大正から昭和にかけて二次林・三次林の伐採が進んだ。1000年以上の「屋久杉」は切り残されることが多かったが、樹齢400年以下の「小杉」は、屋久杉ではないとされ、1955年（昭和30年）にチェーンソーが導入されるとともに、大々的に伐採が進んだ大澤雅彦・田川日出夫・山極寿一編『世界遺産屋久島 亜熱帯の自然と生態系』朝倉書店、2006年。
現在、原生自然環境保全地域に含まれる小楊枝川流域、国立公園第一種特別地域に含まれる永田川流域、宮之浦川上流域、東部の安房川支流荒川左岸（ヤクスギランド）などがヤクスギの主要な群落として僅かに残されている。
屋久島最大の「縄文杉」はかつてその巨大さから推定樹齢6000年以上であるとされ、環境省（当時は環境庁）の環境週間ポスターで「7200歳です」と紹介されたことで、全国的に有名になった。現在では放射性炭素年代測定法で推定樹齢約2000年以上であることが確認されている。またその際に内部組織の年代が入り乱れ、同心円状の年輪を形成していなかったことから合体木であるという説があったが、これに対して数本の大枝から葉をサンプリングして遺伝子分析解析を行った結果、同じ遺伝子の木であることが明らかになった。ただし、杉の場合、木の枝どうしが癒着する接合木、倒木の上に新木が生える更新木といった現象がよく知られており、同じ遺伝子であっても、同じ木からの複数の落ち枝がいわばそれぞれ苗木となって育って合体木となった可能性がある。年代測定を行ったときにも、ウロの中の朽ちた部分にとりわけ古い年代が出たこともあり、既に朽ちたさらに古い木があり、そこからの新木の合体木である可能性が強い。
なお現在までに確認された最古の木は「大王杉」で、やはり放射性炭素年代測定法で樹齢3000年以上とされる。
歴史 thumb|屋久島の縄文杉登山口へと続くトロッコ軌道 屋久島が初めて文献に出現するのは、中国の歴史書『隋書』大業3年（607年）、煬帝の代に「夷邪久国」の記述が見えるのが最初である、この「夷邪久」は屋久島を指す説と、南島全般（すなわち種子島・屋久島より南方）を指す説とがある。
『日本書紀』では推古天皇24年（616年）に掖久・夜勾・掖玖の人30人がやってきて、日本に永住したという記事が見られ、舒明天皇元年（629年）には大和朝廷から掖玖に使が派遣されたという記載がある。『日本書紀』で、掖玖（ヤク）を、特定の島である屋久島を指すような言葉として初めて区別するような記載が行われたのは、天武天皇11年（682年）に「多禰人・掖玖人・阿麻彌人(奄美人)それぞれ禄を賜った」という記載からである。
『続日本紀』には、文武3年（699年）に多褹・掖玖・菴美・度感から朝廷に来貢があり位階を授けたと記載がある。また同書には、種子島とともに多禰国との記述があり、大宝2年（702年）8月1日条に「薩摩と多褹が化を隔てて命に逆らう。是に於いて兵を発して征討し、戸を校して吏を置けり」とあり、薩摩国と多禰国が成立する。これ以後、大和朝廷は令制国として一国に準ずる多禰国に国司（嶋司）を派遣する。
多禰国からの税収はとても小さかったが、南島（南西諸島）との交流や、隼人の平定、遣唐使の派遣のため格は中国として扱われていた。実際、天平勝宝5年（753年）12月7日に鑑真、大伴古麻呂、吉備真備らを乗せた遣唐使船の第二船、第三船が屋久島に帰国し、鑑真が来日したは場所は屋久島である。屋久島で11日間の1日の滞在を経て第二船は12月18日に大宰府に向けて出港、20日に秋目、26日に大宰府に到着する。734年（種子島）と753年（屋久島）の二度、遣唐使が多禰国に帰国した。『日本書紀』では7か所に多禰、『続日本紀』では21か所に「多禰」または「多褹」と記述されている）
しかし、島民を兵として徴用しても動員が難しく、年貢として取り立ても少ないことから、天長元年（824年）10月1日に多禰嶋司を廃止し、能満郡・熊毛郡・馭謨郡・益救郡の四郡を熊毛郡・馭謨郡の二郡に再編して大隅国に編入した。
1203年に鎌倉幕府から種子島氏に種子島を初めとした南西諸島が与えられ、屋久島も種子島氏の支配下に置かれることになる。1542年に大隅の禰寝氏が種子島氏の悪政を正すとの名目で屋久島に襲来し、島を占拠。宮之浦に城ケ平城を築城。1544年に種子島氏は屋久島を奪還すべく、城を攻める。禰寝氏は敗退し、再び島は種子島氏の支配下になる。このとき初めて火縄銃が実戦で使用されたと伝えられている宮之浦城ケ平城跡。
1595年、種子島久時のとき、太閤検地に伴う所替えで薩摩国知覧に移され、屋久島は島津家の直轄地となる。また豊臣秀吉が京都方広寺の大仏殿建立用材調達を全国の大名に命じ、島津家にも用材の献上を命じられている。一説にはウィルソン株はその時に切り出された屋久杉の切り株ともいわれている。
江戸時代は薩摩藩の支配下に置かれる。島津光久に招かれ薩摩藩に仕えていた僧侶であり儒学者でもあり、屋久島の安房の生まれであった泊如竹は、島民の困窮を目にし、島民のため屋久杉伐採を藩に願い出る。また屋久杉伐採の指導などを行い島の経済復興に尽力した。このため屋久聖人と呼ばれている。今でも泊如竹の命日である旧暦5月25日に如竹踊りが如竹神社で行われている。
米作、畑作に不向きな屋久島の年貢は、屋久杉を伐採加工した平木で納めることになった。男子は年一人当り平木六束（一束は百枚で600枚）を納めることとなっていた屋久島の歴史。
1708年にキリスト教布教のため、鎖国下の日本に潜入しようとしたジョヴァンニ・バッティスタ・シドッティが、屋久島に上陸している。
明治時代に入り、地租改正により島の山林のほとんどが国有地に編入された。1891年（明治24年）には国有林監視所が設置され、盗伐の取り締まりが強化されたことをきっかけに、1904年（明治37年）には島民が国を相手取って訴訟を起こすに至った。この訴訟は16年に及ぶ長期の係争となったが、関係書類から元々は薩摩藩有であったことが確認されるとして島民側の敗訴となった。だが、この判決には批判が多く、国会議員やマスコミからの追及が高まった。世論を重視した国は1921年（大正10年）に屋久島の国有林を島民一般のためにのみ使用することを旨とする『屋久島国有林経営の大綱』を定めた。この処置は島民から大いに喜ばれ、『屋久島憲法』と呼ばれた。
1922年（大正11年）からは本格的なインフラ整備が開始された。1924年（大正13年）、スギ原始林が天然記念物に指定された。
世界遺産
登録への経緯 1992年3月13日に世界遺産条約の国会提出が閣議決定され、6月30日に条約受諾書をユネスコへ送付した。それを受けて、1992年10月1日、屋久島が世界遺産委員会へ推薦された。1993年12月11日、コロンビアのカルタヘナで開催された世界遺産委員会で、世界遺産リストに登録された。姫路城・法隆寺・白神山地とともに日本初である。
登録当時、ユネスコ世界遺産センターのドロステ所長は「自然遺産としての屋久島の価値は、多くの人たちが暮らしていながら、すぐれた自然が残されていることにある。」と語っている。
世界遺産登録基準
屋久島憲章 屋久町と上屋久町の両町議会は、世界遺産登録を控えた1993年にその保全を目的として屋久島憲章を制定した。両町が合併して屋久島町となった2007年10月1日、同憲章を改めて決議第一号とした。屋久島の自然環境保護を第一とし、自然環境との共生による島の将来への指針を示している。
登録後の影響（オーバーユース問題等） 世界遺産登録後の観光客の増大によるゴミ増加、山岳トイレ、登山道とアクセス道路、山小屋の整備の遅れ、観光ガイドの質の低さなどが指摘されている。
特に縄文杉見学の登山客は激増した。2010年の同コースの登山客は約9万人で、それまでの10年間で3倍近くに増えた。一方で登山客の増加は、登山道の劣化、ゴミ処理、山岳トイレ、ガイドの資質等々の地域社会的問題を招いた。
屎尿処理の問題 屎尿処理は当初現地に埋設していたが、悪臭や水源汚染の問題が深刻化してきた。
2008年からトイレ利用者から山岳部保全募金（一人一口 500 円）を募るなどして、人力で屎尿搬出を始めた。しかし募金率は40%程度と低く、町の予算から拠出していた山岳トイレの屎尿処理費が約530万円の単年度赤字になるなど、町財政の負担になった「屋久島町が入島料検討へ 世界遺産の保全目的」『西日本新聞』2012年1月26日internet archive waybackmachine世界遺産の屋久島、入島料を検討 環境保全財源に 日本経済新聞 2012年1月26日。
実際の金額としては山岳部保全募金額は2014年度で約2075万円にものぼったが（屎尿搬出以外にも利用されているため）その財源を使い切った場合はバケツに詰めて留置されることが常態化していた。屋久島山岳部環境保全協力金2017年より協力金が導入され、山岳部保全基金から移行。収受状況（令和3年3月末）によれば、1リットルあたり約1527円（搬出量は計8460リットル）の搬出費となっていた。2016年度末には不足分を他の基金（屋久島町だいすき基金など）で補うこともあった。
また、並行して環境省が主導（2009年試験運用、2010年より開始）して屋久島観光協会が携帯トイレ販売事業を行っており、2018年の販売実績は約478万円（二個入り6777個、一個入り943個）となっている。人力による屎尿搬出の経費負担の削減を大きな目的としており、携帯トイレの回収ボックスを登山口などに設置、その回収費用は年間数十万円で、その費用にあてるため屋久島観光協会が売り上げの一部を山岳部募金に還流している。携帯トイレブースの管理維持費は山岳部が負担、最終的な携帯トイレの廃棄処理（特に大便）には使用を中止していた町の焼却炉を再稼働させて対応している。
バイオマストイレ（2007年12月に阪急交通社、2009年に小林製薬がそれぞれ寄贈、設置から数年のコストも寄贈者が負担）をはじめ、恒久トイレ（浄循環式水洗トイレや土壌処理式のトイレ）の導入も試みているが、故障により修繕維持費がかさむことが問題になっていた。
2017年に山岳部環境保全協力金が制定されるまでの屎尿搬出費の推移(屋久島町公表)は表の通り。 +屋久島山岳部し尿搬出の推移年度搬出費用山岳部保全基金の積立金額（募金など）山岳部保全基金の年度末残高参考）入込者数等関連トピック2007 -0406387バイオマストイレ寄贈20083904435118990007995000385987保全募金の開始2009「ふるさと雇用再生特別基金事業」を活用して7月~3月分に固定額の支出が加算されている。280575002432600024429000327861バイオマストイレ寄贈201017359964170790006812000332219携帯トイレ販売事業開始201117481328200670006898000319736入島料の検討へ201219777936198320003936000327861201315861486210920005983000333219協力金の採用を決定201418172915207510003006000319736201510257223147570002290000305201201614648195211730009100000299744201720964428山岳部環境保全基金へ移行山岳部環境保全基金へ移行284684協力金の開始
屎尿処理問題に関する今後の方針 搬出と設備維持費用の増大に観光客の減少が追い討ちをかけており、令和元年に定めた「屋久島町第二次振興計画」においては恒久トイレ（登山道のバイオマストイレや汲み取り式トイレ）から携帯トイレ（と仮設トイレブース）への移行方針が検討されている。また携帯トイレの最終処理に必要不可欠なゴミ焼却施設の新設も計画されている。もともと屋久島は廃棄物処理に再生エネルギーである水力発電も活用した炭化・電気溶融施設を有していたが老朽化し一部故障したままで、目標とするゼロエミッションから後退して、大量のビニール製携帯トイレ処分と通常型の焼却施設を新設することとなる。
入山制限の検討 このような事態を受け、2011年6月に屋久島町町長の日高十七郎がエコツーリズム全体構想の骨格をなす縄文杉コースの利用制限、永田浜への立ち入り制限などを規定した町条例案を町議会に提出した。具体的には、縄文杉への日帰り登山客を1日360人、宿泊客60人に制限するものであった。しかし6月21日本会議に先がけて行われた特別委員会で出席議員全員の反対で否決された。否決前、「条例案に反対するよう求める」という屋久島観光協会ガイド部会の文書が全町議に送られていた「危機にある遺産：屋久島からの報告(1) 1日360人制限案、減収不安で反対」『毎日新聞』西部版朝刊2011年12月24日。この動きを踏まえて、「屋久島は危機遺産になったほうがいい」という日本山岳会自然保護委員会世界自然遺産プロジェクトの意見表明まで出た。
また林野庁、環境省及び文化庁は、登山者の増加やヤクシカの増加により、生態系や自然景観に影響を及ぼす恐れが出てきたことから管理計画の見直し、新しい計画案への意見公募を2012年1月27日〜2月26日に行った『屋久島世界遺産地域管理計画(案)に対する意見公募について』林野庁 waybackmachineによるアーカイブ。その結果を受けて、同年10月1日、林野庁・環境省・文化庁と鹿児島県及び屋久島町は新たな屋久島世界遺産地域管理計画を策定し発表した。その中で、ヤクシカの増加については特定鳥獣保護管理計画及び生態系維持回復事業計画を踏まえた個体数調整及び生態系の維持回復の方針を示し、登山客の増加については登山道や地域毎に利用方針を定めた上で利用の適正化（主に分散化）を図るとともに、エコツーリズムの推進方針を示している。
協力金の徴収へ 2011年10月30日に行われた町長選挙で当選した荒木耕治は、当選後、入島料の導入に言及。11月13日に「自然資源の保護が、あらゆる政策に優先する」と所信表明。島の環境保全を目的に来島者から「入島料」を徴収する方針を決めた。早ければ2013年度に導入を目指すとした屋久島「入島料」 環境保護に知恵を絞ろう『西日本新聞』朝刊2012年2月10日社説。しかし、2013年中の「屋久島町入島税等検討会議」で『税の公平原則によって、課税対象、金額等に制約が生じ、賦課徴収コストが大きくなり現時点での導入は難しい。』との認識を共有し入島料（税）ではなく、2014年の同会議にて受益者負担を求める仕組みとして「入山協力金」の採用が確認された。