William Howard Stein (Nova Iorque, — Nova Iorque, ) foi um bioquímico estadunidense.
Conjuntamente com Stanford Moore, foi agraciado com o Nobel de Química de 1972 "pela sua contribuição para a compreensão da relação entre a estrutura química e a atividade catalítica do sítio ativo da molécula de ribonuclease".
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