A Guerra de Independência da Bolívia (, 1809–1825) começou com o estabelecimento de juntas governamentais em Sucre e La Paz, após a Revolução de Chuquisaca e a Revolução de La Paz. Essas juntas foram derrotadas logo depois, e as cidades caíram novamente sob controle espanhol. A Revolução de Maio de 1810 depôs o vice-rei de Buenos Aires, que estabeleceu sua própria junta. Buenos Aires enviou três grandes expedições militares ao Alto Peru, lideradas por Juan José Castelli, Manuel Belgrano e José Rondeau, mas os monarquistas acabaram prevalecendo sobre cada uma delas. No entanto, o conflito evoluiu para uma guerra de guerrilha, a Guerra das Republiquetas, impedindo os monarquistas de fortalecer sua presença. Depois que Simón Bolívar e Antonio José de Sucre derrotaram os monarquistas no norte da América do Sul, Sucre liderou uma campanha que derrotaria os monarquistas em Charcas para sempre, quando o último general monarquista, Pedro Antonio Olañeta, sofreu morte e derrota nas mãos de seus próprios forças desertaram na Batalha de Tumusla. A independência da Bolívia foi proclamada em 6 de agosto de 1825.

O poder governante colonial e as causas da guerra Charcas (atual Bolívia) também é algumas vezes chamada de Alto Peru. Esta região caiu sob a autoridade do domínio colonial espanhol no século XVI. Foi originalmente colocado diretamente sob o governo do Vice-Reino do Peru, no entanto, esta localização provou ser muito distante para um controle efetivo, então Filipe II estabeleceu a Audiência de Charcas, que era um órgão governamental autônomo sob a tutela do vice-rei do Peru. Este governo era composto por oidores ou juízes e um governador com o título de presidente da Audiência. A Audiencia recebeu autoridade para tomar decisões finais quando um vice-rei não estava disponível ou estava ausente.

A Audiencia estava centrada em Chuquisaca, que começou como uma comunidade indígena e mais tarde ficou conhecida pelo seu nome pós-independência, Sucre. Este era o centro administrativo e também de atividades culturais de Charcas. O Arcebispo de Charcas viveu lá e uma das universidades mais importantes da Bolívia foi fundada lá. A Audiência foi uma grande honra para os Charcas. Os Oidores vinham principalmente da Espanha e tendiam a ser muito orgulhosos, muitas vezes fazendo com que todos se curvassem diante deles. Eles também eram incrivelmente ignorantes sobre as necessidades e problemas do povo. À medida que os assentamentos espanhóis se expandiam para o sul, a jurisdição da Audiência de Charcas cresceu para incluir não apenas a atual Bolívia, mas também Argentina, Uruguai, Paraguai e até mesmo partes do Peru. Em 1776, a Audiência de Charcas foi colocada sob a autoridade do vice-rei de Buenos Aires no recém-criado Vice-Reino do Rio da Prata e a maior parte do comércio foi redirecionada para Buenos Aires. Essa mudança foi contra os desejos peruanos, pois eles queriam manter Charcas por sua enorme riqueza nas minas de Potosí. Nas décadas seguintes, a questão dos laços políticos e económicos com Charcas foi constantemente disputada pelo Peru e pelo Rio da Prata. Em 25 de maio de 1809, os cidadãos de Sucre participaram do primeiro levante que fez parte do início da guerra de independência na Bolívia.

Em 1784, os governantes espanhóis criaram o sistema de intendência. Quatro intendências principais foram construídas em La Paz, Cochabamba, Potosí e Chuquisaca. Esse sistema dava autoridade a alguns homens habilidosos e educados que eram diretamente responsáveis perante o Rei da Espanha. Este sistema foi implementado para aumentar as receitas, bem como para pôr fim a problemas específicos que resultaram do mau uso do poder por outras autoridades. O sistema limitou consequentemente o poder da Audiencia.

O povo boliviano foi dividido em três categorias principais: crioulos, mestiços e a população indígena. Com autoridade sobre todas essas pessoas estavam os Peninsulares, pessoas influentes que tinham vindo da Espanha para assumir uma posição de liderança na igreja ou no governo, em uma das colônias espanholas. Todo o resto do povo boliviano tinha um status social abaixo dessa classe de elite. Os crioulos eram pessoas de ascendência espanhola pura que nasceram na América Latina. Os crioulos tinham inveja do poder que os peninsulares detinham, e essa atitude fez parte da base da Guerra da Independência. Abaixo dos crioulos na hierarquia social estavam os mestiços, que eram uma mistura de ascendência espanhola e indígena. A principal razão pela qual esses dois povos se misturaram foi a falta de mulheres espanholas na região. Finalmente, na base da hierarquia estava a maior classe social, os povos indígenas, que falavam principalmente aimará e quíchua. Essas pessoas muitas vezes não sabiam o que estava acontecendo politicamente no país. No entanto, eles ofereceram uma grande força de combatentes tanto para os patriotas quanto para os monarquistas na guerra. No entanto, na Guerra da Independência, eles mostraram-se muito imprevisíveis e, por vezes, voltavam-se contra o exército a qualquer provocação. Essas pessoas geralmente lutavam por quem controlava aquela área, fossem eles legalistas, patriotas ou monarquistas. Na maioria das vezes, eram as Republiquetas que controlavam as áreas rurais onde os nativos viviam. Embora lutassem por quem quer que fosse, essas pessoas favoreciam os patriotas porque eles eram em parte nativos, enquanto os outros exércitos eram de ascendência puramente espanhola. A real intenção dos povos indígenas era restabelecer o império inca e, por isso, eles queriam uma forma de governo diferente de todos os outros três grupos. Todos esses grupos lutaram pela ajuda dos nativos para vencer a guerra; no entanto, nenhum exército pensou em libertar essas pessoas.

A independência não era uma ideia nova na mente do povo dos Charcas. Esse conceito já havia começado a criar raízes muito antes e já começavam a aparecer sinais de descontentamento com a atual forma de governo. Indivíduos de todas as classes da população boliviana ficaram insatisfeitos — os crioulos, os mestiços e também os indígenas. Todos estavam sentindo os efeitos do aumento dos impostos espanhóis e das restrições comerciais. As rebeliões indígenas começaram em 1730 em Cochabamba e outras se seguiram nas décadas seguintes. Embora a maioria das pessoas estivesse infeliz, as diferentes classes sociais não estavam unificadas na solução do dilema. Os povos indígenas queriam acabar com todos os espanhóis e criar uma utopia andina, enquanto os crioulos desejavam simplesmente mais liberdade em relação à Espanha. Como os crioulos tinham preconceito racial contra a população nativa, esses dois grupos de pessoas não se uniram contra a Espanha.

Muitas ideias revolucionárias se espalharam a partir da universidade em Chuquisaca. No início da década de 1780, diferentes estudantes da universidade distribuíram panfletos em Charcas. Estas foram escritas contra a autoridade espanhola e nelas até mesmo os funcionários públicos eram chamados de ladrões. As ideias de independência realmente surgiram de Aquino, um pai da igreja, que escreveu sobre política. Ele ensinou que se um governante é cruel e tirânico, o povo tem o direito de se rebelar e lutar contra seu próprio governo. O governante deve estar sob o Papa, assim o povo pode se rebelar contra o Rei, mas não contra Deus. Não havia um líder principal dos revolucionários ou radicais. No entanto, três homens principais foram influentes neste círculo: Jaime Zudañez, Manuel Zudañez e Bernardo Monteagudo. Jaime Zudañez fez parte da Audiência no departamento de defesa dos pobres. Ele tentava influenciar as decisões da Audiência e ninguém suspeitava de seu comportamento traiçoeiro. Manuel Zudeñez, seu irmão, também estava no governo e ocupou um cargo importante na universidade em Chuquisaca. Por fim, Bernardo Monteagudo era um escritor de família pobre, mas que teve impacto nas pessoas por meio de suas campanhas de boatos. Todos estes três homens eram a favor da eliminação do presidente, Ramón García León de Pizarro.

Juntas de 1809

Durante a Guerra Peninsular que ocorreu na Espanha, Charcas (hoje Bolívia) acompanhou de perto os relatórios que chegavam descrevendo a rápida evolução da situação política na Espanha, o que levou a Península quase à anarquia. A sensação de incerteza foi agravada pelo facto de as notícias do motim de Aranjuez, em 17 de Março, e da abdicação de Fernando VII, em 6 de Maio de 1808, a favor de José Bonaparte, terem chegado com um intervalo de um mês, em 21 de Agosto e 17 de Setembro, respectivamente. Na confusão que se seguiu, várias juntas na Espanha e a princesa portuguesa Carlota, irmã de Fernando VII, no Brasil, reivindicaram autoridade sobre as Américas.

Em 11 de novembro, o representante da Junta de Sevilha, José Manuel de Goyeneche, chegou a Chuquisaca, depois de passar por Buenos Aires, com instruções para garantir o reconhecimento de Charcas da autoridade da Junta de Sevilha. Ele também trouxe consigo uma carta da Princesa Carlotta solicitando o reconhecimento de seu direito de governar na ausência de seu irmão. O presidente-intendente Ramón García León de Pizarro, apoiado pelo arcebispo de Chuquisaca Benito María de Moxó y Francolí, estava inclinado a reconhecer a Junta de Sevilha, mas a Audiencia maioritariamente peninsular de Charcas, na sua função de conselho privado do Presidente (o verdadeiro acuerdo), sentiu que seria precipitado reconhecer qualquer um deles. Quase houve uma briga entre o oidor sênior e Goyeneche sobre o assunto, mas a opinião dos oidores prevaleceu. Os radicais ou revolucionários apoiaram a decisão da Audiencia porque colocava mais poder nas mãos do povo da América Latina, bem como porque era uma separação "temporária" com a Espanha durante este período de tribulação na terra da Espanha. Nas semanas seguintes, García León e Moxó convenceram-se de que reconhecer Carlota poderia ser a melhor forma de preservar a unidade do império, mas isso era impopular entre a maioria dos Charcasvianos e a Audiencia. O Presidente e o Arcebispo tornaram-se muito impopulares entre os oidores porque o arcebispo informava o povo sobre todas as notícias que chegavam da Espanha. A Audiencia queria esconder a informação para não reconhecer suas próprias fraquezas. Durante este período a Igreja Católica em Charcas separou-se da "Audiencia" devido à tensão entre Moxó e os Oidores. miniaturadaimagem|100 anos de luta pela independência: 25 de maio de 1809 em selo comemorativo Em 26 de maio de 1809, os oidores da Audiencia receberam rumores de que García León de Pizarro planejava prendê-los para reconhecer Carlota. A Audiência decidiu que a situação havia se tornado tão anárquica tanto em Charcas quanto na Península, que Charcas precisava tomar o governo em suas próprias mãos. Ela removeu García León de Pizarro do cargo e se transformou em uma junta, que governou em nome de Fernando, assim como cidades e províncias haviam feito na Espanha um ano antes. Uma segunda junta foi estabelecida em La Paz em 16 de julho pelos crioulos, que assumiram o quartel local e depuseram o intendente e o bispo de La Paz. A junta de La Paz rompeu claramente com qualquer autoridade em Espanha e com as autoridades de Buenos Aires. José de la Serna, o vice-rei espanhol em Lima, enviou cinco mil soldados liderados por ninguém menos que Goyeneche, que havia se tornado presidente da Audiencia em Cusco. Os rebeldes foram derrotados e os líderes do movimento foram enforcados ou condenados à prisão perpétua. A Audiência teve que implorar por misericórdia e fazer um acordo com os monarquistas para que a cidade de Chuquisaca não fosse deixada em ruínas pelo exército. Esta rebelião foi travada, mas o anseio pela liberdade estava longe de ser extinto. Depois que Buenos Aires estabeleceu com sucesso uma junta em maio de 1810, Charcas ficou sob o controle do Vice-Reino do Peru e conseguiu repelir várias tentativas de tomá-lo militarmente.