Хаплогрупата C — главна хаплогрупа на Y хромозомот, дефинирана од уникатниот полиморфистички настан M130/RPS4Y 711, P184, P255 и P260, кои се сите SNP мутации. Таа е една од двете основни гранки на Хаплогрупата CF заедно со Хаплогрупата F. Хаплогрупата C се наоѓа во древните населенија на секој континент освен Африка и е доминантна хаплогрупа на Y-днк меѓу мажите кои припаѓаат на многу народи домородни во Источна Азија, Средна Азија, Сибир, Северна Америка и Австралија, како и некои населенија во Европа, Левант, а подоцна и Јапонија.

Хаплогрупата исто така се среќава со умерена до ниска честота кај многу денешни населенија во Југоисточна Азија, Јужна Азија и Југозападна Азија.

Покрај базалната парагрупа C*, оваа хаплогрупа денес има две големи гранки: C1 (F3393/Z1426; претходно CxC3, т.е. стара C1, стара C2, стара C4, стара C5 и стара C6) и C2 (M217; поранешна C3).

Потекло Хаплогрупата C-M130 најверојатно потекнува од егзодусот на современите луѓе надвор од Африка, кој се проширил на исток од Југозападна Азија и постепено ја колонизирал Јужна Азија, Источна Азија и Океанија. Истражувањата се поделени за тоа како се случила оваа преселба; повеќето проучувања го поддржуваат северниот пат низ Сибир, додека други ја поддржуваат хипотезата за јужниот пат, во која носителите на хаплогрупата C мигрирале по должината на бреговите на Индија и Југоисточна Азија за да стигнат до Кина.

Се смета дека се појавила хаплогрупата C-M130 набргу откако SNP мутацијата M168 се случила за прв пат, со што настанала современата хаплогрупа CT, од која произлегла хаплогрупата CF, а потоа и хаплогрупата C. Ова веројатно било пред најмалку 60.000 години.

Хаплогрупата C-M130 ги достигнува своите највисоки честоти помеѓу домородните населенија на Казахстан, Монголија, рускиот Далечен Исток, Полинезија, одредени групи од Австралија и со умерена честота кај луѓето од Кореја и Манчу. Затоа се претпоставува дека хаплогрупата C-M130 или настанала или поминала низ својот најдолг период на еволуција во поширокиот регион на Средна Азија или во регионите на Југоисточна Азија. Се претпоставува дека нејзиното ширење во Источна Азија започнало пред околу 40.000 години.

Се верува дека мажите што го носат C-M130 мигрирале во Америка пред околу 6.000-8.000 години, и биле пренесени од народите што зборуваат на-дене јазици во северозападниот тихоокеански брег на Северна Америка.

Азија е исто така областа во која е концентрирана хаплогрупата D-M174. Сепак, D-M174 е поблиску поврзана со хаплогрупата Е отколку со C-M130 и географските распределби на хаплогрупите C-M130 и D-M174 се целосно и сосема различни, при што различни подтипови на хаплогрупата C-M130 се наоѓаат на висока честота меѓу современите Казахстанци и Монголци, како и кај некои домородни народи на Америка, Манџури. Исто така, се среќава со средна честота кај Корејците, домородните жители на рускиот Далечен Исток, одредени групи Абориџини Австралијци и на умерени честоти на други места низ Азија и Океанија. Носителите на Хаплогрупата C меѓу подоцнежните Џомони од Јапонија и одредени Европејци од палеолитот и неолитот ги носеле C1a, C1b и C1a2. Со оглед на тоа што хаплогрупата D се наоѓа на високи честоти само кај Тибетанците, Јапонците и жителите на Андаманските Острови и не е пронајдена ниту во Индија, ниту кај домородците на Америка или Океанија.

Според Сакитани и соработниците, хаплогрупата C-M130 потекнува од Средна Азија и од таму се проширила во другите делови на Евроазија и во делови на Австралија. Се претпоставува дека C-M130 била пронајдена во источноевроазиски ловци-собирачи, како и во древни примероци од Источна и Југоисточна Азија и Европа.

Структура C* (M130/Page51/RPS4Y711, M216)

C1 (F3393) C1a (CTS11043) C1a1 (M8) C1a1a (P121) C1a1a1 (CTS9336) C1a1a1a (CTS6678) Јапонија, Јужна Кореја (Сеул) C1a1a1b (Z1356) Јапонија C1a1a2 (Z45460) Кина (Лаонинг) C1a2 (претходно C6) - (V20) C1a2a (V182) C1a2a1 (V222) C1a2a2 (Z29329) C1a2b (Z38888) Украина C1b (F1370) C1b1 (K281) C1b1a (B66/Z16458) C1b1a1 (претходно C5) - (M356) C1b1a2 (B65) C1b2 (B477/Z31885) C1b2a (претходно C2) - (M38) C1b2a1 (M208) C1b2a1a (P33) C1b2a1b (P54) C1b2b (претходно C4) - (M347) C1b2b1 (M210) C2 (претходно C3) - (M217) C2a (M93) C2b (L1373/F1396) C2b1 C2b1a C2b1a1 C2b1a1a (P39) C2b1a2 (претходно C3c) - (M48) C2c (C-F1067) C2c1 (F2613/Z1338) C2c1a (Z1300) C2c1a1 C2c1a1a C2c1a1a1 (M407) Други, нетаксономизирани поткладови : C-P343 : надвор од C1a1 (M8), C1b2a (M38), C1b1a1 (претходно C5; M356), C1b2b (претходно C4; M347) и C2 (ex-C3; M217), но неговата врска со другите гранки сè уште не е тестиран. C-P55 : надвор од C1b2a (M38), но неговата врска со другите гранки сè уште не е потврдена, и;

(Горената филогенетска структура на поткладовите на хаплогрупата C-M130 се базира на дрвото ISOGG 2015, дрвото YCC 2008 и последователните објавени истражувања.ISOGG, 2015 "Y-DNA Haplogroup C and its Subclades – 2015" (15 September 2015).)

Распространетост мини|Проектирана просторна честотна распределба за хаплогрупата C во Источна Азија. Распространетоста на хаплогрупата C-M130 е генерално ограничена на населенијата на Сибир, делови од Источна Азија, Океанија и Америка. Поради огромната старост на хаплогрупата C, имало време да се акумулира бројни секундарни мутации и многу регионално важни подгранки на хаплогрупата C-M130 биле идентификувани.

До 46% од Абориџините од Австралија носеле базален C* (C-M130*), C1b2b* (C-M347*) или C1b2b1 (C-M210), пред контактот со Европејците и значителна ипреселба, според истражување од 2015 година од Нагле и неговите соработници. Односно, 20,0% од Y-хромозомите на 657 современи поединци, пред 56% од тие примероци да бидат исклучени како „недомородни“. C-M130* очигледно го носеле до 2,7% од Абориџините мажи пред колонизацијата; 43% носеле C-M347, кој не бил пронајден надвор од Австралија. Другите хаплогрупи на Абориџините Австралијци се слични на Папуанците и другите Негритоси (хаплогрупа S-M230 и M-P25).

Ниските нивоа на C-M130* ги носат мажите:

од Индискиот Потконтинент, Шри Ланка и Југоисточна Азија, и; во Европа меѓу машките со презиме Лах со потекло од Каталонија, Шпанија (но не и мажи со исто презиме од други области).Cognoms Catalans, n.d., Resultat (15 September 2015). (The Cognoms Catalans project, which researches "genetic surnames" in Catalonia, Valencia and the Balearic Islands, is based at Universitat Pompeu Fabra, Barcelona.)

Базалниот C1a* (CTS11043) бил пронајден кај Европејците од горниот палеолит (Ориначка култура), GoyetQ116-1 и Pestera Muerii2.

C1b бил идентификуван во праисториски остатоци, кои датираат од 34.000 години п.с., пронајдени во Русија и познати како „Костенки 14“.

Хаплогрупата C2 (M217) - најбројната и најраспространета лоза C - некогаш се верувало дека потекнува од Средна Азија, се проширила од таму во Северна Азија и Америка, додека друга теорија потекнува од Источна Азија. C-M217 се протега надолжно од Средна Европа и Турција, до народот Вају од Колумбија и Венецуела, и географски од атабасканските народи од Алјаска до Виетнам до Малајскиот Архипелаг. Пронајден во ниски концентрации во Источна Европа, каде што можеби е наследство од инвазиите/преселбите на Хуните, Турците и/или Монголите во текот на средниот век. Се среќава на особено високи честоти во Бурјатите, Даурите, Хазарите, Ителмените, Калмиците, Коријаците, Манџусите, Монголците, Орокените и Сибесите, со умерена распространетост меѓу другите тунгуски народи, Корејците, Ајните, Нивхите, Кинезите, Узбеците, Алтајците, Туџија, Хани и Хуи. Највисоките честоти на хаплогрупата C-M217 се наоѓаат меѓу населенијата на Монголија и далечниот руски исток, каде што е модална хаплогрупа. Хаплогрупата C-M217 е единствената сорта на хаплогрупата C-M130 што се среќава кај Индијанците, меѓу кои ја достигнува својата најголема честота кај населенијата на На-Дене.

Другите поткладови се специфични за одредени населенија, во ограничен географски опсег; дури и таму каде што се наоѓаат овие други гранки, тие имаат тенденција да се појавуваат во многу понискочестотна, мала компонента на палетата на разновидност на Y-хромозомите во тие територии:

C-M8 (C1a1), сега се наоѓа редовно само со мала честота (приближно 5%; опсег 3,3% - 10% од сите примероци) во Јапонија. Исто така, било откриено во академското проучување кај еден поединец на островот Чеџу и во комерцијални тестирања кај едно лице кое пријавило потекло од покраината Лаонинг во Кина и едно лице кое пријавило потекло од Сеул. Древниот народ Џомон имал честота од околу 30% од C1a1. C-V20 (C1a2; претходно C6) се наоѓа на ниски честоти кај Европејците. Остатоците од пред 7.000 години ги имал ловец-собирач од Ла Брања (современа Астурија, Шпанија), а C1a2 исто така била присутна во Унгарија во исто времеhttp://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/02/10/013433.full.pdf . Во 2016 година, со ова биле пронајдени остатоци од ловец-собирач стар 35.000 години од пештерите Гоје (Намур, Белгија) и 30.000 години стари останки на ловец-собирач од Долни Вестонице (Вестонице16, Моравија, Чешка). C-B66/Z16458 (C1b1a) се наоѓа на ниски честоти во Јужна Азија, Средна Азија и Југозападна Азија. C-M356 (C1b1a1; претходно C5) е откриена со мала честота во примероци од Индија, Непал, Пакистан, Авганистан, Арабија и северна Кина. C-M38 (C1b2a; претходно C2), меѓу некои локални населенија во Индонезија, Меланезија (особено Нова Гвинеја), Микронезија и некои острови на Полинезија, C-M38 стана модална хаплогрупа, веројатно поради сериозните ефекти на основачот и генетскиот нанос C-P33 (C1b2a1a): пронајден на високи честоти кај полинезиските мажи. C-P55 (C1b3) се наоѓа на ниска честота во висорамнините на Нова Гвинеја. C-M93 (C2a) се наоѓа спорадично кај Јапонците. C-L1373/F1396 (C2b) е идентификуван во Средна Азија. C-P39 (C2b1a1a) се наоѓа кај неколку домородни народи во Северна Америка, вклучително и некои населенија кои зборуваат на-дене јазици. C-M48 (C2b1b; претходно C3c)се среќава на високи честоти кај северните тунгуски народи, Казахстанци, Оирати, Калмици, Монголци, Јукагири, Нивки, Корјаци, Ителмени и Удегеи, со умерена распротранетост меѓу јужните тунгуски народи, бурјати, тувини, јакути, чуки, киргистанци, Узбеци, Каракалпаци и Таџикинци. C-F2613/Z1338 (C2e): Средна Азија и Источна Азија C-M407 (C2e1a1a) е пронајдена со висока честота меѓу Баргутите, Бурјатите, Сојотите и Камниганите, умерена честота кај другите Монголи и Калмици и ниска честота на ерменски, баи, камбоџански, евенки, хански кинески, јапонски, казахстански, корејски, манчу, ујгурско и јакутско население. C-P343 се јавува на висока честота кај мажите од Лембата (17,4% од 92 примероци), со пониски честоти во Флорес, Пантар и Тимор. P343 е надвор од C1a1 (M8), C1b2a (M38), C2 (ex-C3; M217), C1b2b (претходно C4; M347) или C1b1a1 (претходно C5; M356), но неговата врска со другите гранки сè уште не е тестирана. Неодредени примероци на C-M130, кои можеби припаѓаат на една од горенаведените поткладови, вклучуваат: Кајзер и сор. (2006) пронашле C-M130(xM38, 390,1del, M217) во 10,3% (4/39) од примерок од етничките малцински групи од Филипините, 10,0% (6/60) од примерокот од Арнем Ланд, 6,5% (2/31) од примерокот од Нуса Тенгара, 5,3% (3/57) од примерокот од Суматра, 3,0% (1/33) од примерокот од брегот на Папуа Нова Гвинеја, 2,9% (1/34) од примерок од Молуките, 1,9% (1/53) од примерокот од Јава и 0,9% (1/107) од примерокот од Фиџи. C-RPS4Y (сега C-RPS4Y711) (xM38) Y-DNA е доста честа кај населенијата на индонезиската покраина Источна Нуса Тенгара и независниот Источен Тимор: 13/31 = 41,9% Лембата, 16/71 = 22,5% Флорес, 5 /43 = 11,6% Солор, 10/96 = 10,4% Адонара, 3/39 = 7,7% Источен Тимор, 1/26 = 3,8% Алор, 1/38 = 2,6% Пантар. Сите поединци C-RPS4Y(xM38) освен синглот од Алор биле опишани како австронезиски говорници.