thumb|Palestino sob custódia israelense, 2010. O futuro dos palestinos detidos por Israel no contexto do conflito israelo-palestino é considerado central para o progresso no processo de paz israelo-palestino. As sentenças de prisão incluem acusações de terrorismo ou de pertencer a uma "organização terrorista ilegal", como o Hamas ou, antes dos Acordos de Oslo, a Organização para a Libertação da Palestina, mas, segundo alguns relatos, também a acusação de ativismo político, como erguer uma bandeira palestina.

Em abril de 2022, havia 4 450 prisioneiros de segurança palestinos em prisões israelenses – incluindo 160 crianças, 32 mulheres e mais de 1 000 "" (encarcerados por tempo indeterminado sem acusação). De acordo com a B'Tselem, desde o início da guerra de Gaza em 7 de outubro de 2023, os prisioneiros palestinos com cidadania israelense tiveram muitos de seus direitos revogados. A organização concluiu ainda que os abusos contra detidos são tão institucionalizados que as prisões devem ser chamadas de "campos de tortura".

Em dezembro de 2011, 4 772 prisioneiros de segurança palestinos cumpriam pena em prisões israelenses. Destes, 552 foram condenados a prisão perpétua. Em julho de 2024, havia 9 623 palestinos encarcerados por Israel, 4 781 em detenção administrativa, por supostas razões de segurança.:"Justo antes do início da guerra, o número total de palestinos encarcerados por Israel e classificados como 'prisioneiros de segurança' era 5 192, com cerca de 1 319 mantidos sem julgamento como 'detidos administrativos'. No início de julho de 2024, havia 9 623 palestinos encarcerados em prisões e instalações de detenção israelenses, 4 781 dos quais detidos sem julgamento, sem serem apresentados às alegações contra eles e sem acesso ao direito de defesa." "Welcome to Hell" B'Tselem, agosto de 2024, p. 6.

Visão geral thumb|Prisão de Damon, localizada na de . thumb|Prisão de Jalame (Centro de Detenção de Kishon), localizada na aldeia palestina despovoada de Al-Jalama, Haifa

O sistema de tribunais militares israelenses para os territórios ocupados, modelado parcialmente no sistema de tribunais militares britânicos estabelecido em 1937, foi criado em 1967 e tem sido chamado de peça central institucional da ocupação, dentro da qual os palestinos da Cisjordânia são tratados como "civis estrangeiros".

As medidas que aplica, combinando elementos de administração colonial e lei marcial, abrangem não apenas incidentes envolvendo recurso à violência, mas muitas outras atividades, protestos não violentos, declarações políticas e culturais e a forma como os palestinos podem se deslocar ou associar entre si.

Alguns dos aspectos problemáticos do sistema a que os prisioneiros palestinos estão submetidos são, segundo a professora de sociologia , a detenção prolongada de suspeitos em regime de incomunicabilidade, a obstrução do acesso do cliente ao seu advogado, o uso rotineiro de coerção em interrogatórios para obter confissões e a introdução de "provas secretas".

Centenas de milhares de palestinos foram julgados desde 1967. De acordo com , o total acumulado de palestinos aprisionados por Israel atingiu 650 000 em 2005. Destes, segundo (2011), dezenas de milhares foram submetidos a detenção administrativa. A taxa de encarceramento foi a mais alta do mundo durante a Primeira Intifada (1987–1992) – e suas taxas de condenação variaram de 90 a 95%, sendo na maior parte obtidas por acordos de confissão em 97% dos casos. De acordo com estatísticas da Cruz Vermelha, nas duas primeiras décadas da ocupação, de 1967 a 1987, um em cada três palestinos, cerca de 500 000, foi detido pelas forças israelenses, e em qualquer dia os tribunais estariam lotados de "crianças algemadas, mulheres implorando a soldados, pessoas ansiosas cercando advogados em busca de informações". Após os Acordos de Oslo, os tribunais em cidades palestinas foram transferidos para a , causando maiores dificuldades para advogados e familiares do réu acessarem os tribunais devido ao sistema de permissões.

A prática específica de detenção administrativa foi inicialmente introduzida pelos britânicos para subjugar palestinos, mas foi então cada vez mais aplicada para lidar com o comportamento de ativistas políticos judeus e suspeitos de pertencer a organização paramilitares judaicas, uma extensão vigorosamente contestada pelos colonos judeus na época e que advogados judeus em julho de 1936 argumentaram que deveria ser revogada. argumentou igualmente em 1948 que a prática aboliu o habeas corpus e levou ao encarceramento impróprio por parte dos britânicos de numerosos ativistas judeus. O Estado de Israel, ao obter a independência, no entanto, manteve esse corpo de regulamentos no do novo Estado. O artigo 111 nele permitia que comandantes militares prendessem e detivessem qualquer pessoa, sem razões públicas ou apresentação de acusações formais ou julgamento, por períodos de até um ano, embora exista uma disposição para estender indefinidamente qualquer pessoa detida sob a ordem. A Quarta Convenção de Genebra permite detenções, e com base nesses precedentes o FDI promulgou seu Artigo 87 da Order Concerning Security Instructions, e o aplicou a casos em que as regras de evidência dos tribunais israelenses não permitiriam a condenação do suspeito. Exemplos flagrantes da prática ocorreram no início da ocupação. Taisir al-Arouri, professor de Matemática da , foi preso à noite em 21 de abril de 1974 e libertado em 18 de janeiro de 1978, após sofrer 45 meses de prisão sem julgamento ou acusações, somente após a Anistia Internacional emitir um protesto público.

Escrevendo em 1978, Michael Goldstein chamou o sistema de detenção de "uma aberração da justiça criminal", mas temporária por natureza e ditada por uma situação de guerra em curso. Ele creditou Israel por se abster de torná-lo parte de seu sistema judicial, em oposição ao militar. Em um período de cinco meses da Primeira Intifada apenas, Israel colocou 1 900 palestinos sob ordem de detenção administrativa. Para a década de 2000 a 2009, estimou-se que, a qualquer momento, entre 600 e 1 000 palestinos eram submetidos anualmente à detenção administrativa. A Anistia Internacional afirmou que em 2017 as autoridades israelenses continuavam a adotar a detenção administrativa em vez de processo criminal para deter "centenas de palestinos, incluindo crianças, líderes da sociedade civil e trabalhadores de ONGs", sem acusação ou julgamento sob ordens renováveis, com base em informações retidas dos detidos e de seus advogados, e que os detidos administrativos somavam 441.

Palestinos notáveis que foram submetidos ao processo incluem e , ambos considerados pela Anistia Internacional como prisioneiro de consciência.

Número de prisioneiros De acordo com o , da Guerra dos Seis Dias (1967) à Primeira Intifada (1988), mais de 600 000 palestinos foram mantidos em prisões israelenses por uma semana ou mais. Rory McCarthy, correspondente do The Guardian em Jerusalém, estimou que um quinto da população foi em algum momento aprisionado desde 1967. Em 11 de dezembro de 2012, o gabinete do então primeiro-ministro Salam Fayyad afirmou que, desde 1967, 800 000 palestinos, ou cerca de 20% da população total e 40% da população masculina, haviam sido aprisionados por Israel em algum momento. Cerca de 100 000 haviam sido mantidos em detenção administrativa. Segundo estimativas palestinas, 70% das famílias palestinas tiveram um ou mais membros condenados a penas de prisão em prisões israelenses como resultado de atividades contra a ocupação.

De acordo com a B'Tselem, houve um declínio, a partir de 1998, no número de palestinos mantidos em detenção administrativa. Menos de 20 foram mantidos de 1999 a outubro de 2001. No entanto, com o início da Segunda Intifada (2000), e particularmente após a Operação Escudo Defensivo (2002), os números aumentaram constantemente. Segundo a Fédération Internationale des ligues des Droits de l'Homme (FIDH), do início da Segunda Intifada a abril de 2003, mais de 28 000 palestinos foram encarcerados. Somente em abril de 2003, houve mais de 5 500 prisões.

Em 2007, o número de palestinos sob detenção administrativa era em média de cerca de 830 por mês, incluindo mulheres e menores de 18 anos. Em março de 2008, mais de 8 400 palestinos eram mantidos pelas autoridades civis e militares israelenses, dos quais 5 148 cumpriam pena, 2 167 enfrentavam processos judiciais e 790 estavam sob detenção administrativa, muitas vezes sem acusação ou conhecimento das suspeitas contra eles. Em 2010, o Palestinian Central Bureau of Statistics relatou que havia "mais de 7 000" palestinos em prisões israelenses, 264 deles sob detenção administrativa. A maioria dos prisioneiros é mantida na na Cisjordânia e nas prisões de Megiddo e em Israel.

Em abril de 2008, a , Centro Jurídico para os Direitos da Minoria Árabe em Israel, afirmou que 11 000 palestinos estavam em prisão e detenção em Israel, incluindo 98 mulheres, 345 menores, 50 membros do Conselho Legislativo da Palestina e 3 ministros da Autoridade Nacional Palestiniana. Destes 11 000 prisioneiros palestinos, 8 456 eram da Cisjordânia, 762 da Faixa de Gaza e 694 de dentro de Israel propriamente dito (incluindo 552 de Jerusalém). Em outubro de 2008, o Haaretz relatou que 600 palestinos estavam sendo mantidos em detenção administrativa em Israel, incluindo "cerca de 15 menores que nem sabem por que estão sendo detidos".

Em maio de 2020, havia 4 236 prisioneiros de segurança palestinos em prisões israelenses, incluindo 352 mantidos em detenção administrativa, ou seja, encarceramento sem acusação. Já em abril de 2022, havia 4 450 prisioneiros de segurança palestinos em prisões israelenses – incluindo 160 crianças, 32 mulheres e 530 "detidos administrativos" (encarcerados sem acusação).

Desde o ataque do Hamas a Israel em 2023, Israel revogou permissões de trabalho para residentes de Gaza. Desde então, entre 4 000 e 5 000 palestinos que trabalhavam em Israel e tentavam fugir desapareceram, tendo sido detidos pelo governo israelense. Palestinos libertados relataram terem sido vendados com mãos e pés amarrados e depois espancados pelas forças israelenses, que retiveram comida, água e suprimentos médicos.

Menores Entre 2000 e 2009, 6 700 palestinos entre 12 e 18 anos foram presos pelas autoridades israelenses, de acordo com a seção palestina da (DCI/PS). Em 2009, um total de 423 estava sendo mantido em centros de detenção e interrogatório e prisões israelenses. Em abril de 2010, o número caiu para 280. A DCI/PS afirma que essas detenções violam o direito internacional. Até agosto de 2013, 193 menores estavam presos, e segundo o The Economist, "quase todos" foram "levados ao tribunal com grilhões nas pernas e algemas".

A Al Jazeera relatou que entre 2000 e 2023, 12 000 crianças foram detidas pelas forças israelenses. Em 2023, pelo menos 880 crianças palestinas foram detidas pelo FDI.

Figuras públicas thumb|direita|Marwan Barghouti, líder da milícia Brigadas dos Mártires de Al-Aqsa, condenado por tribunal israelense por cinco acusações de assassinato e sentenciado a cinco prisões perpétuas e quarenta anos de prisão. Há vários líderes e políticos palestinos detidos em prisões israelenses, incluindo 47 membros do Hamas no Conselho Legislativo da Palestina, além de alguns ministros e prefeitos e membros de conselhos municipais de várias cidades e vilas na Cisjordânia.

Marwan Barghouti, líder da milícia Brigadas dos Mártires de Al-Aqsa e do partido político , foi preso e julgado por um tribunal civil israelense por ataques realizados pelas Brigadas dos Mártires de Al-Aqsa. Ele foi condenado em 20 de maio de 2004 por cinco acusações de assassinato e sentenciado a cinco prisões perpétuas e quarenta anos.