De tapte episodene av Doctor Who er episodene av denne britiske TV-serien som det ikke finnes noen kjente eksemplarer av i dag. Det finnes dog enkeltbilder av de fleste episodene. De ble slettet av BBC i 1960- og 1970-årene av blant annet økonomiske og plassbesparende grunner. Det er derfor per i dag 108 av totalt 253 episoder fra seriens seks første sesonger som offisielt ikke finnes. Dette tallet har vært høyere, men flere kopier har dukket opp fra forskjellige kilder, hovedsakelig andre kringkastere.

Doctor Who er ikke den eneste britiske serien med tapte episoder. Flere tusen timer med programmer fra alle sjangre ble slettet eller kastet frem til 1978 da BBC forandret på sin arkiveringspolicy. Blant seriene som mangler episoder finner man Dad's Army, Z-Cars, The Wednesday Play, Steptoe and Son og Not Only... But Also. BBC var heller ikke den eneste kringkasteren som gjorde dette. ITV slettet blant annet episoder av serien The Avengers, som forøvrig ble startet av en av Doctor Whos skapere, Sydney Newman. Til forskjell fra disse andre seriene er Doctor Who unik fordi lydsporene til alle de tapte episodene eksisterer. De ble tatt opp av seere da episodene opprinnelig ble kringkastet. Alle episodene fra 1970-årene eksisterer også, noe som ikke er tilfelle med flere andre serier.

Forsøk på å finne flere episoder av serien pågår fortsatt. Disse gjøres både av BBC og fans av serien. Omfattende restaurering av flere episoder fra 1960- og 1970-årene er blitt gjort for utgivelse på VHS og, fra begynnelsen av 2000-årene og utover, også på DVD. Lydsporene fra de tapte episodene er blitt utgitt på kassett og CD.

Bakgrunn I perioden 1967–1978 ble store mengder materiale lagret i BBCs arkiver enten kastet eller slettet for å gjøre plass til nye programmer. Dette ble gjort av flere grunner. En av dem var at skuespillerforeningen Equity og andre arbeiderforeninger begrenset antall ganger et program kunne vises i reprise. Disse programmene kunne også vises bare i et begrenset tidsrom. Grunnen til dette var at arbeiderforeningene var redde for at kanalene ville fylle sendeplanen med repriser og det ville føre til færre produksjoner og færre jobber. En utilsiktet bieffekt av denne holdningen var at mange programmer ble kastet etter at rettighetene til å vise dem gikk ut fordi de ble ansett som ubrukelige.

De fleste episodene av Doctor Who ble laget på Quadruplex-bånd for kringkasting og deretter spilt over på 16 mm-film av BBC Enterprises for salg til andre kringkastere. Enterprises brukte 16 mm for salg fordi det var mye billigere å kjøpe og enklere å transportere enn videobånd. En annen grunn var at mens forskjellige land hadde forskjellige videostandarder, var film et universelt medium. BBC hadde ikke et sentralt arkiv på denne tiden. BBC Film Library tok vare på programmer etter at de ble spilt over på film mens Engineering Department var ansvarlig for å lagre videobåndene. BBC Enterprises behold bare kopier av programmer som de så på som salgbare. De hadde også liten lagringsplass og lagret videobånd overalt hvor de kunne finne plass i Villiers House.

Engineering Department hadde ikke noe mandat som sa de skulle arkivere programmene de lagret, men vanligvis ble ikke programmene slettet eller kastet før den relevante produksjonsavdelingen og/eller BBC Enterprises ga beskjed om at de ikke hadde noe videre bruk for programmet. De første videobåndene med Doctor Who-episoder som ble slettet inneholdt historien The Highlanders. Disse ble slettet 9. mars 1967, kort tid etter at de ble kringkastet. Videre sletting og kasting av videobånd med Doctor Who-episoder fortsatte inn i 1970-årene. Til slutt var alle båndene med de 253 episodene fra 1960-årene slettet eller kastet. De siste båndene ble slettet i slutten av 1974 og inneholdt historien Fury from the Deep.

Til tross for dette hadde BBC Enterprises frem til 1972 nesten alle episodene på 16 mm-film. Fra ca. 1973 og frem til 1978 kvittet BBC Enterprises seg med mesteparten av sitt eldre materiale, inkludert mange episoder av Doctor Who, frem til at plateprodusenten Ian Levine, som er en fan av serien, blandet seg inn. Enterprises' episoder ble vanligvis kastet fordi rettighetene til å vise dem hadde gått ut. Mange kringkastere verden over skiftet også fra svart-hvitt til fargesendinger i denne perioden og materialet i svart-hvitt ble ikke lenger sett på som lønnsomt.

BBC Film Library hadde ikke noe ansvar for å lagre programmer som ikke ble laget på film og det var en uenighet med BBC Enterprises over hvem som hadde ansvarer for å lagre programmer på videobånd. Dette førte til at enorme mengder med materiale av eldre svart-hvittprogrammer ble slettet i BBCs forskjellige arkiv. Mens mange programmer ble slettet på denne måten er de tapte Doctor Who-episodene det kanskje mest kjente eksemplet på hvordan mangelen på en konsekvent arkiveringspolicy kan ha langsiktige konsekvenser.

Mangelfullheten varierer og den er konsentrert på sesong 3–5. Noen historier mangler bare en episode mens andre mangler alle. Fra sesong 4 er det ingen komplette historier og fra sesong 5 er bare The Tomb of the Cybermen komplett. Den eksisterer fordi alle fire episodene ble returnert fra Hongkong. Alle historiene med den tredje Doktoren (Jon Pertwee, sesong 7–11) er komplette, men noen finnes bare i svart-hvitt eller som videobånd i NTSC-format. De første episodene av Invasion of the Dinosaurs og Death to the Daleks er de nyeste episodene som ble slettet. Sistnevnte ble returnert i NTSC-format og senere i originalt PAL-format på et bånd fra Dubai.

I noen få år var episode en av Invasion of the Dinosaurs den eneste tapte episoden med Pertwee som Doktoren, før en svart-hvitt-kopi på 16 mm-film ble returnert til BBC i 1983 da den ble funnet hos en filmsamler. Alle episodene fra og med Death to the Daleks episode to finnes på original mastertape unntatt slutten av episode tre av The Deadly Assassin (1976). Denne biten ble fjernet etter en klage fra Mary Whitehouse, som var daværende president av National Viewers' and Listeners' Association. Episoden ble senere restaurert ved å bruke hjemmevideoopptak av den opprinnelige kringkastingen.

Det ble en slutt på sletting av programmer i 1978 da muligheten for å selge dem på video begynte å bli mulig. I tillegg skulle programmer beholdes av historiske og kulturelle grunner. BBC Film Library ble omgjort til Film & Videotape Library og det skulle inneholde programmer på begge media. Film Library hadde da 47 episoder fra de seks første sesongene av Doctor Who. De hadde tidligere hatt 53 episoder, men seks av dem hadde enten blitt kastet eller forsvunnet. Etter at episodene som fantes hos Enterprises ble overført til arkivet, var det totalt 152 episoder som manglet hos BBC. Etter flere forsøk på å finne episoder, ble dette antallet redusert til 108.

Den mest ettertraktede tapte episoden er episode fire av The Tenth Planet, som slutter med at den første Doktoren (William Hartnell) regenererer til den andre Doktoren (Patrick Troughton). En del av denne scenen finnes fordi den ble brukt i en episode av Blue Peter fra 1973, som ikke ble kastet.

I forhold til andre BBC-serier fra 1960-årene har Doctor Who relativt mange episoder som fremdeles finnes. 145 av totalt 253 episoder fra disse årene finnes fremdeles. Dette er stort sett fordi episodene ble solgt til utlandet og man ser også dette på hvilke episoder som ble funnet. Sesong en og to er de sesongene det ble solgt flest kopier av og de mangler da også bare henholdsvis ni og to episoder. Mesteparten av disse episodene overlevde mest sannsynlig på grunn av at en del ble solgt til Algerie i 1973. De returnerte deretter episodene til BBC kort tid før slettingen av programmer opphørte. Sesong fire og fem ble solgt til færre land og har derfor bare en komplett historie tilsammen.

Av alle seriene vist av BBC i 1960-årene, som er av en viss lengde, er det bare Steptoe and Son som har prosentvis flere overlevende episoder. Alle episodene av denne serien eksisterer. Noen finnes dog bare som hjemmevideoopptak tatt opp av skaperne av programmet. Andre programmer har få eller ingen eksisterende episoder. For eksempel finnes det ingen av de totalt 147 episodene av såpeoperaen United!, som ble laget i perioden 1965–1967. Doctor Whos popularitet har også hjulpet til med å finne episoder av mindre populære serier.

Doctor Who er også nesten unik fordi alle episodene fra 1970-årene eksisterer, mens andre serier som Z-Cars og Dixon of Dock Green har tapte episoder som ble laget så sent som 1975.

Episodejakt Etter at arkivet ble gjennomgått i 1978 har flere episoder blitt returnert fra diverse kilder. Forespørsler ble sendt til utenlandske kringkastere som hadde vist serien (især Australia og afrikanske land som Nigeria). Flere av disse hadde fremdeles episoder som ble returnert til arkivet. Tomb of the Cybermen ble returnert på denne måten fra en kringkaster i Hongkong i 1992.

Noen av episodene som ble returnert hadde blitt sensurert i 1960-årene i Australia og New Zealand fordi de var for voldelige eller skumle for de yngre seerne. Disse episodene var derfor ikke komplette. I oktober 1996 fant Doctor Who-fans Damian Shanahan og Ellen Parry en rekke av disse klippene i arkivene til den australske staten. Klippene hadde blitt sendt dit av ABC som bevis på at episodene hadde blitt sensurert. I 2002 fant Graham Howard i New Zealand også slike klipp fra historiene The Wheel in Space og The Web of Fear.

Flere episoder har også blitt returnert av private filmsamlere som har fått tak i episodene på forskjellige måter. For eksempel ble 16 mm-filmopptak av episode to av The Evil of the Daleks og episode tre av The Faceless Ones returnert til BBC av filmsamleren Gordon Hendry. Disse episodene hadde blitt kjøpt av Hendry for £8 stykket på et loppemarked i desember 1983. Han kjøpte episodene fordi han hadde sett på serien da han var yngre og han var ikke klar over hvor sjeldne de var.

Den historien som det var minst sannsynlig at de ville få tilbake episoder fra var The Daleks' Master Plan, som ikke ble solgt til utlandet. Australia fikk ett sett visningskopier av alle episodene utenom episode sju, som var en jule-episode, for å se om de skulle kjøpe den. De valgte å ikke gjøre det. Hva som skjedde med disse kopiene er uklart siden det ikke finnes noen dokumenter på om de ble beholdt av ABC eller sendt tilbake til BBC.

Tre episoder fra denne historien ble funnet på 16 mm-film. To av dem dukket opp i en bygning tidligere eid av BBC og som hadde blitt kjøpt av en mormonsk menighet i begynnelsen av 1980-årene. De fant episodene i kjelleren mens de ryddet. Den tredje episoden ble returnert i 2004 av Francis Watson, som tidligere hadde jobbet som ingeniør hos BBC. Watson hadde tatt med seg episoden hjem i begynnelsen av 1970-årene. Han fant den mens han skulle kaste materiale ut fra et prosjektørtesterom hos BBCs Ealing Studios.

Kort etter at det ble sluttet med å kaste programmer, lagde BBC en oversikt over hva som ikke fantes i arkivet og sendte forespørsler til National Film and Television Archive, som drives av British Film Institute, for å se om de hadde noe. Disse forespørslene resulterte i at historiene The Dominators, The Krotons og The War Games ble returnert. Disse var alle på 16 mm-film bortsett fra episode tre av The Dominators som var på 35 mm. Episode fire og fem av denne historien hadde kommet fra utenlandske kringkastere og hadde blitt sensurert. Den ble senere restaurert ved å bruke filmkopier fra samlere og klippene funnet i Australia og New Zealand.