Nextstrain er et samarbeid mellom forskere i Seattle i USA og i Basel i Sveits som stiller til rådighet en samling av open-source-verktøy for visualisering av genetikken bak spredningen av virusutbrudd.
Målsettingen er å støtte opp om offentlige helsetiltak og -overvåking ved å styrke forståelsen av spredning og utvikling av patogener. Nextstrain-plattformen ble lansert i 2015. Koding utviklet av Nextstrain fjørst alment tilgjengelig via for eksempel github.com og data er tilgjengelig of synliggjort på brukervennlig måte på nettsiden.
Bruksområder Nextstrain-teamet tar sikte på å være oppdatert medgenomanalyser av de følgendepatogener:
Dengue Enterovirus D68 Fugleinfluensa Kusma Meslinger SARS-CoV-2 - der resultatene er blitt benyttet etter covid-19-pandemiens utbrudd i 2020. Sesonginfluensa Tuberkulose Vestafrikansk Ebola 2013-16 Vestnilfeber Zikafeber
Referanser
Eksterne lenker - Official Homepage
Kategori:Helseorganisasjoner Kategori:Vitenskapelige organisasjoner