Søndre Missingen naturreservat omfatter mesteparten av de to øyene Søndre Missingen og Ovnskjær samt de nære sjøområdene rundt, sørvest for Hankø i Fredrikstad kommune. Et område på begge sider av sundet mellom de to øyene, Missinghavna, er utelatt fra reservatet. Reservatet er for øvrig helt omsluttet av Rauerfjorden marine verneområde.
Berggrunnen består av den sjeldne bergarten rombeporfyrkonglomerat, og hører til Oslofeltet. Ellers er vernet begrunnet i øyenes verdi som hekkelokalitet for sjøfugl. I 2000 ble det regisrtert blant annet ti reir av den rødlistede arten makrellterne. Det finnes også en liten koloni av teist.
Vegetasjonen bærer preg av at det tidligere er satt ut kaniner på øya, som har formert seg kraftig.
Dyrelivet samt plantelivet på land og i sjø (inkludert tang og tare) er fredet mot skade og ødeleggelse. Det er forbudt å gjøre tiltak som endrer de naturgitte forholdene. I tiden 15. april til 15. juli er all ferdsel forbudt både til lands og til vanns i reservatet. Dette gjelder også all vannsport og dykking.
Referanser
Kategori: Verneområder opprettet i 1978 Kategori: Naturreservater i Fredrikstad